Protein–RNA interactions for Protein: Q5DTT3

Fam208b, Protein FAM208B, mousemouse

Predictions only

Length 2,382 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam208bQ5DTT3 Mfrp-201ENSMUST00000034654 4316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Fam208bQ5DTT3 Slc25a21-201ENSMUST00000044634 2609 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Fam208bQ5DTT3 Itgal-201ENSMUST00000106306 5195 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Fam208bQ5DTT3 B4galt3-202ENSMUST00000111313 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Fam208bQ5DTT3 Tmem41b-201ENSMUST00000094097 3840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Fam208bQ5DTT3 Tppp-201ENSMUST00000022057 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Fam208bQ5DTT3 Dgkb-205ENSMUST00000221176 1439 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Fam208bQ5DTT3 Drg2-201ENSMUST00000018568 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Fam208bQ5DTT3 Rbmx2-ps-201ENSMUST00000119377 930 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Fam208bQ5DTT3 Gm12516-201ENSMUST00000120819 385 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Fam208bQ5DTT3 Gm11246-201ENSMUST00000120880 345 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Fam208bQ5DTT3 Gm15856-201ENSMUST00000124853 1162 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Fam208bQ5DTT3 Prss36-208ENSMUST00000156152 1132 ntTSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Fam208bQ5DTT3 Ctdspl-202ENSMUST00000172464 798 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Fam208bQ5DTT3 Sirpa-214ENSMUST00000179001 3812 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Fam208bQ5DTT3 Gm26838-201ENSMUST00000180485 911 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Fam208bQ5DTT3 Gm17798-201ENSMUST00000182282 1035 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Fam208bQ5DTT3 1700020A23Rik-203ENSMUST00000189961 541 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Fam208bQ5DTT3 Gm5100-201ENSMUST00000195631 589 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Fam208bQ5DTT3 Gm44158-201ENSMUST00000203881 505 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Fam208bQ5DTT3 Isg20-206ENSMUST00000205981 834 ntTSL 3 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Fam208bQ5DTT3 Gm18059-201ENSMUST00000208073 580 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Fam208bQ5DTT3 Gm45575-201ENSMUST00000210283 548 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Fam208bQ5DTT3 CT485606.1-201ENSMUST00000213187 878 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Fam208bQ5DTT3 AC118476.3-201ENSMUST00000216419 1219 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Fam208bQ5DTT3 Gm7959-201ENSMUST00000221823 1078 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Fam208bQ5DTT3 Myo1b-201ENSMUST00000018561 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Fam208bQ5DTT3 Gm36500-201ENSMUST00000221821 1626 ntTSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Fam208bQ5DTT3 Camkk1-201ENSMUST00000092937 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Fam208bQ5DTT3 Ky-201ENSMUST00000039390 5837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Fam208bQ5DTT3 Evx1os-201ENSMUST00000125305 2916 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Fam208bQ5DTT3 Gm43045-201ENSMUST00000198725 2095 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Fam208bQ5DTT3 Cacnb4-206ENSMUST00000178799 7981 ntTSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Fam208bQ5DTT3 Ntpcr-202ENSMUST00000065135 1497 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Fam208bQ5DTT3 Gm37859-201ENSMUST00000195529 2173 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Fam208bQ5DTT3 Setdb2-205ENSMUST00000161459 2995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Fam208bQ5DTT3 Rbm4-206ENSMUST00000180248 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Fam208bQ5DTT3 Snap23-202ENSMUST00000110711 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Fam208bQ5DTT3 Aurkc-203ENSMUST00000207711 1320 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Fam208bQ5DTT3 Slc10a1-203ENSMUST00000218342 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Fam208bQ5DTT3 Tbc1d22a-201ENSMUST00000063414 3229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Fam208bQ5DTT3 Etv3-202ENSMUST00000119109 5309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Fam208bQ5DTT3 Efna1-202ENSMUST00000118587 1632 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Fam208bQ5DTT3 Chfr-202ENSMUST00000112519 3159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Fam208bQ5DTT3 Krtap4-9-201ENSMUST00000105059 1059 ntAPPRIS P1 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Fam208bQ5DTT3 Cdc42se1-203ENSMUST00000107200 637 ntTSL 3 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Fam208bQ5DTT3 Akr1b10-202ENSMUST00000115051 1022 ntTSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Fam208bQ5DTT3 Gm13668-201ENSMUST00000119237 1001 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Fam208bQ5DTT3 Gm11836-201ENSMUST00000121022 441 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Fam208bQ5DTT3 