Protein–RNA interactions for Protein: Q3US59

Gm28047, Predicted gene, 28047, mousemouse

Predictions only

Length 414 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm28047Q3US59 Otop1-202ENSMUST00000114099 3141 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Gm28047Q3US59 Camta2-202ENSMUST00000100933 4383 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Gm28047Q3US59 Camta2-204ENSMUST00000108545 4377 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Gm28047Q3US59 Camta2-206ENSMUST00000120261 4398 ntTSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Gm28047Q3US59 Bin2-205ENSMUST00000182814 1901 ntTSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Gm28047Q3US59 Med12l-203ENSMUST00000040846 3747 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Gm28047Q3US59 Hsd3b6-202ENSMUST00000170847 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Gm28047Q3US59 Twnk-201ENSMUST00000026227 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Gm28047Q3US59 Dennd4b-201ENSMUST00000098914 5423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Gm28047Q3US59 Rgs12-207ENSMUST00000114285 2924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Gm28047Q3US59 Limch1-204ENSMUST00000118242 5050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Gm28047Q3US59 Osgin1-201ENSMUST00000098365 1959 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Gm28047Q3US59 Gm13124-201ENSMUST00000105748 1221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Gm28047Q3US59 Etfrf1-202ENSMUST00000111719 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Gm28047Q3US59 Gm15172-201ENSMUST00000118945 1046 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
Gm28047Q3US59 Gstt1-202ENSMUST00000120177 1105 ntTSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Gm28047Q3US59 Gm13832-202ENSMUST00000151159 370 ntTSL 3 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Gm28047Q3US59 Commd6-203ENSMUST00000168587 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Gm28047Q3US59 Pagr1b-201ENSMUST00000172958 693 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Gm28047Q3US59 C1qtnf2-203ENSMUST00000173002 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Gm28047Q3US59 Gm43118-201ENSMUST00000199149 775 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
Gm28047Q3US59 1700011B04Rik-203ENSMUST00000220654 1033 ntTSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Gm28047Q3US59 1700011B04Rik-209ENSMUST00000221760 779 ntTSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Gm28047Q3US59 Cks1b-201ENSMUST00000029679 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Gm28047Q3US59 4930569F06Rik-201ENSMUST00000036821 433 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
Gm28047Q3US59 Bend3-201ENSMUST00000040147 5882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Gm28047Q3US59 Cercam-201ENSMUST00000047521 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Gm28047Q3US59 Tut1-201ENSMUST00000096239 2747 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Gm28047Q3US59 Wdr81-204ENSMUST00000173320 6908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Gm28047Q3US59 Sec14l5-201ENSMUST00000165810 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Gm28047Q3US59 Arntl-206ENSMUST00000211770 2464 ntTSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Gm28047Q3US59 Hnf1b-201ENSMUST00000021016 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Gm28047Q3US59 Foxj3-202ENSMUST00000106310 4660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Gm28047Q3US59 Foxl2os-201ENSMUST00000181706 3095 ntTSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Gm28047Q3US59 Otub2-202ENSMUST00000101094 3228 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Gm28047Q3US59 G630016G05Rik-202ENSMUST00000156095 3398 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Gm28047Q3US59 Mxd3-201ENSMUST00000021941 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Gm28047Q3US59 Dab2ip-209ENSMUST00000135741 4128 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Gm28047Q3US59 Samd4-201ENSMUST00000022386 4564 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Gm28047Q3US59 Mast1-201ENSMUST00000109741 4872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Gm28047Q3US59 Dixdc1-202ENSMUST00000117093 1613 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Gm28047Q3US59 Gprasp1-201ENSMUST00000113144 5843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Gm28047Q3US59 Kif1a-210ENSMUST00000190723 6141 ntTSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Gm28047Q3US59 Snap23-203ENSMUST00000116437 2730 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Gm28047Q3US59 Tnfrsf13b-201ENSMUST00000010286 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Gm28047Q3US59 AC138329.2-201ENSMUST00000225579 1842 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
Gm28047Q3US59 Tpra1-218ENSMUST00000203185 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Gm28047Q3US59 Myo15b-208ENSMUST00000222123 5154 ntTSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Gm28047Q3US59 Gm18626-201ENSMUST00000221512 1409 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
Gm28047Q3US59 Mtus1-202ENSMUST00000059115 6548 ntTSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Gm28047Q3US59 Gm25214-201ENSMUST00000104573 129 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
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Gm28047Q3US59 Gm13944-201ENSMUST00000126572 721 ntTSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
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Gm28047Q3US59 BC027072-201ENSMUST00000057405 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Gm28047Q3US59 Spg20-202ENSMUST00000107971 3567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Gm28047Q3US59 Nlrx1-202ENSMUST00000168499 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Gm28047Q3US59 Mip-201ENSMUST00000026455 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Gm28047Q3US59 Mmachc-201ENSMUST00000030453 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
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Gm28047Q3US59 Med1-202ENSMUST00000092735 2627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
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Gm28047Q3US59 Th-202ENSMUST00000105929 1950 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Gm28047Q3US59 Mon1b-202ENSMUST00000179926 3470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
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Gm28047Q3US59 Iba57-201ENSMUST00000054523 4021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Gm28047Q3US59 Ep400-202ENSMUST00000112433 3399 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Gm28047Q3US59 Tssk5-201ENSMUST00000071119 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Gm28047Q3US59 Wnt3-201ENSMUST00000000127 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Gm28047Q3US59 Gm19434-201ENSMUST00000204330 2573 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Gm28047Q3US59 6430571L13Rik-201ENSMUST00000042581 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Gm28047Q3US59 Mmel1-207ENSMUST00000163732 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Gm28047Q3US59 Ccdc154-203ENSMUST00000182621 2402 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Gm28047Q3US59 Ehd3-201ENSMUST00000024860 3658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Gm28047Q3US59 Timd2-201ENSMUST00000055102 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Gm28047Q3US59 Nicn1-201ENSMUST00000035227 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Gm28047Q3US59 Pex26-201ENSMUST00000088561 4093 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Gm28047Q3US59 Ednrb-203ENSMUST00000227824 2669 ntAPPRIS P1 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Gm28047Q3US59 AC093022.4-203ENSMUST00000228523 2657 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
Gm28047Q3US59 Nhlrc2-201ENSMUST00000071423 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Gm28047Q3US59 Mylip-202ENSMUST00000222178 1954 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Gm28047Q3US59 Slc22a5-201ENSMUST00000019044 3062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Gm28047Q3US59 Gck-201ENSMUST00000102920 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Gm28047Q3US59 Mymx-201ENSMUST00000113529 442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Gm28047Q3US59 Gm14127-201ENSMUST00000117906 678 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
Gm28047Q3US59 Gm13966-201ENSMUST00000148420 832 ntTSL 3 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Gm28047Q3US59 Gm17227-202ENSMUST00000170286 1016 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Gm28047Q3US59 Gm26973-201ENSMUST00000182105 696 ntTSL 3 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Gm28047Q3US59 Gm28192-201ENSMUST00000189381 778 ntTSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Gm28047Q3US59 Gm45022-201ENSMUST00000208332 545 ntTSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Gm28047Q3US59 Gm19994-201ENSMUST00000217086 586 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
Gm28047Q3US59 AC158523.3-201ENSMUST00000220664 864 ntTSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Gm28047Q3US59 AC113031.8-201ENSMUST00000227856 631 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
Gm28047Q3US59 4933434E20Rik-202ENSMUST00000029552 1080 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Gm28047Q3US59 Pcgf1-201ENSMUST00000092614 866 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
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