Protein–RNA interactions for Protein: Q3U6U5

Gtpbp6, Putative GTP-binding protein 6, mousemouse

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Length 514 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtpbp6Q3U6U5 Chd1-202ENSMUST00000024627 7916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Gtpbp6Q3U6U5 Gm27196-201ENSMUST00000184787 2582 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Gtpbp6Q3U6U5 Txnrd3-201ENSMUST00000000828 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Gtpbp6Q3U6U5 Zfp146-201ENSMUST00000062181 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Gtpbp6Q3U6U5 Sall4-202ENSMUST00000075044 2534 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Gtpbp6Q3U6U5 Nol4-208ENSMUST00000164893 2175 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Gtpbp6Q3U6U5 Arhgef25-202ENSMUST00000167353 2189 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Gtpbp6Q3U6U5 Tepsin-201ENSMUST00000026442 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Gtpbp6Q3U6U5 Slc22a15-201ENSMUST00000106928 6573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Gtpbp6Q3U6U5 Proser3-202ENSMUST00000108165 2466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Gtpbp6Q3U6U5 Slc4a1ap-213ENSMUST00000202950 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Gtpbp6Q3U6U5 Atp5d-202ENSMUST00000105366 781 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
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Gtpbp6Q3U6U5 2310057J18Rik-204ENSMUST00000152363 1043 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Gtpbp6Q3U6U5 Gm3594-201ENSMUST00000169152 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Gtpbp6Q3U6U5 Gm27184-201ENSMUST00000185095 607 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Gtpbp6Q3U6U5 A430093F15Rik-204ENSMUST00000186596 2115 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Gtpbp6Q3U6U5 Tcf4-258ENSMUST00000202937 2103 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
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Gtpbp6Q3U6U5 Cd320-202ENSMUST00000087559 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Gtpbp6Q3U6U5 Ttyh2-201ENSMUST00000045779 3486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Gtpbp6Q3U6U5 Mapkapk5-204ENSMUST00000111783 1513 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Gtpbp6Q3U6U5 Tex45-203ENSMUST00000161680 1526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
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Gtpbp6Q3U6U5 Atg16l1-201ENSMUST00000027512 3130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Gtpbp6Q3U6U5 Islr2-210ENSMUST00000215950 4109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Gtpbp6Q3U6U5 Mutyh-201ENSMUST00000102699 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Gtpbp6Q3U6U5 Hnrnpm-202ENSMUST00000114385 2550 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Gtpbp6Q3U6U5 Gnas-210ENSMUST00000109095 2059 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Gtpbp6Q3U6U5 Dse-201ENSMUST00000048010 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Gtpbp6Q3U6U5 Slc25a46-201ENSMUST00000060396 4371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Gtpbp6Q3U6U5 P4hb-201ENSMUST00000026122 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Gtpbp6Q3U6U5 Dhx57-201ENSMUST00000038166 4918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Gtpbp6Q3U6U5 Adrb3-201ENSMUST00000081438 2795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Gtpbp6Q3U6U5 Il2rb-202ENSMUST00000163494 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Gtpbp6Q3U6U5 Gm26788-201ENSMUST00000181692 1750 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Gtpbp6Q3U6U5 Gm19434-201ENSMUST00000204330 2573 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Gtpbp6Q3U6U5 Vwc2-202ENSMUST00000109681 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Gtpbp6Q3U6U5 Sema4b-204ENSMUST00000205822 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Gtpbp6Q3U6U5 Cnih4-203ENSMUST00000111059 3127 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Gtpbp6Q3U6U5 Gtf2ird1-212ENSMUST00000200944 3133 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
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Gtpbp6Q3U6U5 Gtf2ird1-229ENSMUST00000202554 3514 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Gtpbp6Q3U6U5 Zbtb46-201ENSMUST00000029106 5309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Gtpbp6Q3U6U5 E330009J07Rik-202ENSMUST00000101492 6742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Gtpbp6Q3U6U5 Olfr1349-204ENSMUST00000207820 1325 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Gtpbp6Q3U6U5 Ptk7-201ENSMUST00000044442 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Gtpbp6Q3U6U5 Angel2-202ENSMUST00000066632 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Gtpbp6Q3U6U5 Rims1-201ENSMUST00000081544 5954 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Gtpbp6Q3U6U5 Pou4f2-201ENSMUST00000034115 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gtpbp6Q3U6U5 Tmub2-205ENSMUST00000156326 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gtpbp6Q3U6U5 Akr1c6-201ENSMUST00000021630 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gtpbp6Q3U6U5 Pacs2-201ENSMUST00000084891 5480 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gtpbp6Q3U6U5 Camsap3-202ENSMUST00000171962 3925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gtpbp6Q3U6U5 Dmrta1-201ENSMUST00000052478 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gtpbp6Q3U6U5 Trbv20-201ENSMUST00000103277 335 ntAPPRIS P1 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gtpbp6Q3U6U5 Rap1a-ps2-201ENSMUST00000118467 559 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Gtpbp6Q3U6U5 Gm12539-201ENSMUST00000121549 1098 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Gtpbp6Q3U6U5 Gm12798-201ENSMUST00000124786 666 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gtpbp6Q3U6U5 Gm17208-201ENSMUST00000168388 535 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Gtpbp6Q3U6U5 Gm20823-201ENSMUST00000179949 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gtpbp6Q3U6U5 Gm20924-202ENSMUST00000186910 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gtpbp6Q3U6U5 Gm38210-201ENSMUST00000191944 809 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Gtpbp6Q3U6U5 Gm3544-201ENSMUST00000196129 305 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Gtpbp6Q3U6U5 Ceacam1-209ENSMUST00000206687 1061 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gtpbp6Q3U6U5 Gm35665-201ENSMUST00000206742 1140 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gtpbp6Q3U6U5 Fam168a-204ENSMUST00000207564 1083 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.6 ms