Protein–RNA interactions for Protein: Q3U2C5

Rnf149, E3 ubiquitin-protein ligase RNF149, mousemouse

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Length 394 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf149Q3U2C5 Fam206a-201ENSMUST00000045368 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
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Rnf149Q3U2C5 Ifnar1-201ENSMUST00000023689 3909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Rnf149Q3U2C5 Smtn-202ENSMUST00000020721 3335 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Rnf149Q3U2C5 Dnajb5-203ENSMUST00000098112 3093 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Rnf149Q3U2C5 Tpcn2-201ENSMUST00000058022 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Rnf149Q3U2C5 Ino80c-204ENSMUST00000153360 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Rnf149Q3U2C5 Ank2-217ENSMUST00000182610 2231 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
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Rnf149Q3U2C5 Ctif-201ENSMUST00000165559 6173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
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Rnf149Q3U2C5 Hs3st1-202ENSMUST00000117944 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
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Rnf149Q3U2C5 Serpine3-201ENSMUST00000171692 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
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Rnf149Q3U2C5 Ift20-202ENSMUST00000108275 582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Rnf149Q3U2C5 Apoc1-202ENSMUST00000108451 532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
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Rnf149Q3U2C5 Shisa5-203ENSMUST00000154184 1038 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
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Rnf149Q3U2C5 Lsm7-208ENSMUST00000220225 1129 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Rnf149Q3U2C5 Lrp8os1-201ENSMUST00000030352 672 ntTSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Rnf149Q3U2C5 Trappc4-201ENSMUST00000034623 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Rnf149Q3U2C5 Lats2-202ENSMUST00000038381 933 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
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Rnf149Q3U2C5 Treh-201ENSMUST00000034609 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Rnf149Q3U2C5 Lox-201ENSMUST00000025409 3604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Rnf149Q3U2C5 Fam210b-201ENSMUST00000028995 3617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Rnf149Q3U2C5 Dcaf8-202ENSMUST00000191689 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
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Rnf149Q3U2C5 Gm26615-201ENSMUST00000181522 3201 ntTSL 2 BASIC10.95□□□□□ -0.66
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