Protein–RNA interactions for Protein: Q3TVC7

Ccndbp1, Cyclin-D1-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 356 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccndbp1Q3TVC7 Traf7-201ENSMUST00000070777 2384 ntTSL 5 BASIC12.58□□□□□ -0.4
Ccndbp1Q3TVC7 Tmc4-202ENSMUST00000121743 2204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Ccndbp1Q3TVC7 Specc1-213ENSMUST00000202179 6676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Ccndbp1Q3TVC7 Gm14340-201ENSMUST00000148700 1913 ntTSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Ccndbp1Q3TVC7 Zmym3-205ENSMUST00000119699 1750 ntTSL 5 BASIC12.58□□□□□ -0.4
Ccndbp1Q3TVC7 Armt1-203ENSMUST00000118544 5044 ntTSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Ccndbp1Q3TVC7 Abhd14b-207ENSMUST00000213179 1627 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.58□□□□□ -0.4
Ccndbp1Q3TVC7 Mtmr10-201ENSMUST00000032736 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Ccndbp1Q3TVC7 Galc-201ENSMUST00000021390 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Ccndbp1Q3TVC7 Vat1l-201ENSMUST00000049509 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Ccndbp1Q3TVC7 Gng5-202ENSMUST00000118280 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Ccndbp1Q3TVC7 Atp9a-201ENSMUST00000029060 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Ccndbp1Q3TVC7 Kmt5b-207ENSMUST00000113974 4150 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.58□□□□□ -0.4
Ccndbp1Q3TVC7 Camsap3-205ENSMUST00000207432 3865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Ccndbp1Q3TVC7 Zfp957-202ENSMUST00000161649 2751 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.58□□□□□ -0.4
Ccndbp1Q3TVC7 Poc1a-201ENSMUST00000072206 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Ccndbp1Q3TVC7 Lrrfip2-213ENSMUST00000216430 1525 ntTSL 5 BASIC12.57□□□□□ -0.4
Ccndbp1Q3TVC7 Hdac5-204ENSMUST00000107152 3788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Ccndbp1Q3TVC7 Ocln-201ENSMUST00000022140 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Ccndbp1Q3TVC7 Tbx4-203ENSMUST00000108047 3153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.57□□□□□ -0.4
Ccndbp1Q3TVC7 Gm11766-201ENSMUST00000143428 3018 ntTSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Ccndbp1Q3TVC7 Atp8a2-202ENSMUST00000131670 1725 ntTSL 2 BASIC12.57□□□□□ -0.4
Ccndbp1Q3TVC7 9330199G10Rik-202ENSMUST00000221607 1728 ntTSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Ccndbp1Q3TVC7 1700047I17Rik2-201ENSMUST00000177978 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Ccndbp1Q3TVC7 Nrros-208ENSMUST00000143682 3577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Ccndbp1Q3TVC7 Eif2s1-201ENSMUST00000071230 3405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Ccndbp1Q3TVC7 4732414G09Rik-201ENSMUST00000156243 2422 ntTSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Ccndbp1Q3TVC7 Gm8522-201ENSMUST00000118416 1929 ntBASIC12.57□□□□□ -0.4
Ccndbp1Q3TVC7 Gm43267-201ENSMUST00000199664 1796 ntBASIC12.57□□□□□ -0.4
Ccndbp1Q3TVC7 Npr2-202ENSMUST00000107874 3480 ntTSL 5 BASIC12.57□□□□□ -0.4
Ccndbp1Q3TVC7 Trav4d-2-201ENSMUST00000120914 335 ntBASIC12.57□□□□□ -0.4
Ccndbp1Q3TVC7 Gm14832-201ENSMUST00000121289 322 ntBASIC12.57□□□□□ -0.4
Ccndbp1Q3TVC7 Ggt1-208ENSMUST00000134503 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Ccndbp1Q3TVC7 1700066O22Rik-203ENSMUST00000150994 961 ntTSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Ccndbp1Q3TVC7 1810008B01Rik-201ENSMUST00000162325 829 ntTSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Ccndbp1Q3TVC7 Commd6-203ENSMUST00000168587 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Ccndbp1Q3TVC7 Pagr1b-201ENSMUST00000172958 693 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.57□□□□□ -0.4
Ccndbp1Q3TVC7 BC023719-201ENSMUST00000174728 978 ntTSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Ccndbp1Q3TVC7 Gm27017-201ENSMUST00000183031 656 ntTSL 3 BASIC12.57□□□□□ -0.4
Ccndbp1Q3TVC7 Gm31728-201ENSMUST00000192164 435 ntTSL 3 BASIC12.57□□□□□ -0.4
Ccndbp1Q3TVC7 Gm44711-201ENSMUST00000205414 1264 ntBASIC12.57□□□□□ -0.4
Ccndbp1Q3TVC7 Il15-202ENSMUST00000209363 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Ccndbp1Q3TVC7 Tm2d3-201ENSMUST00000032726 908 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Ccndbp1Q3TVC7 Ifi27-202ENSMUST00000076702 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Ccndbp1Q3TVC7 Rbm12b2-201ENSMUST00000063839 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Ccndbp1Q3TVC7 Vmn1r45-207ENSMUST00000228492 2849 ntBASIC12.57□□□□□ -0.4
Ccndbp1Q3TVC7 Lmna-201ENSMUST00000029699 3156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Ccndbp1Q3TVC7 Prkch-201ENSMUST00000021527 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Ccndbp1Q3TVC7 Tirap-203ENSMUST00000176531 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Ccndbp1Q3TVC7 Celf2-225ENSMUST00000183091 2177 ntTSL 5 BASIC12.57□□□□□ -0.4
