Protein–RNA interactions for Protein: Q5NCF2

Trappc1, Trafficking protein particle complex subunit 1, mousemouse

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Length 145 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc1Q5NCF2 Gm9742-201ENSMUST00000165220 1553 ntTSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
Trappc1Q5NCF2 AC096628.2-201ENSMUST00000225443 1413 ntBASIC8.75□□□□□ -1.01
Trappc1Q5NCF2 Mms19-201ENSMUST00000026168 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.75□□□□□ -1.01
Trappc1Q5NCF2 Bpgm-201ENSMUST00000045372 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
Trappc1Q5NCF2 Aimp2-202ENSMUST00000100483 1073 ntTSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
Trappc1Q5NCF2 Ifna12-201ENSMUST00000102806 797 ntAPPRIS P1 BASIC8.75□□□□□ -1.01
Trappc1Q5NCF2 Wfdc3-201ENSMUST00000103096 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
Trappc1Q5NCF2 Pgam1-ps2-201ENSMUST00000117129 765 ntBASIC8.75□□□□□ -1.01
Trappc1Q5NCF2 Gm13036-201ENSMUST00000117799 748 ntBASIC8.75□□□□□ -1.01
Trappc1Q5NCF2 Kif16bos-201ENSMUST00000124774 495 ntTSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
Trappc1Q5NCF2 Gm13070-201ENSMUST00000146532 768 ntTSL 5 BASIC8.75□□□□□ -1.01
Trappc1Q5NCF2 Rpl26-206ENSMUST00000167436 606 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
Trappc1Q5NCF2 Gstt1-201ENSMUST00000001713 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
Trappc1Q5NCF2 Gm20444-201ENSMUST00000174014 648 ntTSL 3 BASIC8.75□□□□□ -1.01
Trappc1Q5NCF2 Egfl7-216ENSMUST00000174211 1163 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
Trappc1Q5NCF2 1600014C23Rik-201ENSMUST00000178179 518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
Trappc1Q5NCF2 Gm6376-201ENSMUST00000209407 580 ntBASIC8.75□□□□□ -1.01
Trappc1Q5NCF2 Gm17870-201ENSMUST00000219489 1174 ntBASIC8.75□□□□□ -1.01
Trappc1Q5NCF2 Tmem52-201ENSMUST00000023920 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
Trappc1Q5NCF2 Aimp2-201ENSMUST00000031613 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
Trappc1Q5NCF2 C1qtnf2-201ENSMUST00000057679 1211 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
Trappc1Q5NCF2 Chchd2-201ENSMUST00000094280 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
Trappc1Q5NCF2 Olfr1113-202ENSMUST00000215611 1949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.75□□□□□ -1.01
Trappc1Q5NCF2 Tfr2-207ENSMUST00000198866 3072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
Trappc1Q5NCF2 Shroom2-202ENSMUST00000101141 7494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
Trappc1Q5NCF2 Zmynd8-221ENSMUST00000177633 5093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
Trappc1Q5NCF2 Krt75-201ENSMUST00000042957 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
Trappc1Q5NCF2 Fmod-201ENSMUST00000048183 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
Trappc1Q5NCF2 Hivep1-201ENSMUST00000060148 8753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.75□□□□□ -1.01
Trappc1Q5NCF2 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
Trappc1Q5NCF2 Gm14005-209ENSMUST00000224993 1832 ntBASIC8.75□□□□□ -1.01
Trappc1Q5NCF2 Ahnak2-201ENSMUST00000101010 2821 ntAPPRIS ALT2 BASIC8.75□□□□□ -1.01
Trappc1Q5NCF2 Nr1h3-203ENSMUST00000111355 1672 ntTSL 5 BASIC8.75□□□□□ -1.01
Trappc1Q5NCF2 Cryz-201ENSMUST00000029850 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
Trappc1Q5NCF2 Tmem92-201ENSMUST00000100554 2043 ntTSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
Trappc1Q5NCF2 Emp1-201ENSMUST00000032330 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
Trappc1Q5NCF2 Txndc2-201ENSMUST00000050236 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
Trappc1Q5NCF2 Atp4a-204ENSMUST00000170371 3447 ntTSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
Trappc1Q5NCF2 Vstm2a-202ENSMUST00000109647 1745 ntTSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
Trappc1Q5NCF2 Aqp6-201ENSMUST00000023754 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
Trappc1Q5NCF2 Odf2l-204ENSMUST00000106192 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.74□□□□□ -1.01
Trappc1Q5NCF2 Rsrc2-202ENSMUST00000057795 2270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.74□□□□□ -1.01
Trappc1Q5NCF2 Rad51ap2-201ENSMUST00000124065 3175 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.74□□□□□ -1.01
Trappc1Q5NCF2 Anxa6-201ENSMUST00000102727 2471 ntTSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
Trappc1Q5NCF2 Irf9-202ENSMUST00000130697 2459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
Trappc1Q5NCF2 Zfyve26-201ENSMUST00000021547 9391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
Trappc1Q5NCF2 Kcnip4-207ENSMUST00000176191 2116 ntTSL 5 BASIC8.74□□□□□ -1.01
Trappc1Q5NCF2 Gm8320-201ENSMUST00000177584 1762 ntBASIC8.74□□□□□ -1.01
Trappc1Q5NCF2 Gm8303-201ENSMUST00000178371 1762 ntBASIC8.74□□□□□ -1.01
Trappc1Q5NCF2 Gm8331-201ENSMUST00000178433 1762 ntBASIC8.74□□□□□ -1.01
