Protein–RNA interactions for Protein: Q3UDK1

Trafd1, TRAF-type zinc finger domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 580 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trafd1Q3UDK1 Rnf6-201ENSMUST00000067837 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Trafd1Q3UDK1 Gm37105-201ENSMUST00000192251 2085 ntBASIC12.15□□□□□ -0.46
Trafd1Q3UDK1 Gm45428-201ENSMUST00000209619 1789 ntBASIC12.15□□□□□ -0.46
Trafd1Q3UDK1 Prss30-201ENSMUST00000024936 1470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Trafd1Q3UDK1 Ush1c-206ENSMUST00000154292 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Trafd1Q3UDK1 Maats1-201ENSMUST00000023501 2750 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Trafd1Q3UDK1 Umod-201ENSMUST00000033263 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Trafd1Q3UDK1 Col6a2-201ENSMUST00000001181 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Trafd1Q3UDK1 Mypopos-202ENSMUST00000205975 2321 ntBASIC12.15□□□□□ -0.46
Trafd1Q3UDK1 Gm28373-201ENSMUST00000178129 2724 ntTSL 2 BASIC12.15□□□□□ -0.46
Trafd1Q3UDK1 Lamc3-201ENSMUST00000028187 5871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Trafd1Q3UDK1 Vsx2-201ENSMUST00000021665 3270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Trafd1Q3UDK1 Sp4-201ENSMUST00000026367 5694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Trafd1Q3UDK1 Gm5637-201ENSMUST00000153890 1119 ntBASIC12.15□□□□□ -0.46
Trafd1Q3UDK1 Gm8738-201ENSMUST00000172606 329 ntBASIC12.15□□□□□ -0.46
Trafd1Q3UDK1 Gm27516-201ENSMUST00000184237 98 ntBASIC12.15□□□□□ -0.46
Trafd1Q3UDK1 Gm26728-201ENSMUST00000185268 595 ntTSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Trafd1Q3UDK1 Gm29233-201ENSMUST00000190311 281 ntTSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.46
Trafd1Q3UDK1 Gm37008-201ENSMUST00000195712 319 ntBASIC12.15□□□□□ -0.46
Trafd1Q3UDK1 Brsk1-205ENSMUST00000206024 1216 ntTSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Trafd1Q3UDK1 Gm7172-201ENSMUST00000218047 1152 ntBASIC12.15□□□□□ -0.46
Trafd1Q3UDK1 Pcgf5-203ENSMUST00000224679 1269 ntAPPRIS P5 BASIC12.15□□□□□ -0.46
Trafd1Q3UDK1 St13-201ENSMUST00000023039 1089 ntTSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.46
Trafd1Q3UDK1 H1foo-201ENSMUST00000037831 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Trafd1Q3UDK1 n-R5s195-201ENSMUST00000082891 119 ntBASIC12.15□□□□□ -0.46
Trafd1Q3UDK1 Mdk-203ENSMUST00000090602 714 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.46
Trafd1Q3UDK1 AC154639.1-201ENSMUST00000224393 2849 ntBASIC12.15□□□□□ -0.46
Trafd1Q3UDK1 Mroh1-204ENSMUST00000159218 5085 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.46
Trafd1Q3UDK1 Esr1-201ENSMUST00000067086 4344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Trafd1Q3UDK1 F11-201ENSMUST00000034064 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Trafd1Q3UDK1 Hnf1b-201ENSMUST00000021016 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Trafd1Q3UDK1 Fam161a-203ENSMUST00000109557 1947 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.15□□□□□ -0.46
Trafd1Q3UDK1 Grip2-201ENSMUST00000159684 3006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.46
Trafd1Q3UDK1 Mettl13-201ENSMUST00000028017 4541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Trafd1Q3UDK1 Gga3-201ENSMUST00000019135 3816 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Trafd1Q3UDK1 Gm9195-201ENSMUST00000208955 8870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.46
Trafd1Q3UDK1 Cdh18-204ENSMUST00000165614 2162 ntTSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.47
Trafd1Q3UDK1 Farsb-202ENSMUST00000170217 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.47
Trafd1Q3UDK1 Hdac5-204ENSMUST00000107152 3788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.47
Trafd1Q3UDK1 Gpr18-201ENSMUST00000055475 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Trafd1Q3UDK1 3200001D21Rik-201ENSMUST00000221603 2283 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Trafd1Q3UDK1 Birc3-201ENSMUST00000013949 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Trafd1Q3UDK1 Ivns1abp-202ENSMUST00000097543 3337 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Trafd1Q3UDK1 Tbc1d1-204ENSMUST00000121370 5419 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Trafd1Q3UDK1 Kdm2a-201ENSMUST00000047898 8578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Trafd1Q3UDK1 Vmac-202ENSMUST00000164907 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Trafd1Q3UDK1 Gm43760-201ENSMUST00000202120 3015 ntBASIC12.14□□□□□ -0.47
Trafd1Q3UDK1 Ehd3-201ENSMUST00000024860 3658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Trafd1Q3UDK1 Neu2-201ENSMUST00000070898 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Trafd1Q3UDK1 Gm43075-201ENSMUST00000198613 3905 ntBASIC12.14□□□□□ -0.47
