Protein–RNA interactions for Protein: Q3V036

Ccdc27, Coiled-coil domain-containing protein 27, mousemouse

Predictions only

Length 639 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc27Q3V036 Ice2-203ENSMUST00000117610 800 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccdc27Q3V036 Gm5863-201ENSMUST00000121760 1008 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccdc27Q3V036 Gm14760-201ENSMUST00000121831 999 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccdc27Q3V036 Pax5-206ENSMUST00000134968 969 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccdc27Q3V036 Pelp1-202ENSMUST00000135148 562 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccdc27Q3V036 Gm16194-204ENSMUST00000141797 475 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccdc27Q3V036 1700037F24Rik-201ENSMUST00000181254 973 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccdc27Q3V036 AC069562.3-201ENSMUST00000225387 587 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccdc27Q3V036 AC022775.2-201ENSMUST00000227885 646 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccdc27Q3V036 H2-Oa-201ENSMUST00000025192 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccdc27Q3V036 Utp23-201ENSMUST00000059599 740 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccdc27Q3V036 Arhgap30-201ENSMUST00000056449 4494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccdc27Q3V036 Mast1-201ENSMUST00000109741 4872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccdc27Q3V036 Abhd14b-209ENSMUST00000216130 1624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccdc27Q3V036 Gm10339-203ENSMUST00000225409 1671 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccdc27Q3V036 Mmgt2-203ENSMUST00000129162 1828 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccdc27Q3V036 Gp2-202ENSMUST00000207887 1853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccdc27Q3V036 Gm10544-202ENSMUST00000181887 1923 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccdc27Q3V036 Gm2420-201ENSMUST00000119864 2149 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccdc27Q3V036 A830082K12Rik-201ENSMUST00000123998 2203 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccdc27Q3V036 Ces4a-201ENSMUST00000161289 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccdc27Q3V036 4933434E20Rik-206ENSMUST00000160640 2510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccdc27Q3V036 Traf7-202ENSMUST00000088464 2504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccdc27Q3V036 Arhgap1-204ENSMUST00000111331 2883 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccdc27Q3V036 Slc25a42-202ENSMUST00000110127 3196 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccdc27Q3V036 Gtf2ird1-203ENSMUST00000100650 3487 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccdc27Q3V036 Maip1-201ENSMUST00000027114 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccdc27Q3V036 Ttbk2-202ENSMUST00000057135 11066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccdc27Q3V036 Rcor3-202ENSMUST00000110849 3791 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccdc27Q3V036 Atp6v0a1-210ENSMUST00000168757 3967 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccdc27Q3V036 Ltbp2-202ENSMUST00000110254 6602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccdc27Q3V036 Jup-201ENSMUST00000001592 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccdc27Q3V036 Cdc7-204ENSMUST00000118261 3129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccdc27Q3V036 Spr-ps1-203ENSMUST00000187705 2892 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccdc27Q3V036 Rad54l-202ENSMUST00000102705 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccdc27Q3V036 Gper1-201ENSMUST00000066211 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccdc27Q3V036 Samd5-201ENSMUST00000100070 6818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccdc27Q3V036 Tmx2-203ENSMUST00000111665 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccdc27Q3V036 Thg1l-201ENSMUST00000011398 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccdc27Q3V036 Smndc1-201ENSMUST00000025997 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccdc27Q3V036 Lrrc36-201ENSMUST00000067305 2082 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccdc27Q3V036 Olfr56-204ENSMUST00000203149 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccdc27Q3V036 Gm45776-201ENSMUST00000212366 1522 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccdc27Q3V036 Snx33-201ENSMUST00000050916 4571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccdc27Q3V036 Arhgap39-201ENSMUST00000036176 4500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccdc27Q3V036 Gm18227-201ENSMUST00000211082 1468 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccdc27Q3V036 Ppih-203ENSMUST00000106318 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccdc27Q3V036 Gm12390-201ENSMUST00000117897 397 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccdc27Q3V036 Tldc2-202ENSMUST00000166140 639 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccdc27Q3V036 