Protein–RNA interactions for Protein: Q5SVD5

Vmn1r196, Vomeronasal type-1 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 301 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r196Q5SVD5 Cdk3-ps-202ENSMUST00000174177 915 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Vmn1r196Q5SVD5 Gm8494-201ENSMUST00000178171 1233 ntBASIC11.17□□□□□ -0.62
Vmn1r196Q5SVD5 Gm27390-201ENSMUST00000184516 176 ntBASIC11.17□□□□□ -0.62
Vmn1r196Q5SVD5 Gm28882-201ENSMUST00000185504 314 ntBASIC11.17□□□□□ -0.62
Vmn1r196Q5SVD5 Gm28379-201ENSMUST00000186450 554 ntTSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Vmn1r196Q5SVD5 Tnfrsf4-201ENSMUST00000030952 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Vmn1r196Q5SVD5 1700028J19Rik-201ENSMUST00000037220 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Vmn1r196Q5SVD5 Olfr1209-201ENSMUST00000099809 933 ntAPPRIS P1 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Vmn1r196Q5SVD5 Cep41-203ENSMUST00000115131 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Vmn1r196Q5SVD5 Hdac5-201ENSMUST00000008999 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Vmn1r196Q5SVD5 Pcif1-201ENSMUST00000041643 5772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Vmn1r196Q5SVD5 Nfya-212ENSMUST00000162460 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Vmn1r196Q5SVD5 BC055324-202ENSMUST00000097493 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Vmn1r196Q5SVD5 Atp6v1b1-201ENSMUST00000006431 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Vmn1r196Q5SVD5 Mapk8ip3-204ENSMUST00000117509 5418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Vmn1r196Q5SVD5 Gm18227-201ENSMUST00000211082 1468 ntBASIC11.17□□□□□ -0.62
Vmn1r196Q5SVD5 Slc33a1-201ENSMUST00000029402 3150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Vmn1r196Q5SVD5 Sorcs1-205ENSMUST00000209413 4398 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Vmn1r196Q5SVD5 Cdk13-207ENSMUST00000223490 12548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Vmn1r196Q5SVD5 C130026I21Rik-202ENSMUST00000093506 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Vmn1r196Q5SVD5 2810407A14Rik-201ENSMUST00000069809 1699 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Vmn1r196Q5SVD5 Frmd8-201ENSMUST00000025728 4504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Vmn1r196Q5SVD5 Fxr1-204ENSMUST00000197694 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Vmn1r196Q5SVD5 Esam-201ENSMUST00000002011 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Vmn1r196Q5SVD5 Sertad2-201ENSMUST00000093292 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Vmn1r196Q5SVD5 Tmem266-202ENSMUST00000085754 4417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Vmn1r196Q5SVD5 D630014O11Rik-201ENSMUST00000160562 3019 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Vmn1r196Q5SVD5 Dnmbp-201ENSMUST00000026209 4882 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Vmn1r196Q5SVD5 Strc-201ENSMUST00000038389 5756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Vmn1r196Q5SVD5 Olfml3-201ENSMUST00000029440 5465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Vmn1r196Q5SVD5 Chrdl1-202ENSMUST00000074660 4096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Vmn1r196Q5SVD5 Ralgps2-211ENSMUST00000190648 2498 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Vmn1r196Q5SVD5 Phf24-202ENSMUST00000107975 6494 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Vmn1r196Q5SVD5 Gm43051-201ENSMUST00000201096 2678 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
Vmn1r196Q5SVD5 Mgll-207ENSMUST00000163271 3991 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Vmn1r196Q5SVD5 Gm8862-201ENSMUST00000198379 1346 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
Vmn1r196Q5SVD5 Ctdspl2-201ENSMUST00000036647 5053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Vmn1r196Q5SVD5 Ric3-201ENSMUST00000055993 5281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Vmn1r196Q5SVD5 Adcyap1r1-203ENSMUST00000165786 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Vmn1r196Q5SVD5 Txndc5-203ENSMUST00000160653 2586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Vmn1r196Q5SVD5 AC126262.1-201ENSMUST00000221802 1904 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
Vmn1r196Q5SVD5 Spsb1-202ENSMUST00000105684 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Vmn1r196Q5SVD5 Cdc26-202ENSMUST00000107459 654 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Vmn1r196Q5SVD5 Rhox2g-201ENSMUST00000115169 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Vmn1r196Q5SVD5 Mxd1-201ENSMUST00000001184 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Vmn1r196Q5SVD5 Gm9083-201ENSMUST00000120423 819 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
Vmn1r196Q5SVD5 Gm15395-201ENSMUST00000153724 702 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Vmn1r196Q5SVD5 Ighv1-62-201ENSMUST00000193406 350 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
