Protein–RNA interactions for Protein: Q3U2K5

Kdm4d, Lysine-specific demethylase 4D, mousemouse

Predictions only

Length 510 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kdm4dQ3U2K5 Gm5525-201ENSMUST00000190438 1312 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Kdm4dQ3U2K5 C1qtnf9-201ENSMUST00000025940 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Kdm4dQ3U2K5 Cyth1-201ENSMUST00000017276 3135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Kdm4dQ3U2K5 Styxl1-208ENSMUST00000178515 1651 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Kdm4dQ3U2K5 Adcyap1r1-201ENSMUST00000070736 3695 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Kdm4dQ3U2K5 Rai1-202ENSMUST00000090806 7217 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Kdm4dQ3U2K5 Alpk3-201ENSMUST00000107348 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Kdm4dQ3U2K5 Fgd6-201ENSMUST00000020208 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Kdm4dQ3U2K5 Ralgps2-207ENSMUST00000188656 2481 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Kdm4dQ3U2K5 Nrg1-201ENSMUST00000073884 2452 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Kdm4dQ3U2K5 Mnt-201ENSMUST00000000291 4590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Kdm4dQ3U2K5 Mfsd13b-201ENSMUST00000033166 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Kdm4dQ3U2K5 Tspan32-202ENSMUST00000075172 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Kdm4dQ3U2K5 Zc3h7b-201ENSMUST00000109554 5958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Kdm4dQ3U2K5 Wnt16-202ENSMUST00000128245 3285 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Kdm4dQ3U2K5 Sox7-201ENSMUST00000079652 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Kdm4dQ3U2K5 Rims1-205ENSMUST00000097811 6446 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Kdm4dQ3U2K5 Tnks1bp1-201ENSMUST00000048400 4799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Kdm4dQ3U2K5 Ndel1-202ENSMUST00000101017 1646 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Kdm4dQ3U2K5 Kcp-203ENSMUST00000101614 4885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Kdm4dQ3U2K5 Sp3-202ENSMUST00000102689 4181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Kdm4dQ3U2K5 Gm11985-201ENSMUST00000122910 1007 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Kdm4dQ3U2K5 Gm10714-201ENSMUST00000131346 874 ntTSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Kdm4dQ3U2K5 Gm14249-201ENSMUST00000156239 1017 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Kdm4dQ3U2K5 Gm15852-201ENSMUST00000159701 915 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Kdm4dQ3U2K5 Gm38304-201ENSMUST00000161826 600 ntTSL 3 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Kdm4dQ3U2K5 Gm28982-201ENSMUST00000186895 512 ntTSL 3 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Kdm4dQ3U2K5 Gm44100-201ENSMUST00000204329 436 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Kdm4dQ3U2K5 4930448A20Rik-201ENSMUST00000205988 1034 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Kdm4dQ3U2K5 Gm45765-201ENSMUST00000212027 1035 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Kdm4dQ3U2K5 AC153954.1-201ENSMUST00000216959 255 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Kdm4dQ3U2K5 Gm5369-201ENSMUST00000217499 588 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Kdm4dQ3U2K5 4930569F06Rik-201ENSMUST00000036821 433 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Kdm4dQ3U2K5 Mill2-201ENSMUST00000072386 1121 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Kdm4dQ3U2K5 Zfp957-202ENSMUST00000161649 2751 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Kdm4dQ3U2K5 Micu1-204ENSMUST00000165563 2442 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Kdm4dQ3U2K5 Thegl-201ENSMUST00000031161 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Kdm4dQ3U2K5 Arhgap12-211ENSMUST00000182383 2500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Kdm4dQ3U2K5 Arl13b-201ENSMUST00000089289 3528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Kdm4dQ3U2K5 Cyp2j13-203ENSMUST00000107078 1493 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Kdm4dQ3U2K5 Cd8b1-201ENSMUST00000065248 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Kdm4dQ3U2K5 Nr2c2-202ENSMUST00000113463 2368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Kdm4dQ3U2K5 Ppp6r3-202ENSMUST00000113997 4952 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Kdm4dQ3U2K5 Arhgef17-201ENSMUST00000107032 10190 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Kdm4dQ3U2K5 Vps4b-201ENSMUST00000094646 4633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Kdm4dQ3U2K5 Dnmbp-202ENSMUST00000212032 5074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Kdm4dQ3U2K5 Celsr1-201ENSMUST00000016172 10879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Kdm4dQ3U2K5 March7-203ENSMUST00000102748 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Kdm4dQ3U2K5 Plch2-206ENSMUST00000135665 4349 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Kdm4dQ3U2K5 