Trafd1Q3UDK1 Syt15-202ENSMUST00000119693 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Trafd1Q3UDK1 Phactr1-206ENSMUST00000131942 2056 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Trafd1Q3UDK1 Atp1a2-201ENSMUST00000085913 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Trafd1Q3UDK1 Gm36445-201ENSMUST00000209344 1432 ntTSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Trafd1Q3UDK1 Sfxn3-201ENSMUST00000062213 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Trafd1Q3UDK1 Psap-203ENSMUST00000165878 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Trafd1Q3UDK1 Rbm5-201ENSMUST00000035199 3064 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Trafd1Q3UDK1 Gm23912-201ENSMUST00000104687 87 ntBASIC12.14□□□□□ -0.47
Trafd1Q3UDK1 Nipsnap3b-202ENSMUST00000107665 848 ntTSL 2 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Trafd1Q3UDK1 Cabp1-203ENSMUST00000112112 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Trafd1Q3UDK1 Gm14723-201ENSMUST00000118686 215 ntBASIC12.14□□□□□ -0.47
Trafd1Q3UDK1 A430060F13Rik-201ENSMUST00000124176 378 ntBASIC12.14□□□□□ -0.47
Trafd1Q3UDK1 Gm12843-201ENSMUST00000137607 601 ntTSL 3 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Trafd1Q3UDK1 Gm16191-202ENSMUST00000148464 484 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Trafd1Q3UDK1 Fhit-206ENSMUST00000162278 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Trafd1Q3UDK1 Gm8494-201ENSMUST00000178171 1233 ntBASIC12.14□□□□□ -0.47
Trafd1Q3UDK1 Dcdc2b-203ENSMUST00000179209 864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Trafd1Q3UDK1 Gm43118-201ENSMUST00000199149 775 ntBASIC12.14□□□□□ -0.47
Trafd1Q3UDK1 Gm39404-201ENSMUST00000216350 313 ntBASIC12.14□□□□□ -0.47
Trafd1Q3UDK1 AC160029.2-201ENSMUST00000218285 548 ntTSL 3 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Trafd1Q3UDK1 Gm4935-201ENSMUST00000221316 1198 ntBASIC12.14□□□□□ -0.47
Trafd1Q3UDK1 Polr2e-201ENSMUST00000004786 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Trafd1Q3UDK1 Snora73a-201ENSMUST00000082453 205 ntBASIC12.14□□□□□ -0.47
Trafd1Q3UDK1 Hsd3b6-202ENSMUST00000170847 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Trafd1Q3UDK1 Phyhd1-202ENSMUST00000091132 1353 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Trafd1Q3UDK1 Nfya-212ENSMUST00000162460 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Trafd1Q3UDK1 Mgat1-203ENSMUST00000109194 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Trafd1Q3UDK1 Tpra1-218ENSMUST00000203185 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Trafd1Q3UDK1 Nxph1-202ENSMUST00000160300 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Trafd1Q3UDK1 Abcb9-201ENSMUST00000031354 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Trafd1Q3UDK1 Tirap-203ENSMUST00000176531 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Trafd1Q3UDK1 Xkr5-201ENSMUST00000055503 3176 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Trafd1Q3UDK1 Cdrt4os1-201ENSMUST00000130177 2090 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Trafd1Q3UDK1 Crybg3-201ENSMUST00000044604 5231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Trafd1Q3UDK1 Calm1-202ENSMUST00000110082 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Trafd1Q3UDK1 H2-M2-201ENSMUST00000016427 1550 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Trafd1Q3UDK1 Plagl1-203ENSMUST00000121766 3897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Trafd1Q3UDK1 Cyp26b1-204ENSMUST00000204146 4495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Trafd1Q3UDK1 Tonsl-207ENSMUST00000168185 4235 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Trafd1Q3UDK1 Gm8522-201ENSMUST00000118416 1929 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
Trafd1Q3UDK1 Gm16582-201ENSMUST00000159627 1930 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Trafd1Q3UDK1 Mon1b-202ENSMUST00000179926 3470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Trafd1Q3UDK1 Pcnt-202ENSMUST00000217838 9341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Trafd1Q3UDK1 Cd163l1-204ENSMUST00000209637 3210 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Trafd1Q3UDK1 Magee1-201ENSMUST00000033578 3550 ntAPPRIS P1 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Trafd1Q3UDK1 Lpar1-205ENSMUST00000107575 3421 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Trafd1Q3UDK1 Gm4219-201ENSMUST00000168140 2143 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Trafd1Q3UDK1 Rab3d-203ENSMUST00000122211 3886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Trafd1Q3UDK1 Tor3a-201ENSMUST00000079625 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Trafd1Q3UDK1 Plxna1-201ENSMUST00000049845 5810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.6 ms