Ccndbp1Q3TVC7 Rbm5-201ENSMUST00000035199 3064 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.57□□□□□ -0.4
Ccndbp1Q3TVC7 Astl-201ENSMUST00000059839 2377 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Ccndbp1Q3TVC7 2310026I22Rik-201ENSMUST00000180941 1300 ntTSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Ccndbp1Q3TVC7 Slc27a2-201ENSMUST00000061491 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Ccndbp1Q3TVC7 Smim1-213ENSMUST00000182151 5091 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.57□□□□□ -0.4
Ccndbp1Q3TVC7 Tex10-201ENSMUST00000030030 3102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Ccndbp1Q3TVC7 Tssk5-201ENSMUST00000071119 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Ccndbp1Q3TVC7 Dph6-201ENSMUST00000028640 2632 ntTSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Ccndbp1Q3TVC7 Gm2670-201ENSMUST00000180668 2804 ntTSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Ccndbp1Q3TVC7 Pnpla6-202ENSMUST00000111070 4496 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.56□□□□□ -0.4
Ccndbp1Q3TVC7 Rapgef3-204ENSMUST00000128775 3586 ntTSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Ccndbp1Q3TVC7 Gm26516-201ENSMUST00000180943 1397 ntTSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Ccndbp1Q3TVC7 Reps2-201ENSMUST00000101102 7630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Ccndbp1Q3TVC7 Ahi1-201ENSMUST00000105525 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Ccndbp1Q3TVC7 Csnk1a1-202ENSMUST00000163205 3204 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Ccndbp1Q3TVC7 Plxdc1-201ENSMUST00000017561 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Ccndbp1Q3TVC7 Tmc4-201ENSMUST00000038743 2310 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Ccndbp1Q3TVC7 Plekhn1-203ENSMUST00000217885 1982 ntTSL 5 BASIC12.56□□□□□ -0.4
Ccndbp1Q3TVC7 Zfyve1-203ENSMUST00000221919 4420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Ccndbp1Q3TVC7 Abcb9-201ENSMUST00000031354 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Ccndbp1Q3TVC7 Pmp2-201ENSMUST00000029034 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Ccndbp1Q3TVC7 E330021D16Rik-203ENSMUST00000204830 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Ccndbp1Q3TVC7 Syt16-203ENSMUST00000221220 8156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Ccndbp1Q3TVC7 Creb3l2-201ENSMUST00000041093 7082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Ccndbp1Q3TVC7 Hnrnpr-201ENSMUST00000084219 2647 ntTSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Ccndbp1Q3TVC7 Slc20a1-202ENSMUST00000110315 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Ccndbp1Q3TVC7 Etfrf1-202ENSMUST00000111719 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.56□□□□□ -0.4
Ccndbp1Q3TVC7 Gm11793-201ENSMUST00000120433 981 ntBASIC12.56□□□□□ -0.4
Ccndbp1Q3TVC7 Gm13786-201ENSMUST00000122371 333 ntBASIC12.56□□□□□ -0.4
Ccndbp1Q3TVC7 Gm13966-201ENSMUST00000148420 832 ntTSL 3 BASIC12.56□□□□□ -0.4
Ccndbp1Q3TVC7 Rprl1-201ENSMUST00000158050 327 ntBASIC12.56□□□□□ -0.4
Ccndbp1Q3TVC7 Ppp3cb-202ENSMUST00000159027 3831 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Ccndbp1Q3TVC7 Gm18062-201ENSMUST00000208020 547 ntBASIC12.56□□□□□ -0.4
Ccndbp1Q3TVC7 Gm18055-201ENSMUST00000208254 547 ntBASIC12.56□□□□□ -0.4
Ccndbp1Q3TVC7 Gm5950-201ENSMUST00000213337 772 ntBASIC12.56□□□□□ -0.4
Ccndbp1Q3TVC7 Gm7046-201ENSMUST00000221351 977 ntBASIC12.56□□□□□ -0.4
Ccndbp1Q3TVC7 Gm34084-201ENSMUST00000222236 1298 ntTSL 5 BASIC12.56□□□□□ -0.4
Ccndbp1Q3TVC7 Morn2-202ENSMUST00000227729 656 ntBASIC12.56□□□□□ -0.4
Ccndbp1Q3TVC7 4930569F06Rik-201ENSMUST00000036821 433 ntBASIC12.56□□□□□ -0.4
Ccndbp1Q3TVC7 Gm9996-201ENSMUST00000070359 913 ntBASIC12.56□□□□□ -0.4
Ccndbp1Q3TVC7 Rnase2b-201ENSMUST00000075648 759 ntAPPRIS P1 BASIC12.56□□□□□ -0.4
Ccndbp1Q3TVC7 Olfr366-201ENSMUST00000091001 930 ntAPPRIS P1 BASIC12.56□□□□□ -0.4
Ccndbp1Q3TVC7 Cacna1g-205ENSMUST00000107786 7984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Ccndbp1Q3TVC7 Gm36235-201ENSMUST00000223158 1694 ntTSL 5 BASIC12.56□□□□□ -0.4
Ccndbp1Q3TVC7 Slc44a4-201ENSMUST00000007249 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Ccndbp1Q3TVC7 Camsap3-202ENSMUST00000171962 3925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Ccndbp1Q3TVC7 Trf-203ENSMUST00000112645 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Ccndbp1Q3TVC7 Mroh5-202ENSMUST00000110021 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Ccndbp1Q3TVC7 Ercc8-201ENSMUST00000054835 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Ccndbp1Q3TVC7 Cpped1-201ENSMUST00000073371 1922 ntTSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.6 ms