Protein–RNA interactions for Protein: Q5SSN7

Sft2d1, Vesicle transport protein SFT2A, mousemouse

Predictions only

Length 159 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sft2d1Q5SSN7 Tnfrsf9-205ENSMUST00000116257 2115 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
Sft2d1Q5SSN7 Gm13383-201ENSMUST00000131190 1171 ntTSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
Sft2d1Q5SSN7 9530003J23Rik-202ENSMUST00000159193 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
Sft2d1Q5SSN7 Fcrl1-204ENSMUST00000191666 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
Sft2d1Q5SSN7 Ftl1-ps1-202ENSMUST00000222435 938 ntAPPRIS P1 BASIC9.93□□□□□ -0.82
Sft2d1Q5SSN7 Gm2270-201ENSMUST00000222858 797 ntTSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
Sft2d1Q5SSN7 Pecr-201ENSMUST00000027381 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
Sft2d1Q5SSN7 Tgif2-ps2-201ENSMUST00000061746 711 ntBASIC9.93□□□□□ -0.82
Sft2d1Q5SSN7 Myl3-201ENSMUST00000079784 937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
Sft2d1Q5SSN7 Otof-201ENSMUST00000074171 7129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
Sft2d1Q5SSN7 Cbx7-203ENSMUST00000109616 2899 ntTSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
Sft2d1Q5SSN7 BC052040-203ENSMUST00000166472 2770 ntTSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
Sft2d1Q5SSN7 Gm26640-201ENSMUST00000180809 3524 ntTSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
Sft2d1Q5SSN7 Acadl-201ENSMUST00000027153 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
Sft2d1Q5SSN7 Lgsn-201ENSMUST00000062560 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
Sft2d1Q5SSN7 Rpap1-202ENSMUST00000099529 4813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
Sft2d1Q5SSN7 Morf4l2-204ENSMUST00000113097 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
Sft2d1Q5SSN7 9330111N05Rik-203ENSMUST00000181508 1848 ntTSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
Sft2d1Q5SSN7 Nol6-201ENSMUST00000030138 4599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
Sft2d1Q5SSN7 Stx1b-201ENSMUST00000106267 4536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
Sft2d1Q5SSN7 Gm44929-202ENSMUST00000209134 1653 ntTSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
Sft2d1Q5SSN7 Magee1-201ENSMUST00000033578 3550 ntAPPRIS P1 BASIC9.93□□□□□ -0.82
Sft2d1Q5SSN7 Pla2g4a-201ENSMUST00000070200 2856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
Sft2d1Q5SSN7 Sptan1-204ENSMUST00000113717 7958 ntTSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
Sft2d1Q5SSN7 Sgpp2-201ENSMUST00000036172 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
Sft2d1Q5SSN7 E030013I19Rik-201ENSMUST00000148089 2754 ntTSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
Sft2d1Q5SSN7 Tcp11l2-201ENSMUST00000020223 2725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
Sft2d1Q5SSN7 Myo15-203ENSMUST00000094135 11715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.92□□□□□ -0.82
Sft2d1Q5SSN7 Celf1-204ENSMUST00000111448 4432 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.92□□□□□ -0.82
Sft2d1Q5SSN7 Treh-201ENSMUST00000034609 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
Sft2d1Q5SSN7 Sox13-203ENSMUST00000144386 3179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
Sft2d1Q5SSN7 Tcp10a-202ENSMUST00000128533 2589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
Sft2d1Q5SSN7 Tmem92-203ENSMUST00000162809 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
Sft2d1Q5SSN7 Tbc1d24-209ENSMUST00000201301 4261 ntTSL 5 BASIC9.92□□□□□ -0.82
Sft2d1Q5SSN7 Gm45449-201ENSMUST00000211485 1960 ntTSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
Sft2d1Q5SSN7 Creld2-201ENSMUST00000024042 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
Sft2d1Q5SSN7 Tmub2-201ENSMUST00000036376 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
Sft2d1Q5SSN7 Rasgrp4-212ENSMUST00000204194 2993 ntTSL 5 BASIC9.92□□□□□ -0.82
Sft2d1Q5SSN7 Gm21319-201ENSMUST00000164517 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
Sft2d1Q5SSN7 Arpp21-223ENSMUST00000162097 3952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.92□□□□□ -0.82
Sft2d1Q5SSN7 Mirg-202ENSMUST00000181543 1300 ntTSL 5 BASIC9.92□□□□□ -0.82
Sft2d1Q5SSN7 Atat1-203ENSMUST00000077494 1340 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
Sft2d1Q5SSN7 Eng-201ENSMUST00000009705 3422 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
Sft2d1Q5SSN7 Tef-202ENSMUST00000109553 4401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
Sft2d1Q5SSN7 Papln-202ENSMUST00000121733 4373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
Sft2d1Q5SSN7 Rdm1-201ENSMUST00000010506 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
Sft2d1Q5SSN7 Snap47-202ENSMUST00000120940 1192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
Sft2d1Q5SSN7 Rpl17-ps5-201ENSMUST00000121001 555 ntBASIC9.92□□□□□ -0.82
Sft2d1Q5SSN7 Gm14064-201ENSMUST00000134833 727 ntTSL 3 BASIC9.92□□□□□ -0.82
Sft2d1Q5SSN7 Gm15384-201ENSMUST00000138832 486 ntTSL 5 BASIC9.92□□□□□ -0.82