Trappc1Q5NCF2 4931406P16Rik-202ENSMUST00000108074 6224 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.74□□□□□ -1.01
Trappc1Q5NCF2 Nt5c3b-205ENSMUST00000107399 1427 ntTSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
Trappc1Q5NCF2 Myo18a-201ENSMUST00000000645 7307 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.74□□□□□ -1.01
Trappc1Q5NCF2 Lman1-201ENSMUST00000048260 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
Trappc1Q5NCF2 Mybph-202ENSMUST00000191577 2320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.74□□□□□ -1.01
Trappc1Q5NCF2 Umad1-201ENSMUST00000159168 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
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Trappc1Q5NCF2 Prrxl1-201ENSMUST00000068938 1610 ntTSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
Trappc1Q5NCF2 Ehmt1-205ENSMUST00000114432 4539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.74□□□□□ -1.01
Trappc1Q5NCF2 Smarcc2-201ENSMUST00000026433 4533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
Trappc1Q5NCF2 Sirpa-201ENSMUST00000049262 3644 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
Trappc1Q5NCF2 Gm7336-201ENSMUST00000107041 1232 ntBASIC8.74□□□□□ -1.01
Trappc1Q5NCF2 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.74□□□□□ -1.01
Trappc1Q5NCF2 Il15ra-206ENSMUST00000114834 784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
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Trappc1Q5NCF2 Dlx1as-202ENSMUST00000137251 647 ntTSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
Trappc1Q5NCF2 Tsen15-201ENSMUST00000015124 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
Trappc1Q5NCF2 Gm17455-201ENSMUST00000164428 855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC8.74□□□□□ -1.01
Trappc1Q5NCF2 H2-Bl-204ENSMUST00000184502 862 ntTSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
Trappc1Q5NCF2 Gm29629-201ENSMUST00000187926 386 ntTSL 3 BASIC8.74□□□□□ -1.01
Trappc1Q5NCF2 4930573H18Rik-201ENSMUST00000197696 906 ntTSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
Trappc1Q5NCF2 Mtus2-201ENSMUST00000071878 1211 ntTSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
Trappc1Q5NCF2 S100a7a-201ENSMUST00000079286 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
Trappc1Q5NCF2 Nxpe5-204ENSMUST00000161047 2379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
Trappc1Q5NCF2 Abcd3-201ENSMUST00000029770 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
Trappc1Q5NCF2 Ndufs1-203ENSMUST00000168099 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
Trappc1Q5NCF2 Tnip1-206ENSMUST00000108889 2834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
Trappc1Q5NCF2 Nt5c3b-203ENSMUST00000107397 1348 ntTSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
Trappc1Q5NCF2 Gm7538-201ENSMUST00000200918 1348 ntTSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
Trappc1Q5NCF2 Mtss1l-205ENSMUST00000144041 3225 ntTSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
Trappc1Q5NCF2 Kpna7-202ENSMUST00000110673 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.74□□□□□ -1.01
Trappc1Q5NCF2 Mospd2-203ENSMUST00000112248 2487 ntTSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
Trappc1Q5NCF2 Chmp1b-202ENSMUST00000210564 2490 ntAPPRIS P1 BASIC8.74□□□□□ -1.01
Trappc1Q5NCF2 Gm5320-201ENSMUST00000207163 1519 ntBASIC8.74□□□□□ -1.01
Trappc1Q5NCF2 Dmbx1-203ENSMUST00000124071 4017 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
Trappc1Q5NCF2 Gpr68-201ENSMUST00000053668 3099 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.74□□□□□ -1.01
Trappc1Q5NCF2 Myo1h-210ENSMUST00000202006 4631 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC8.74□□□□□ -1.01
Trappc1Q5NCF2 Sirt2-208ENSMUST00000155327 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.74□□□□□ -1.01
Trappc1Q5NCF2 C130013H08Rik-201ENSMUST00000197569 3692 ntBASIC8.74□□□□□ -1.01
Trappc1Q5NCF2 Tas1r2-202ENSMUST00000166773 2524 ntTSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
Trappc1Q5NCF2 Trpv6-201ENSMUST00000031902 2923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
Trappc1Q5NCF2 Tmed1-201ENSMUST00000034698 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.73□□□□□ -1.01
Trappc1Q5NCF2 Wwp2-201ENSMUST00000166615 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.73□□□□□ -1.01
Trappc1Q5NCF2 Cdk5rap1-203ENSMUST00000109731 2160 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.73□□□□□ -1.01
Trappc1Q5NCF2 March1-207ENSMUST00000110258 2581 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC8.73□□□□□ -1.01
Trappc1Q5NCF2 Son-201ENSMUST00000114036 7945 ntTSL 5 BASIC8.73□□□□□ -1.01
Trappc1Q5NCF2 Susd4-201ENSMUST00000085724 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.73□□□□□ -1.01
Trappc1Q5NCF2 Gm38194-201ENSMUST00000194529 2211 ntBASIC8.73□□□□□ -1.01
Trappc1Q5NCF2 Ip6k2-201ENSMUST00000085018 1846 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.73□□□□□ -1.01
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