Vmn1r196Q5SVD5 Snhg8-203ENSMUST00000199645 528 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Vmn1r196Q5SVD5 Gm2420-203ENSMUST00000202748 447 ntTSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Vmn1r196Q5SVD5 Hspb2-202ENSMUST00000217159 552 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Vmn1r196Q5SVD5 Ccs-201ENSMUST00000037246 1057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Vmn1r196Q5SVD5 Asphd1-201ENSMUST00000052937 730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Vmn1r196Q5SVD5 Isoc2b-201ENSMUST00000064547 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Vmn1r196Q5SVD5 Rapgef3-203ENSMUST00000126854 4005 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Vmn1r196Q5SVD5 Grm1-203ENSMUST00000105561 4435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Vmn1r196Q5SVD5 Arfgap1-204ENSMUST00000108861 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Vmn1r196Q5SVD5 Ndrg2-201ENSMUST00000004673 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Vmn1r196Q5SVD5 Prkar1b-202ENSMUST00000110889 2457 ntTSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Vmn1r196Q5SVD5 Rtl5-204ENSMUST00000188731 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Vmn1r196Q5SVD5 Dnaic2-201ENSMUST00000069325 2874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Vmn1r196Q5SVD5 Ankrd35-201ENSMUST00000048427 4052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Vmn1r196Q5SVD5 Zfp12-203ENSMUST00000077485 4294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Vmn1r196Q5SVD5 Adamts1-201ENSMUST00000023610 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Vmn1r196Q5SVD5 Slc9b1-201ENSMUST00000078568 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Vmn1r196Q5SVD5 Gm1995-201ENSMUST00000220838 2602 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
Vmn1r196Q5SVD5 Lnx1-204ENSMUST00000117388 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Vmn1r196Q5SVD5 Fen1-203ENSMUST00000142241 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Vmn1r196Q5SVD5 Qrich2-201ENSMUST00000093909 2156 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Vmn1r196Q5SVD5 Thrb-203ENSMUST00000091471 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Vmn1r196Q5SVD5 Lhx6-201ENSMUST00000112960 3345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Vmn1r196Q5SVD5 Abcc10-201ENSMUST00000047970 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Vmn1r196Q5SVD5 Zfp1-203ENSMUST00000212072 1930 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Vmn1r196Q5SVD5 Polm-202ENSMUST00000109837 2697 ntTSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Vmn1r196Q5SVD5 1520401A03Rik-205ENSMUST00000201734 2660 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Vmn1r196Q5SVD5 Slc44a4-201ENSMUST00000007249 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Vmn1r196Q5SVD5 Zfp429-201ENSMUST00000109732 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Vmn1r196Q5SVD5 Fbxl12-201ENSMUST00000086458 2056 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Vmn1r196Q5SVD5 Fbxl12-202ENSMUST00000086459 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Vmn1r196Q5SVD5 Mettl27-201ENSMUST00000047196 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Vmn1r196Q5SVD5 Cacnb2-203ENSMUST00000114723 3945 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Vmn1r196Q5SVD5 Gm44929-202ENSMUST00000209134 1653 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Vmn1r196Q5SVD5 Rabep2-202ENSMUST00000106407 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Vmn1r196Q5SVD5 Myo7a-213ENSMUST00000205746 6689 ntTSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Vmn1r196Q5SVD5 Aldoa-203ENSMUST00000106348 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Vmn1r196Q5SVD5 Klhl8-202ENSMUST00000112811 2577 ntTSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Vmn1r196Q5SVD5 Grid2ip-201ENSMUST00000010969 3459 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Vmn1r196Q5SVD5 Gck-203ENSMUST00000109823 2361 ntTSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Vmn1r196Q5SVD5 Oxnad1-201ENSMUST00000022462 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Vmn1r196Q5SVD5 Mbnl2-204ENSMUST00000227012 2390 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
Vmn1r196Q5SVD5 Lrp2-203ENSMUST00000100051 4359 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Vmn1r196Q5SVD5 Retn-201ENSMUST00000012849 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Vmn1r196Q5SVD5 Sncb-202ENSMUST00000134110 722 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Vmn1r196Q5SVD5 Gm16339-201ENSMUST00000160954 929 ntTSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Vmn1r196Q5SVD5 Tmbim6-206ENSMUST00000161250 1148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Vmn1r196Q5SVD5 Stard10-207ENSMUST00000173270 670 ntTSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Vmn1r196Q5SVD5 Gm3096-201ENSMUST00000185770 364 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
Vmn1r196Q5SVD5 Gm5441-202ENSMUST00000190132 449 ntTSL 2 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Vmn1r196Q5SVD5 Ip6k2-204ENSMUST00000192307 1191 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Vmn1r196Q5SVD5 Pcbd1-201ENSMUST00000020298 789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 383 ms