Protein–RNA interactions for Protein: Q3TMP1

Gtf3c3, General transcription factor IIIC, polypeptide 3, mousemouse

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Length 882 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtf3c3Q3TMP1 Jam3-201ENSMUST00000034472 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Gtf3c3Q3TMP1 Adk-201ENSMUST00000045376 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Gtf3c3Q3TMP1 Gjb5-201ENSMUST00000046498 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Gtf3c3Q3TMP1 Tmem107-201ENSMUST00000075980 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Gtf3c3Q3TMP1 Arap1-202ENSMUST00000084896 4926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Gtf3c3Q3TMP1 Fchsd1-201ENSMUST00000043437 4270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Gtf3c3Q3TMP1 Zc3h18-201ENSMUST00000017622 3810 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Gtf3c3Q3TMP1 Pik3r1-202ENSMUST00000055518 7113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Gtf3c3Q3TMP1 Spcs3-201ENSMUST00000067476 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Gtf3c3Q3TMP1 Gm10465-201ENSMUST00000223133 3334 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Gtf3c3Q3TMP1 Prss57-203ENSMUST00000169684 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Gtf3c3Q3TMP1 Aar2-202ENSMUST00000109570 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Gtf3c3Q3TMP1 AC154171.2-201ENSMUST00000225219 2652 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
Gtf3c3Q3TMP1 Rxfp2-201ENSMUST00000065745 2539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Gtf3c3Q3TMP1 Sfrp4-203ENSMUST00000222464 4049 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Gtf3c3Q3TMP1 Tmc5-202ENSMUST00000098088 3774 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Gtf3c3Q3TMP1 1700019D03Rik-201ENSMUST00000050567 3641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Gtf3c3Q3TMP1 Samd5-201ENSMUST00000100070 6818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Gtf3c3Q3TMP1 Pigb-206ENSMUST00000184035 3221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Gtf3c3Q3TMP1 Abcb8-203ENSMUST00000115077 3074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Gtf3c3Q3TMP1 Stx1b-201ENSMUST00000106267 4536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Gtf3c3Q3TMP1 Tti2-204ENSMUST00000210129 4159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Gtf3c3Q3TMP1 Rac1-201ENSMUST00000080537 4159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Gtf3c3Q3TMP1 Gm12928-201ENSMUST00000117115 573 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
Gtf3c3Q3TMP1 Gm11637-201ENSMUST00000120601 592 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
Gtf3c3Q3TMP1 Gm15755-201ENSMUST00000133698 659 ntTSL 3 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Gtf3c3Q3TMP1 Rpl34-203ENSMUST00000133802 711 ntTSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Gtf3c3Q3TMP1 Ift27-201ENSMUST00000016781 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Gtf3c3Q3TMP1 Gm26787-201ENSMUST00000180474 608 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Gtf3c3Q3TMP1 AL593843.1-201ENSMUST00000195891 145 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
Gtf3c3Q3TMP1 AC135669.1-201ENSMUST00000213585 412 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
Gtf3c3Q3TMP1 Gm17794-201ENSMUST00000220252 955 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
Gtf3c3Q3TMP1 Gm7446-201ENSMUST00000221035 1240 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
Gtf3c3Q3TMP1 Olfr615-201ENSMUST00000098198 942 ntAPPRIS P1 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Gtf3c3Q3TMP1 CT868720.1-201ENSMUST00000223069 2544 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
Gtf3c3Q3TMP1 Gm45161-201ENSMUST00000207316 2263 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
Gtf3c3Q3TMP1 Myo15b-208ENSMUST00000222123 5154 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Gtf3c3Q3TMP1 Lgi4-201ENSMUST00000039775 4037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Gtf3c3Q3TMP1 Kalrn-203ENSMUST00000114947 2922 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Gtf3c3Q3TMP1 Elmsan1-201ENSMUST00000046266 6848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Gtf3c3Q3TMP1 Enah-201ENSMUST00000078719 2889 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Gtf3c3Q3TMP1 Gm14149-201ENSMUST00000123048 1853 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Gtf3c3Q3TMP1 Ilf3-202ENSMUST00000115414 3606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Gtf3c3Q3TMP1 Epb41l1-203ENSMUST00000103136 6249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Gtf3c3Q3TMP1 Gm35040-201ENSMUST00000206829 5094 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.04
Gtf3c3Q3TMP1 Gm10646-201ENSMUST00000213227 3293 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.04
