Protein–RNA interactions for Protein: Q3UI66

Ccdc34, Coiled-coil domain-containing protein 34, mousemouse

Predictions only

Length 367 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc34Q3UI66 Tekt4-201ENSMUST00000025002 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Ccdc34Q3UI66 Gm42141-201ENSMUST00000196534 2172 ntBASIC13.08□□□□□ -0.31
Ccdc34Q3UI66 Accs-201ENSMUST00000041593 2036 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Ccdc34Q3UI66 Exosc10-202ENSMUST00000076022 2682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Ccdc34Q3UI66 Arpp21-223ENSMUST00000162097 3952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.31
Ccdc34Q3UI66 2700068H02Rik-201ENSMUST00000137882 1872 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Ccdc34Q3UI66 Aldh16a1-206ENSMUST00000209963 3537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Ccdc34Q3UI66 Lnx1-203ENSMUST00000113531 3098 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Ccdc34Q3UI66 Ern1-202ENSMUST00000106799 660 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Ccdc34Q3UI66 Isg20-202ENSMUST00000118867 697 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Ccdc34Q3UI66 Gm16151-201ENSMUST00000129696 639 ntTSL 3 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Ccdc34Q3UI66 4933427I22Rik-201ENSMUST00000138672 393 ntTSL 3 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Ccdc34Q3UI66 Tbx3os1-203ENSMUST00000140101 490 ntTSL 3 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Ccdc34Q3UI66 Gm26771-201ENSMUST00000180472 1082 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Ccdc34Q3UI66 Gm29541-201ENSMUST00000191351 678 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Ccdc34Q3UI66 Gm37171-201ENSMUST00000192636 1185 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Ccdc34Q3UI66 Gm35611-201ENSMUST00000205323 799 ntTSL 3 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Ccdc34Q3UI66 Gm44662-201ENSMUST00000206970 412 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Ccdc34Q3UI66 Gm44872-201ENSMUST00000207864 420 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Ccdc34Q3UI66 Efcab10-201ENSMUST00000020878 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Ccdc34Q3UI66 AC153506.3-201ENSMUST00000219287 1029 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Ccdc34Q3UI66 Nsmce1-201ENSMUST00000033006 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Ccdc34Q3UI66 Gm5771-201ENSMUST00000049079 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Ccdc34Q3UI66 Ssc4d-201ENSMUST00000054895 1191 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Ccdc34Q3UI66 Chchd10-201ENSMUST00000058906 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Ccdc34Q3UI66 Upk3bl-201ENSMUST00000006303 1045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Ccdc34Q3UI66 Rnaseh2a-201ENSMUST00000065049 1006 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Ccdc34Q3UI66 Ndufa3-201ENSMUST00000076657 515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Ccdc34Q3UI66 Rhbdd3-203ENSMUST00000109878 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Ccdc34Q3UI66 Vasn-201ENSMUST00000038770 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Ccdc34Q3UI66 Mdh2-201ENSMUST00000019323 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Ccdc34Q3UI66 Cpq-207ENSMUST00000228916 1842 ntAPPRIS P1 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Ccdc34Q3UI66 Dctn1-205ENSMUST00000113919 4292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Ccdc34Q3UI66 Mknk2-201ENSMUST00000003433 3065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Ccdc34Q3UI66 Auts2-209ENSMUST00000161804 5392 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Ccdc34Q3UI66 Tctn3-203ENSMUST00000135795 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Ccdc34Q3UI66 Krt33a-201ENSMUST00000018399 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Ccdc34Q3UI66 Gm10544-201ENSMUST00000180516 2239 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Ccdc34Q3UI66 Syt6-203ENSMUST00000118117 1856 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Ccdc34Q3UI66 Cd300lf-201ENSMUST00000051264 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Ccdc34Q3UI66 Zeb1-201ENSMUST00000025081 5805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Ccdc34Q3UI66 Lrrc18-204ENSMUST00000120951 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Ccdc34Q3UI66 4732414G09Rik-201ENSMUST00000156243 2422 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Ccdc34Q3UI66 AC091764.2-201ENSMUST00000218190 1590 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ccdc34Q3UI66 Pamr1-201ENSMUST00000028612 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ccdc34Q3UI66 Kirrel3-209ENSMUST00000190549 3074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ccdc34Q3UI66 Bpi-202ENSMUST00000109499 1778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ccdc34Q3UI66 Pidd1-202ENSMUST00000106005 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ccdc34Q3UI66 Fam126a-203ENSMUST00000115109 2195 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ccdc34Q3UI66 