Protein–RNA interactions for Protein: Q3UGP9

Lrrc58, Leucine-rich repeat-containing protein 58, mousemouse

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Length 366 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrc58Q3UGP9 Madd-203ENSMUST00000075269 5756 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Lrrc58Q3UGP9 Tnfrsf13b-201ENSMUST00000010286 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Lrrc58Q3UGP9 Myo18a-210ENSMUST00000130305 5450 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Lrrc58Q3UGP9 Ncapd3-201ENSMUST00000073127 5499 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Lrrc58Q3UGP9 Gm19221-201ENSMUST00000221827 1477 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
Lrrc58Q3UGP9 Gm44207-201ENSMUST00000204568 1424 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
Lrrc58Q3UGP9 Sin3b-201ENSMUST00000004494 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Lrrc58Q3UGP9 Fam78a-201ENSMUST00000056406 4107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
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Lrrc58Q3UGP9 Gm17077-201ENSMUST00000133179 279 ntTSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Lrrc58Q3UGP9 Gm12199-201ENSMUST00000137567 517 ntTSL 3 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Lrrc58Q3UGP9 1700003G18Rik-201ENSMUST00000140689 633 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Lrrc58Q3UGP9 Gm15738-202ENSMUST00000140892 427 ntTSL 2 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Lrrc58Q3UGP9 Gm15395-201ENSMUST00000153724 702 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Lrrc58Q3UGP9 Ppp3cb-202ENSMUST00000159027 3831 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Lrrc58Q3UGP9 6530403H02Rik-204ENSMUST00000183276 659 ntTSL 3 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Lrrc58Q3UGP9 1700065D16Rik-203ENSMUST00000189279 393 ntTSL 2 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Lrrc58Q3UGP9 Gm35409-201ENSMUST00000196412 1102 ntTSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Lrrc58Q3UGP9 Gm39929-201ENSMUST00000209672 693 ntTSL 3 BASIC11.97□□□□□ -0.49
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Lrrc58Q3UGP9 Cma2-201ENSMUST00000089555 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Lrrc58Q3UGP9 Arrb1-201ENSMUST00000032995 3715 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Lrrc58Q3UGP9 Map3k4-201ENSMUST00000089058 5305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Lrrc58Q3UGP9 1700082M22Rik-201ENSMUST00000067136 2022 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Lrrc58Q3UGP9 Lipe-201ENSMUST00000003207 3613 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Lrrc58Q3UGP9 Nlrx1-202ENSMUST00000168499 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Lrrc58Q3UGP9 Tnk1-201ENSMUST00000001626 2778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
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Lrrc58Q3UGP9 Mon1b-202ENSMUST00000179926 3470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Lrrc58Q3UGP9 Pdcd1-201ENSMUST00000027507 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Lrrc58Q3UGP9 Chit1-202ENSMUST00000159963 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Lrrc58Q3UGP9 Fyb2-201ENSMUST00000106803 3136 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Lrrc58Q3UGP9 Hnrnpa2b1-203ENSMUST00000114459 1728 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Lrrc58Q3UGP9 Hrg-201ENSMUST00000023590 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
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Lrrc58Q3UGP9 Camta2-206ENSMUST00000120261 4398 ntTSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Lrrc58Q3UGP9 Dip2a-202ENSMUST00000105417 6383 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Lrrc58Q3UGP9 Ugt1a2-201ENSMUST00000049289 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Lrrc58Q3UGP9 Tns2-201ENSMUST00000046144 4718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
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Lrrc58Q3UGP9 Treh-201ENSMUST00000034609 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Lrrc58Q3UGP9 Phrf1-202ENSMUST00000122143 4864 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Lrrc58Q3UGP9 Ptbp1-216ENSMUST00000172282 3110 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Lrrc58Q3UGP9 Oprm1-202ENSMUST00000052751 1334 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Lrrc58Q3UGP9 Oprm1-207ENSMUST00000092731 1332 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Lrrc58Q3UGP9 Traf3ip2-201ENSMUST00000019987 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
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Lrrc58Q3UGP9 Gm17586-201ENSMUST00000181502 908 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
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Lrrc58Q3UGP9 CT485787.1-201ENSMUST00000225617 968 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
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Lrrc58Q3UGP9 Lsm7-201ENSMUST00000035775 468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
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Lrrc58Q3UGP9 Jph2-202ENSMUST00000109425 4155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
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Lrrc58Q3UGP9 Cramp1l-201ENSMUST00000073337 7517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Lrrc58Q3UGP9 Adck1-202ENSMUST00000166940 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Lrrc58Q3UGP9 Gnb4-205ENSMUST00000155737 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
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Lrrc58Q3UGP9 Strip2-205ENSMUST00000151738 5281 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Lrrc58Q3UGP9 Creb3l2-201ENSMUST00000041093 7082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Lrrc58Q3UGP9 Gm6015-201ENSMUST00000217493 1586 ntBASIC11.96□□□□□ -0.5
Lrrc58Q3UGP9 Mfsd4a-207ENSMUST00000159038 1957 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.5
Lrrc58Q3UGP9 Cyp8b1-201ENSMUST00000062474 1950 ntAPPRIS P1 BASIC11.96□□□□□ -0.5
Lrrc58Q3UGP9 Samd4-201ENSMUST00000022386 4564 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Lrrc58Q3UGP9 Cbfa2t2-202ENSMUST00000099178 3247 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Lrrc58Q3UGP9 Gm16582-201ENSMUST00000159627 1930 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Lrrc58Q3UGP9 Adcy9-201ENSMUST00000005719 4457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Lrrc58Q3UGP9 Poll-201ENSMUST00000026239 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Lrrc58Q3UGP9 Col14a1-201ENSMUST00000023053 6457 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Lrrc58Q3UGP9 Fnip2-203ENSMUST00000133154 7299 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Lrrc58Q3UGP9 Ints1-210ENSMUST00000200393 7070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Lrrc58Q3UGP9 Chrdl1-204ENSMUST00000166406 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Lrrc58Q3UGP9 Pcdha2-202ENSMUST00000195590 4645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Lrrc58Q3UGP9 CT025678.1-201ENSMUST00000214795 2972 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
Lrrc58Q3UGP9 Sorcs1-203ENSMUST00000164039 7241 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Lrrc58Q3UGP9 Mast1-201ENSMUST00000109741 4872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Lrrc58Q3UGP9 Egr2-202ENSMUST00000105438 2864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Lrrc58Q3UGP9 Gtf2f1-201ENSMUST00000002733 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Lrrc58Q3UGP9 Misp-202ENSMUST00000169041 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Lrrc58Q3UGP9 Slc26a6-201ENSMUST00000098376 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Lrrc58Q3UGP9 Accs-201ENSMUST00000041593 2036 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Lrrc58Q3UGP9 Tnfrsf18-202ENSMUST00000103173 1189 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Lrrc58Q3UGP9 Apoc1-202ENSMUST00000108451 532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Lrrc58Q3UGP9 Gm12058-201ENSMUST00000118614 437 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
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