Gtf3c3Q3TMP1 Ece1-201ENSMUST00000102518 4816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Gtf3c3Q3TMP1 Gucy1a3-204ENSMUST00000193924 4710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Gtf3c3Q3TMP1 Clpb-201ENSMUST00000001884 4627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Gtf3c3Q3TMP1 Tmem269-202ENSMUST00000212054 1504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Gtf3c3Q3TMP1 Gm26819-201ENSMUST00000180656 5128 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
Gtf3c3Q3TMP1 Mmel1-207ENSMUST00000163732 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Gtf3c3Q3TMP1 Ralgps2-209ENSMUST00000189316 2924 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Gtf3c3Q3TMP1 Cdc42se1-201ENSMUST00000053872 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Gtf3c3Q3TMP1 Rwdd2a-201ENSMUST00000034988 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Gtf3c3Q3TMP1 Nup93-201ENSMUST00000079961 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Gtf3c3Q3TMP1 Rbm47-202ENSMUST00000094757 4643 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Gtf3c3Q3TMP1 Pipox-201ENSMUST00000017597 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Gtf3c3Q3TMP1 Gm21136-201ENSMUST00000186812 2575 ntBASIC14.77□□□□□ -0.04
Gtf3c3Q3TMP1 Tssc4-202ENSMUST00000105920 895 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Gtf3c3Q3TMP1 Gm14350-201ENSMUST00000116642 640 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
Gtf3c3Q3TMP1 Mup-ps23-201ENSMUST00000118063 630 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
Gtf3c3Q3TMP1 Gm13612-201ENSMUST00000119276 390 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
Gtf3c3Q3TMP1 2700012I20Rik-201ENSMUST00000180525 684 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Gtf3c3Q3TMP1 2410002F23Rik-214ENSMUST00000186606 748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
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Gtf3c3Q3TMP1 Gm8515-201ENSMUST00000194852 576 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
Gtf3c3Q3TMP1 Mzt2-201ENSMUST00000023351 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Gtf3c3Q3TMP1 Tspan8-201ENSMUST00000035563 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Gtf3c3Q3TMP1 Ppm1g-201ENSMUST00000031032 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Gtf3c3Q3TMP1 Itgal-202ENSMUST00000117762 5222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Gtf3c3Q3TMP1 Pla2g4c-201ENSMUST00000043612 3382 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Gtf3c3Q3TMP1 Gm20605-201ENSMUST00000177545 4464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Gtf3c3Q3TMP1 Camsap3-205ENSMUST00000207432 3865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Gtf3c3Q3TMP1 Zfyve26-203ENSMUST00000218377 2726 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Gtf3c3Q3TMP1 Dennd4b-201ENSMUST00000098914 5423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Gtf3c3Q3TMP1 Grm2-201ENSMUST00000023959 4711 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Gtf3c3Q3TMP1 Pou6f1-201ENSMUST00000058274 2523 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Gtf3c3Q3TMP1 Gpat3-202ENSMUST00000092990 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Gtf3c3Q3TMP1 Fam53b-207ENSMUST00000106169 4536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Gtf3c3Q3TMP1 Kif1a-202ENSMUST00000112958 5931 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Gtf3c3Q3TMP1 Cntnap1-201ENSMUST00000103109 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Gtf3c3Q3TMP1 Nrf1-209ENSMUST00000115209 2406 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Gtf3c3Q3TMP1 Plekha5-212ENSMUST00000204876 1928 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Gtf3c3Q3TMP1 Steap3-204ENSMUST00000112643 2873 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Gtf3c3Q3TMP1 Fhl2-202ENSMUST00000185893 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Gtf3c3Q3TMP1 Gm45338-207ENSMUST00000211499 1405 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Gtf3c3Q3TMP1 Prr3-203ENSMUST00000172429 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Gtf3c3Q3TMP1 Ntng2-202ENSMUST00000071201 1881 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Gtf3c3Q3TMP1 Cbfa2t2-202ENSMUST00000099178 3247 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Gtf3c3Q3TMP1 Gnb4-205ENSMUST00000155737 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Gtf3c3Q3TMP1 Gm37885-201ENSMUST00000192568 1391 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Gtf3c3Q3TMP1 Ccdc85a-202ENSMUST00000093253 5431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Gtf3c3Q3TMP1 Lmbr1-201ENSMUST00000055195 4926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Gtf3c3Q3TMP1 Atxn2l-203ENSMUST00000167759 4023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Gtf3c3Q3TMP1 Fmod-201ENSMUST00000048183 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Gtf3c3Q3TMP1 Abca7-202ENSMUST00000132517 6696 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Gtf3c3Q3TMP1 Gja8-201ENSMUST00000062944 6940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Gtf3c3Q3TMP1 Eif2s1-201ENSMUST00000071230 3405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Gtf3c3Q3TMP1 Myl4-203ENSMUST00000106957 943 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
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