Protein–RNA interactions for Protein: Q4ACU6

Shank3, SH3 and multiple ankyrin repeat domains protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 1,730 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Shank3Q4ACU6 Rbfox1-202ENSMUST00000115841 1191 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Shank3Q4ACU6 Gm12274-201ENSMUST00000120062 385 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
Shank3Q4ACU6 Gm15524-201ENSMUST00000159874 463 ntTSL 3 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Shank3Q4ACU6 Mir6941-201ENSMUST00000184711 59 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
Shank3Q4ACU6 Gm45085-201ENSMUST00000209100 441 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
Shank3Q4ACU6 Gm31557-202ENSMUST00000213995 722 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Shank3Q4ACU6 Park2-210ENSMUST00000218435 865 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Shank3Q4ACU6 Lect2-202ENSMUST00000225183 823 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
Shank3Q4ACU6 AC158388.3-202ENSMUST00000225517 775 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
Shank3Q4ACU6 Crygb-201ENSMUST00000027090 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Shank3Q4ACU6 Lxn-201ENSMUST00000058981 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Shank3Q4ACU6 Lect2-201ENSMUST00000062806 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Shank3Q4ACU6 Krtap4-1-201ENSMUST00000081007 1015 ntAPPRIS P1 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Shank3Q4ACU6 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Shank3Q4ACU6 Pdlim2-201ENSMUST00000022681 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Shank3Q4ACU6 Nsf-202ENSMUST00000103075 3766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Shank3Q4ACU6 Aspg-201ENSMUST00000079400 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Shank3Q4ACU6 Gprin1-201ENSMUST00000099506 4141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Shank3Q4ACU6 Ung-203ENSMUST00000112275 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Shank3Q4ACU6 Spag6-201ENSMUST00000095132 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Shank3Q4ACU6 Rassf5-201ENSMUST00000027688 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Shank3Q4ACU6 Xpo6-201ENSMUST00000009344 4455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Shank3Q4ACU6 H6pd-201ENSMUST00000030830 4745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Shank3Q4ACU6 Usp38-201ENSMUST00000042724 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Shank3Q4ACU6 Gm26826-201ENSMUST00000181317 1395 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Shank3Q4ACU6 Dnaic2-201ENSMUST00000069325 2874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Shank3Q4ACU6 Kcnn2-205ENSMUST00000183850 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Shank3Q4ACU6 Cast-212ENSMUST00000223309 1529 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Shank3Q4ACU6 Gm9166-201ENSMUST00000120293 561 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
Shank3Q4ACU6 Gm4895-201ENSMUST00000181646 1137 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
Shank3Q4ACU6 Gm18801-201ENSMUST00000186616 536 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
Shank3Q4ACU6 Gm28901-201ENSMUST00000188810 474 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Shank3Q4ACU6 Gm43163-201ENSMUST00000196571 442 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
Shank3Q4ACU6 AC154589.2-201ENSMUST00000228847 251 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
Shank3Q4ACU6 Pparg-204ENSMUST00000203732 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Shank3Q4ACU6 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Shank3Q4ACU6 Acsf3-202ENSMUST00000212781 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.04
Shank3Q4ACU6 Garem2-201ENSMUST00000058045 3865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
Shank3Q4ACU6 4930558J22Rik-201ENSMUST00000139822 1480 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Shank3Q4ACU6 Vamp1-203ENSMUST00000100942 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Shank3Q4ACU6 Zscan22-201ENSMUST00000055528 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Shank3Q4ACU6 Tmem164-202ENSMUST00000101198 4443 ntTSL 3 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Shank3Q4ACU6 Slc22a16-201ENSMUST00000019978 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Shank3Q4ACU6 Grm6-204ENSMUST00000171427 4330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Shank3Q4ACU6 Gm6831-202ENSMUST00000213025 1673 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
Shank3Q4ACU6 Gm5421-201ENSMUST00000181698 2354 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
Shank3Q4ACU6 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Shank3Q4ACU6 Rpl7a-201ENSMUST00000102898 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Shank3Q4ACU6 Gm22594-201ENSMUST00000104251 130 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