Gm15744-201ENSMUST00000161734 213 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Fam208bQ5DTT3 Ighv6-7-201ENSMUST00000193397 357 ntAPPRIS P1 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Fam208bQ5DTT3 Gm44958-201ENSMUST00000203734 736 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Fam208bQ5DTT3 Stt3a-209ENSMUST00000217599 285 ntTSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Fam208bQ5DTT3 Gm3285-201ENSMUST00000218443 908 ntAPPRIS P1 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Fam208bQ5DTT3 AC154257.1-202ENSMUST00000224729 843 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Fam208bQ5DTT3 1700013F07Rik-201ENSMUST00000029485 661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Fam208bQ5DTT3 U2af1l4-201ENSMUST00000043273 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Fam208bQ5DTT3 Krtap4-2-201ENSMUST00000058987 974 ntAPPRIS P1 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Fam208bQ5DTT3 Snrpg-201ENSMUST00000089558 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Fam208bQ5DTT3 Gm5544-201ENSMUST00000098828 891 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Fam208bQ5DTT3 Trp53-202ENSMUST00000108657 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Fam208bQ5DTT3 Wwox-202ENSMUST00000109107 2383 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Fam208bQ5DTT3 Esrrb-202ENSMUST00000110203 2363 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Fam208bQ5DTT3 Clcnkb-201ENSMUST00000006378 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Fam208bQ5DTT3 Ddx42-201ENSMUST00000021046 4011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Fam208bQ5DTT3 Rph3a-201ENSMUST00000079204 4150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Fam208bQ5DTT3 Ecsit-204ENSMUST00000180180 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Fam208bQ5DTT3 Gm45278-201ENSMUST00000209650 2414 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Fam208bQ5DTT3 Ccdc125-201ENSMUST00000057325 2413 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Fam208bQ5DTT3 Sass6-206ENSMUST00000198386 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Fam208bQ5DTT3 Rmi1-201ENSMUST00000042450 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Fam208bQ5DTT3 Arvcf-204ENSMUST00000115613 4800 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Fam208bQ5DTT3 Otud4-203ENSMUST00000173286 7213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Fam208bQ5DTT3 1600014C10Rik-205ENSMUST00000178876 3283 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Fam208bQ5DTT3 Loxl2-202ENSMUST00000100420 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Fam208bQ5DTT3 Eif1ax-201ENSMUST00000087143 5172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Fam208bQ5DTT3 Mir671-201ENSMUST00000102432 98 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Fam208bQ5DTT3 Ins2-204ENSMUST00000105932 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Fam208bQ5DTT3 Gm13609-201ENSMUST00000141023 589 ntTSL 3 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Fam208bQ5DTT3 Gm11379-201ENSMUST00000154678 381 ntTSL 3 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Fam208bQ5DTT3 Vmn1r-ps63-201ENSMUST00000174565 989 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Fam208bQ5DTT3 Rbp2-202ENSMUST00000187905 611 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Fam208bQ5DTT3 4930423D24Rik-202ENSMUST00000219785 554 ntTSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Fam208bQ5DTT3 Ins2-201ENSMUST00000000220 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Fam208bQ5DTT3 Gm46336-201ENSMUST00000221894 279 ntTSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Fam208bQ5DTT3 Ccr4-202ENSMUST00000215425 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Fam208bQ5DTT3 Pou4f3-201ENSMUST00000025374 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Fam208bQ5DTT3 Gtf2ird1-205ENSMUST00000100654 3156 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Fam208bQ5DTT3 Car14-201ENSMUST00000036181 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Fam208bQ5DTT3 Dnmbp-202ENSMUST00000212032 5074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Fam208bQ5DTT3 Picalm-213ENSMUST00000208742 3361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Fam208bQ5DTT3 Fuk-201ENSMUST00000041382 3838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Fam208bQ5DTT3 Rdh19-201ENSMUST00000077530 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Fam208bQ5DTT3 Nudt5-205ENSMUST00000179748 1590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Fam208bQ5DTT3 Tcf12-218ENSMUST00000184783 3489 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Fam208bQ5DTT3 Ecsit-203ENSMUST00000179422 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Fam208bQ5DTT3 Rab11a-208ENSMUST00000172298 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Fam208bQ5DTT3 Mff-209ENSMUST00000160972 1358 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Fam208bQ5DTT3 Tcea3-201ENSMUST00000102533 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Fam208bQ5DTT3 Gm8731-201ENSMUST00000118088 412 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32 ms