Gm43433-201ENSMUST00000196573 481 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccdc27Q3V036 Tm2d3-207ENSMUST00000206517 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccdc27Q3V036 Spc24-204ENSMUST00000216057 627 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccdc27Q3V036 Tatdn3-201ENSMUST00000027945 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccdc27Q3V036 Mrps21-201ENSMUST00000067298 488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccdc27Q3V036 Gm9955-201ENSMUST00000067987 309 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccdc27Q3V036 Trim23-203ENSMUST00000069187 3546 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccdc27Q3V036 F730043M19Rik-204ENSMUST00000148740 3312 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccdc27Q3V036 Hoxa9-201ENSMUST00000048680 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccdc27Q3V036 Cdc7-201ENSMUST00000031221 2961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccdc27Q3V036 Slc35a4-202ENSMUST00000050476 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccdc27Q3V036 Parp9-203ENSMUST00000114878 3548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccdc27Q3V036 Gpr19-203ENSMUST00000111932 1711 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccdc27Q3V036 Sgce-201ENSMUST00000004750 1703 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccdc27Q3V036 Mapk3-203ENSMUST00000091328 1716 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccdc27Q3V036 Clspn-201ENSMUST00000048391 5027 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccdc27Q3V036 Mlc1-201ENSMUST00000042594 2783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccdc27Q3V036 Pip5k1b-201ENSMUST00000025800 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccdc27Q3V036 Actrt2-201ENSMUST00000060062 1435 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccdc27Q3V036 Coa4-201ENSMUST00000054310 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccdc27Q3V036 Snap25-202ENSMUST00000110098 1014 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccdc27Q3V036 Cdkn1a-202ENSMUST00000119901 748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccdc27Q3V036 Mrps17-205ENSMUST00000119985 859 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccdc27Q3V036 Adamtsl1-204ENSMUST00000120678 977 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccdc27Q3V036 Prkaca-ps1-201ENSMUST00000120823 919 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccdc27Q3V036 Gm14064-201ENSMUST00000134833 727 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccdc27Q3V036 2010320O07Rik-201ENSMUST00000160935 525 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccdc27Q3V036 Nme9-202ENSMUST00000163199 1196 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccdc27Q3V036 C87198-201ENSMUST00000173553 1045 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccdc27Q3V036 Mrpl30-205ENSMUST00000193673 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccdc27Q3V036 Polr2h-201ENSMUST00000021405 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccdc27Q3V036 Cradd-202ENSMUST00000217809 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccdc27Q3V036 Tsen2-201ENSMUST00000040234 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccdc27Q3V036 Rgs12-201ENSMUST00000030984 5472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccdc27Q3V036 Sun2-203ENSMUST00000100439 3768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccdc27Q3V036 Slc14a1-203ENSMUST00000160639 2047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccdc27Q3V036 Zbtb42-201ENSMUST00000169593 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccdc27Q3V036 Exoc3l4-209ENSMUST00000222897 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccdc27Q3V036 Sec61g-203ENSMUST00000109643 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccdc27Q3V036 Rad51b-202ENSMUST00000171210 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccdc27Q3V036 Them4-201ENSMUST00000049822 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccdc27Q3V036 Odf2-209ENSMUST00000113764 2450 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccdc27Q3V036 Tspyl4-201ENSMUST00000047935 3879 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccdc27Q3V036 Pde4c-207ENSMUST00000224874 3099 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccdc27Q3V036 Zfyve1-203ENSMUST00000221919 4420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccdc27Q3V036 Abcc5-202ENSMUST00000079158 5811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccdc27Q3V036 Grin1-208ENSMUST00000114318 3920 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccdc27Q3V036 Plagl1-203ENSMUST00000121766 3897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccdc27Q3V036 Pdss2-202ENSMUST00000159139 1467 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccdc27Q3V036 Gm37368-201ENSMUST00000193173 3212 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccdc27Q3V036 Rtbdn-201ENSMUST00000067472 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.9 ms