Protein–RNA interactions for Protein: Q3U319

Rnf40, E3 ubiquitin-protein ligase BRE1B, mousemouse

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Length 1,001 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf40Q3U319 Rasd2-201ENSMUST00000132133 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Rnf40Q3U319 Gm11788-201ENSMUST00000142520 562 ntTSL 3 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Rnf40Q3U319 A230072E10Rik-201ENSMUST00000146161 676 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Rnf40Q3U319 Gm13883-202ENSMUST00000151310 1156 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Rnf40Q3U319 Inpp4a-211ENSMUST00000168546 2964 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Rnf40Q3U319 Prl3c1-203ENSMUST00000178072 579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Rnf40Q3U319 Gm3436-201ENSMUST00000179930 840 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Rnf40Q3U319 Gm28262-201ENSMUST00000185463 477 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Rnf40Q3U319 Gm43703-201ENSMUST00000200523 763 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Rnf40Q3U319 Gm31597-201ENSMUST00000211176 515 ntTSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Rnf40Q3U319 Nudt22-201ENSMUST00000041686 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Rnf40Q3U319 Rn7sk-201ENSMUST00000083103 331 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Rnf40Q3U319 Gm26315-201ENSMUST00000083890 321 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Rnf40Q3U319 Crxos-201ENSMUST00000098801 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Rnf40Q3U319 BC048403-201ENSMUST00000065600 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Rnf40Q3U319 Gm13848-202ENSMUST00000211663 1560 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Rnf40Q3U319 Pcdhga3-201ENSMUST00000073447 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Rnf40Q3U319 Sorbs1-203ENSMUST00000165212 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Rnf40Q3U319 Mier3-201ENSMUST00000047412 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Rnf40Q3U319 BC052040-203ENSMUST00000166472 2770 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Rnf40Q3U319 Fads6-201ENSMUST00000056153 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Rnf40Q3U319 Timm21-201ENSMUST00000025547 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Rnf40Q3U319 Ascc1-201ENSMUST00000050516 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Rnf40Q3U319 Rnps1-202ENSMUST00000115371 1617 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Rnf40Q3U319 Pdia4-201ENSMUST00000077290 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Rnf40Q3U319 P2ry1-201ENSMUST00000029331 3886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Rnf40Q3U319 Rcor3-202ENSMUST00000110849 3791 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
Rnf40Q3U319 Zbtb42-201ENSMUST00000169593 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.83□□□□□ -0.35
Rnf40Q3U319 Pros1-201ENSMUST00000023629 3303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
Rnf40Q3U319 Ppm1l-201ENSMUST00000029355 9417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
Rnf40Q3U319 Cxadr-202ENSMUST00000114229 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
Rnf40Q3U319 Lsp1-201ENSMUST00000018963 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
Rnf40Q3U319 Adora1-203ENSMUST00000169927 4581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.35
Rnf40Q3U319 G630016G05Rik-202ENSMUST00000156095 3398 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Rnf40Q3U319 Adamts10-201ENSMUST00000087623 4043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Rnf40Q3U319 Gm11494-201ENSMUST00000142279 1738 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Rnf40Q3U319 Plcd4-206ENSMUST00000113750 2692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Rnf40Q3U319 Fam110a-203ENSMUST00000109864 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Rnf40Q3U319 Apol7a-201ENSMUST00000010745 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Rnf40Q3U319 Slc25a36-202ENSMUST00000085206 5227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Rnf40Q3U319 Unkl-204ENSMUST00000160896 4787 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Rnf40Q3U319 Gpat3-202ENSMUST00000092990 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
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Rnf40Q3U319 Gm26399-201ENSMUST00000103937 110 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
Rnf40Q3U319 Ctnnbip1-202ENSMUST00000105692 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
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Rnf40Q3U319 Btf3-205ENSMUST00000152704 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Rnf40Q3U319 9530003J23Rik-202ENSMUST00000159193 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
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Rnf40Q3U319 Rabep1-208ENSMUST00000179114 1264 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
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Rnf40Q3U319 Gm25086-201ENSMUST00000179931 110 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
Rnf40Q3U319 Gm23243-201ENSMUST00000180047 110 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
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Rnf40Q3U319 Gm24169-201ENSMUST00000180244 110 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
Rnf40Q3U319 Gm23689-201ENSMUST00000180354 110 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
Rnf40Q3U319 Gm26771-201ENSMUST00000180472 1082 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
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Rnf40Q3U319 Gm27703-201ENSMUST00000184836 110 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
Rnf40Q3U319 Gm36972-201ENSMUST00000194000 676 ntTSL 3 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Rnf40Q3U319 Gm43952-201ENSMUST00000203765 751 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
Rnf40Q3U319 4930595O18Rik-201ENSMUST00000205099 607 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
Rnf40Q3U319 Gm30191-201ENSMUST00000205501 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Rnf40Q3U319 Trdn-207ENSMUST00000219931 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Rnf40Q3U319 Gngt1-201ENSMUST00000031673 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Rnf40Q3U319 Defb12-201ENSMUST00000062113 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Rnf40Q3U319 Obp1b-201ENSMUST00000088198 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Rnf40Q3U319 Cbx7-203ENSMUST00000109616 2899 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Rnf40Q3U319 Sorcs1-203ENSMUST00000164039 7241 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Rnf40Q3U319 Vps18-201ENSMUST00000037280 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Rnf40Q3U319 Mindy1-201ENSMUST00000039537 2800 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Rnf40Q3U319 Armc5-201ENSMUST00000044660 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Rnf40Q3U319 Dcc-202ENSMUST00000114943 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
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