Esrp1-201ENSMUST00000043781 3743 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ccdc34Q3UI66 Prrxl1-201ENSMUST00000068938 1610 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ccdc34Q3UI66 Cklf-202ENSMUST00000098464 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ccdc34Q3UI66 Rpgrip1-202ENSMUST00000111603 5380 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ccdc34Q3UI66 Wnt7b-203ENSMUST00000167968 3408 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ccdc34Q3UI66 Gm25287-201ENSMUST00000103846 110 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Ccdc34Q3UI66 Gm22918-201ENSMUST00000103855 110 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Ccdc34Q3UI66 Gm14701-201ENSMUST00000117156 348 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Ccdc34Q3UI66 Psmb5-ps-201ENSMUST00000119744 798 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Ccdc34Q3UI66 6530401F13Rik-201ENSMUST00000166971 1090 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ccdc34Q3UI66 Csnk1a1-208ENSMUST00000167187 1222 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ccdc34Q3UI66 Gm34272-201ENSMUST00000208886 253 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Ccdc34Q3UI66 Clrn1-201ENSMUST00000051408 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ccdc34Q3UI66 Krtap9-3-201ENSMUST00000062683 759 ntAPPRIS P1 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ccdc34Q3UI66 BC028528-202ENSMUST00000090476 809 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ccdc34Q3UI66 Calhm2-201ENSMUST00000035822 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ccdc34Q3UI66 Tbc1d14-204ENSMUST00000130417 2665 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ccdc34Q3UI66 Ntrk3-205ENSMUST00000193002 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ccdc34Q3UI66 Tcof1-204ENSMUST00000176630 4529 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ccdc34Q3UI66 Bms1-201ENSMUST00000032237 4345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ccdc34Q3UI66 Cttn-201ENSMUST00000033407 2913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ccdc34Q3UI66 Il1rap-206ENSMUST00000174202 2306 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ccdc34Q3UI66 Orc5-201ENSMUST00000030872 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ccdc34Q3UI66 Gm37057-201ENSMUST00000192624 1916 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Ccdc34Q3UI66 Ctsd-201ENSMUST00000066401 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ccdc34Q3UI66 Ptbp1-202ENSMUST00000095457 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ccdc34Q3UI66 Prps1-201ENSMUST00000033809 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ccdc34Q3UI66 Gm13848-202ENSMUST00000211663 1560 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ccdc34Q3UI66 Igsf5-202ENSMUST00000081093 1554 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ccdc34Q3UI66 Vmn1r45-206ENSMUST00000227977 3297 ntAPPRIS P1 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ccdc34Q3UI66 Ubap1l-201ENSMUST00000147185 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ccdc34Q3UI66 Ccdc42-203ENSMUST00000154294 1384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ccdc34Q3UI66 Ddx11-201ENSMUST00000163605 4149 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ccdc34Q3UI66 Pigo-201ENSMUST00000067481 3525 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ccdc34Q3UI66 Ivns1abp-202ENSMUST00000097543 3337 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ccdc34Q3UI66 Rnf41-201ENSMUST00000096386 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ccdc34Q3UI66 Art3-208ENSMUST00000121096 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ccdc34Q3UI66 Nek5-202ENSMUST00000209656 2253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ccdc34Q3UI66 Dock6-207ENSMUST00000217336 6880 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ccdc34Q3UI66 Dnajc5-203ENSMUST00000108797 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ccdc34Q3UI66 Rnf220-202ENSMUST00000094853 1675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ccdc34Q3UI66 Taf1a-201ENSMUST00000097043 1472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ccdc34Q3UI66 Maob-201ENSMUST00000040820 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ccdc34Q3UI66 Igf2-203ENSMUST00000105935 650 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ccdc34Q3UI66 Cep250-203ENSMUST00000109618 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ccdc34Q3UI66 Tmem33-206ENSMUST00000162543 664 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ccdc34Q3UI66 Myl10-202ENSMUST00000196068 911 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ccdc34Q3UI66 Gm30684-201ENSMUST00000205632 600 ntTSL 3 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ccdc34Q3UI66 Nudt22-201ENSMUST00000041686 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ccdc34Q3UI66 Birc3-201ENSMUST00000013949 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ccdc34Q3UI66 Zfp235-201ENSMUST00000056549 3373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
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