Sft2d1Q5SSN7 Ndufa2-201ENSMUST00000014438 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
Sft2d1Q5SSN7 Abhd14a-202ENSMUST00000171678 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
Sft2d1Q5SSN7 Gm27230-202ENSMUST00000184671 857 ntTSL 3 BASIC9.92□□□□□ -0.82
Sft2d1Q5SSN7 Gm27321-201ENSMUST00000185021 205 ntBASIC9.92□□□□□ -0.82
Sft2d1Q5SSN7 Tmem179-202ENSMUST00000222836 521 ntTSL 5 BASIC9.92□□□□□ -0.82
Sft2d1Q5SSN7 Rsph1-201ENSMUST00000024832 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
Sft2d1Q5SSN7 Mgst3-201ENSMUST00000028005 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
Sft2d1Q5SSN7 Gm16958-201ENSMUST00000180603 1765 ntTSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
Sft2d1Q5SSN7 Srr-201ENSMUST00000065211 3699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
Sft2d1Q5SSN7 Gm8334-201ENSMUST00000112755 1662 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.92□□□□□ -0.82
Sft2d1Q5SSN7 Zfp61-208ENSMUST00000165241 1668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.92□□□□□ -0.82
Sft2d1Q5SSN7 Gm36235-201ENSMUST00000223158 1694 ntTSL 5 BASIC9.92□□□□□ -0.82
Sft2d1Q5SSN7 Usp2-203ENSMUST00000114830 2122 ntTSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
Sft2d1Q5SSN7 Pex3-201ENSMUST00000019945 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
Sft2d1Q5SSN7 Gm26631-201ENSMUST00000181462 2505 ntTSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
Sft2d1Q5SSN7 Pck2-201ENSMUST00000048781 3400 ntTSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
Sft2d1Q5SSN7 Mcm2-201ENSMUST00000058011 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
Sft2d1Q5SSN7 Scmh1-201ENSMUST00000000087 3353 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
Sft2d1Q5SSN7 Zfp462-202ENSMUST00000079605 4684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.92□□□□□ -0.82
Sft2d1Q5SSN7 Tmeff2-201ENSMUST00000081851 3343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
Sft2d1Q5SSN7 Plekha6-204ENSMUST00000187285 5040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.92□□□□□ -0.82
Sft2d1Q5SSN7 Bcl11a-204ENSMUST00000118955 1505 ntTSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
Sft2d1Q5SSN7 Gm9361-201ENSMUST00000198695 1507 ntBASIC9.92□□□□□ -0.82
Sft2d1Q5SSN7 Klhl6-201ENSMUST00000058839 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
Sft2d1Q5SSN7 Kcnh5-201ENSMUST00000042299 4058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
Sft2d1Q5SSN7 Siglech-206ENSMUST00000171077 1934 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.92□□□□□ -0.82
Sft2d1Q5SSN7 Emp1-202ENSMUST00000111907 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
Sft2d1Q5SSN7 Nectin4-201ENSMUST00000006578 3636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
Sft2d1Q5SSN7 Atp1a3-201ENSMUST00000080882 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
Sft2d1Q5SSN7 Tcn2-201ENSMUST00000020710 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.91□□□□□ -0.82
Sft2d1Q5SSN7 AI854703-201ENSMUST00000095938 3517 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.91□□□□□ -0.82
Sft2d1Q5SSN7 Gpc6-202ENSMUST00000088483 3488 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.91□□□□□ -0.82
Sft2d1Q5SSN7 Igtp-203ENSMUST00000168280 1832 ntTSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
Sft2d1Q5SSN7 Rasgrp4-210ENSMUST00000203070 3008 ntTSL 5 BASIC9.91□□□□□ -0.82
Sft2d1Q5SSN7 Tfr2-208ENSMUST00000199054 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
Sft2d1Q5SSN7 Tie1-201ENSMUST00000047421 4091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
Sft2d1Q5SSN7 Tpra1-218ENSMUST00000203185 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.91□□□□□ -0.82
Sft2d1Q5SSN7 Hmox2-201ENSMUST00000004172 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
Sft2d1Q5SSN7 Gm17281-201ENSMUST00000180732 3589 ntTSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
Sft2d1Q5SSN7 Btbd9-202ENSMUST00000168787 6857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
Sft2d1Q5SSN7 Myh8-201ENSMUST00000019625 6149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
Sft2d1Q5SSN7 Zswim9-203ENSMUST00000119558 3111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.91□□□□□ -0.82
Sft2d1Q5SSN7 Gm28035-201ENSMUST00000139454 4238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.91□□□□□ -0.82
Sft2d1Q5SSN7 Ank1-204ENSMUST00000117270 5652 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.91□□□□□ -0.82
Sft2d1Q5SSN7 Hpcal4-201ENSMUST00000059667 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
Sft2d1Q5SSN7 Selenoh-202ENSMUST00000102647 654 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
Sft2d1Q5SSN7 Ern1-202ENSMUST00000106799 660 ntTSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
Sft2d1Q5SSN7 Smad7-204ENSMUST00000174411 769 ntTSL 5 BASIC9.91□□□□□ -0.82
Sft2d1Q5SSN7 Tac2-202ENSMUST00000179960 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
Sft2d1Q5SSN7 Lsmem2-201ENSMUST00000191791 369 ntTSL 3 BASIC9.91□□□□□ -0.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.6 ms