Phactr3-205ENSMUST00000108917 4858 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Kdm4dQ3U2K5 Drc3-202ENSMUST00000094140 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Kdm4dQ3U2K5 Tfe3-203ENSMUST00000101695 2989 ntTSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Kdm4dQ3U2K5 Rabepk-207ENSMUST00000145903 2968 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Kdm4dQ3U2K5 Atg7-212ENSMUST00000182902 2543 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Kdm4dQ3U2K5 Bptf-203ENSMUST00000106763 12036 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Kdm4dQ3U2K5 C77080-203ENSMUST00000106051 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Kdm4dQ3U2K5 C77080-202ENSMUST00000097873 5033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Kdm4dQ3U2K5 Mcm8-202ENSMUST00000066559 3397 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Kdm4dQ3U2K5 Myh3-201ENSMUST00000007301 5992 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Kdm4dQ3U2K5 Ipo13-201ENSMUST00000036156 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Kdm4dQ3U2K5 S1pr1-201ENSMUST00000055676 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Kdm4dQ3U2K5 Lsp1-205ENSMUST00000105968 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Kdm4dQ3U2K5 Psmd9-201ENSMUST00000100729 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Kdm4dQ3U2K5 Lmbr1-203ENSMUST00000196321 3422 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Kdm4dQ3U2K5 Eif3j1-201ENSMUST00000028668 5413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Kdm4dQ3U2K5 Ighg2c-201ENSMUST00000103416 1214 ntAPPRIS P5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Kdm4dQ3U2K5 Mdk-ps1-201ENSMUST00000119782 321 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Kdm4dQ3U2K5 Smpd4-223ENSMUST00000172182 516 ntTSL 3 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Kdm4dQ3U2K5 Gm20537-202ENSMUST00000173131 889 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Kdm4dQ3U2K5 Gm27530-201ENSMUST00000184096 98 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Kdm4dQ3U2K5 Gm28071-201ENSMUST00000190355 478 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Kdm4dQ3U2K5 Pex1-208ENSMUST00000195894 528 ntTSL 3 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Kdm4dQ3U2K5 Gm45418-202ENSMUST00000210693 649 ntTSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Kdm4dQ3U2K5 Cotl1-203ENSMUST00000211873 826 ntTSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Kdm4dQ3U2K5 1700027J07Rik-202ENSMUST00000215747 1060 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Kdm4dQ3U2K5 Gm5455-201ENSMUST00000058710 715 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Kdm4dQ3U2K5 Ifi27-205ENSMUST00000085065 977 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Kdm4dQ3U2K5 Grid1-201ENSMUST00000043349 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Kdm4dQ3U2K5 Spryd7-201ENSMUST00000022497 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Kdm4dQ3U2K5 Prrc2a-201ENSMUST00000025253 6888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Kdm4dQ3U2K5 Vcl-201ENSMUST00000022369 5267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Kdm4dQ3U2K5 2310035C23Rik-201ENSMUST00000039173 4328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Kdm4dQ3U2K5 Bad-201ENSMUST00000025910 1451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Kdm4dQ3U2K5 Zfp369-203ENSMUST00000130799 1580 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Kdm4dQ3U2K5 Astn1-202ENSMUST00000170718 2927 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Kdm4dQ3U2K5 Sec61g-203ENSMUST00000109643 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Kdm4dQ3U2K5 Gata3-201ENSMUST00000102976 3215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Kdm4dQ3U2K5 Slc39a9-204ENSMUST00000217889 2155 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Kdm4dQ3U2K5 Coro2b-201ENSMUST00000048043 3610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Kdm4dQ3U2K5 Anxa11-201ENSMUST00000022416 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Kdm4dQ3U2K5 Gucy2e-201ENSMUST00000021259 8331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Kdm4dQ3U2K5 Zfp236-201ENSMUST00000171071 9626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Kdm4dQ3U2K5 Tgfbr2-201ENSMUST00000035014 3476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Kdm4dQ3U2K5 Gm13812-201ENSMUST00000118061 1347 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Kdm4dQ3U2K5 Gm13810-201ENSMUST00000118584 1347 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Kdm4dQ3U2K5 Rorc-204ENSMUST00000200009 1543 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Kdm4dQ3U2K5 Mcfd2-204ENSMUST00000144236 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Kdm4dQ3U2K5 Wdcp-205ENSMUST00000220215 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Kdm4dQ3U2K5 Trpv6-203ENSMUST00000201471 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Kdm4dQ3U2K5 Gpa33-202ENSMUST00000060833 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 71.8 ms