Shank3Q4ACU6 Gm4294-201ENSMUST00000105169 614 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
Shank3Q4ACU6 AU020206-201ENSMUST00000181224 656 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Shank3Q4ACU6 Calm5-202ENSMUST00000184271 423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Shank3Q4ACU6 Pet100-203ENSMUST00000207389 363 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Shank3Q4ACU6 Gm45469-201ENSMUST00000210468 854 ntTSL 3 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Shank3Q4ACU6 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Shank3Q4ACU6 Scmh1-201ENSMUST00000000087 3353 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Shank3Q4ACU6 Smok4a-201ENSMUST00000074512 1455 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
Shank3Q4ACU6 Pyroxd1-201ENSMUST00000041852 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Shank3Q4ACU6 Ddx19b-202ENSMUST00000065784 3104 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Shank3Q4ACU6 Api5-201ENSMUST00000028617 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Shank3Q4ACU6 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Shank3Q4ACU6 Gm45218-201ENSMUST00000205533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Shank3Q4ACU6 Styk1-202ENSMUST00000121078 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Shank3Q4ACU6 Tmem237-205ENSMUST00000186794 1533 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Shank3Q4ACU6 Sh3glb1-201ENSMUST00000163279 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Shank3Q4ACU6 Acsl3-201ENSMUST00000035779 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Shank3Q4ACU6 B3gat1-204ENSMUST00000160899 3801 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Shank3Q4ACU6 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Shank3Q4ACU6 Creb3l4-201ENSMUST00000029547 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Shank3Q4ACU6 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Shank3Q4ACU6 Rpl23-201ENSMUST00000103146 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Shank3Q4ACU6 Tomm5-202ENSMUST00000107808 679 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Shank3Q4ACU6 Gm12247-201ENSMUST00000117585 670 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Shank3Q4ACU6 Gm15528-201ENSMUST00000117821 864 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Shank3Q4ACU6 Isg20-203ENSMUST00000120331 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Shank3Q4ACU6 Kdm6bos-201ENSMUST00000129924 840 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Shank3Q4ACU6 Nrg4-204ENSMUST00000130158 1000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Shank3Q4ACU6 Gas5-224ENSMUST00000162558 502 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Shank3Q4ACU6 Gm20442-201ENSMUST00000174630 492 ntTSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Shank3Q4ACU6 Gm7741-201ENSMUST00000181445 989 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Shank3Q4ACU6 Gm28529-201ENSMUST00000186159 387 ntTSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Shank3Q4ACU6 Gm45527-201ENSMUST00000211052 774 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Shank3Q4ACU6 AC154826.1-201ENSMUST00000217369 498 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Shank3Q4ACU6 AI463170-202ENSMUST00000218453 558 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Shank3Q4ACU6 AC134537.1-201ENSMUST00000219205 265 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Shank3Q4ACU6 Tspo2-201ENSMUST00000024794 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Shank3Q4ACU6 Krtap19-5-201ENSMUST00000053460 483 ntAPPRIS P1 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Shank3Q4ACU6 Gm10578-202ENSMUST00000211070 2876 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Shank3Q4ACU6 Zmat1-202ENSMUST00000113185 3378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Shank3Q4ACU6 Adh5-201ENSMUST00000005964 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Shank3Q4ACU6 Tmcc2-206ENSMUST00000142609 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Shank3Q4ACU6 Mterf3-201ENSMUST00000021991 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Shank3Q4ACU6 Prkar1b-202ENSMUST00000110889 2457 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Shank3Q4ACU6 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Shank3Q4ACU6 Spert-203ENSMUST00000165569 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Shank3Q4ACU6 Mapk1ip1-201ENSMUST00000075667 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Shank3Q4ACU6 Kctd14-205ENSMUST00000206279 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Shank3Q4ACU6 Airn-205ENSMUST00000161890 1375 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Shank3Q4ACU6 Gm4409-201ENSMUST00000130734 1919 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Shank3Q4ACU6 Plcb3-201ENSMUST00000025912 4201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.1 ms