Protein–RNA interactions for Protein: Q3TIR1

Trappc13, Trafficking protein particle complex subunit 13, mousemouse

Predictions only

Length 417 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc13Q3TIR1 Gm26515-201ENSMUST00000181141 996 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Trappc13Q3TIR1 Kdelr1-203ENSMUST00000211234 832 ntTSL 2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Trappc13Q3TIR1 Gm36198-201ENSMUST00000217490 416 ntTSL 3 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Trappc13Q3TIR1 AC154462.2-201ENSMUST00000227519 370 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Trappc13Q3TIR1 Rps21-201ENSMUST00000059080 394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Trappc13Q3TIR1 Prkag2-202ENSMUST00000076306 2838 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Trappc13Q3TIR1 Cisd2-201ENSMUST00000029815 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Trappc13Q3TIR1 Il22ra1-201ENSMUST00000102546 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Trappc13Q3TIR1 Zfp516-202ENSMUST00000171238 7725 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Trappc13Q3TIR1 Zfp516-201ENSMUST00000071233 7703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Trappc13Q3TIR1 Otub2-202ENSMUST00000101094 3228 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Trappc13Q3TIR1 D730001G18Rik-202ENSMUST00000191407 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Trappc13Q3TIR1 Rbm12b2-201ENSMUST00000063839 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Trappc13Q3TIR1 Lrrfip1-204ENSMUST00000097650 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Trappc13Q3TIR1 Kdelr1-201ENSMUST00000002855 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Trappc13Q3TIR1 Gm15594-201ENSMUST00000137958 2215 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Trappc13Q3TIR1 Gm38569-201ENSMUST00000205476 2228 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Trappc13Q3TIR1 Mfsd13b-205ENSMUST00000216241 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Trappc13Q3TIR1 Alg12-201ENSMUST00000043087 1793 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Trappc13Q3TIR1 Cyp4f40-201ENSMUST00000165061 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Trappc13Q3TIR1 Ctnnb1-214ENSMUST00000178812 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Trappc13Q3TIR1 Akap10-202ENSMUST00000102650 3874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Trappc13Q3TIR1 A430108G06Rik-201ENSMUST00000153461 1428 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Trappc13Q3TIR1 Dab2ip-201ENSMUST00000065001 6392 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Trappc13Q3TIR1 Dpyd-201ENSMUST00000039177 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Trappc13Q3TIR1 Hkdc1-201ENSMUST00000020277 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Trappc13Q3TIR1 Jmjd1c-211ENSMUST00000174408 8377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Trappc13Q3TIR1 Jmjd1c-201ENSMUST00000051446 8382 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Trappc13Q3TIR1 AL732309.1-201ENSMUST00000228627 2045 ntAPPRIS P1 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Trappc13Q3TIR1 Lnx1-206ENSMUST00000121690 2302 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Trappc13Q3TIR1 Pdzrn4-202ENSMUST00000169942 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Trappc13Q3TIR1 Lnx1-201ENSMUST00000039744 2727 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Trappc13Q3TIR1 Txn2-202ENSMUST00000100486 676 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Trappc13Q3TIR1 Styxl1-202ENSMUST00000111161 963 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Trappc13Q3TIR1 Mir1247-201ENSMUST00000116706 82 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Trappc13Q3TIR1 Acyp1-204ENSMUST00000121930 634 ntTSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Trappc13Q3TIR1 Pyy-202ENSMUST00000127381 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Trappc13Q3TIR1 Atp6v0e-201ENSMUST00000015719 794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Trappc13Q3TIR1 Spdye4b-202ENSMUST00000159781 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Trappc13Q3TIR1 4933436H12Rik-201ENSMUST00000207304 658 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Trappc13Q3TIR1 Colca2-202ENSMUST00000215038 1269 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Trappc13Q3TIR1 AC130829.1-201ENSMUST00000221548 494 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Trappc13Q3TIR1 Tnfrsf17-201ENSMUST00000023140 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Trappc13Q3TIR1 1700028J19Rik-201ENSMUST00000037220 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Trappc13Q3TIR1 Tmem256-201ENSMUST00000094065 492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Trappc13Q3TIR1 Sirt3-201ENSMUST00000026559 1461 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Trappc13Q3TIR1 Lrfn5-201ENSMUST00000055815 4410 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Trappc13Q3TIR1 Tmem8b-201ENSMUST00000107864 4726 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Trappc13Q3TIR1 Pcdhgb7-201ENSMUST00000194928 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Trappc13Q3TIR1 Pdxk-201ENSMUST00000041616 5124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Trappc13Q3TIR1 Rims1-206ENSMUST00000115273 6107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Trappc13Q3TIR1 Dmbt1-201ENSMUST00000084509 6243 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Trappc13Q3TIR1 Olfr222-203ENSMUST00000215339 2166 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Trappc13Q3TIR1 Cnot10-201ENSMUST00000070117 2853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Trappc13Q3TIR1 Rab11fip1-203ENSMUST00000209377 3769 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Trappc13Q3TIR1 Zcchc11-202ENSMUST00000097925 5865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Trappc13Q3TIR1 Arvcf-204ENSMUST00000115613 4800 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Trappc13Q3TIR1 Shank2-202ENSMUST00000105900 8169 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Trappc13Q3TIR1 Gm43174-201ENSMUST00000195914 2445 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Trappc13Q3TIR1 Aldoc-202ENSMUST00000102478 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Trappc13Q3TIR1 Celf2-205ENSMUST00000114927 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Trappc13Q3TIR1 Car14-201ENSMUST00000036181 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Trappc13Q3TIR1 Gm7537-201ENSMUST00000221660 1414 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Trappc13Q3TIR1 Cib2-201ENSMUST00000041901 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Trappc13Q3TIR1 Egfl7-201ENSMUST00000100290 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Trappc13Q3TIR1 Nrap-203ENSMUST00000095947 5214 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Trappc13Q3TIR1 Pcdh15-238ENSMUST00000193739 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Trappc13Q3TIR1 Tubgcp2-201ENSMUST00000026547 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Trappc13Q3TIR1 Terb1-201ENSMUST00000064576 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Trappc13Q3TIR1 Steap3-202ENSMUST00000112640 2752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Trappc13Q3TIR1 Mybl1-202ENSMUST00000115468 2493 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Trappc13Q3TIR1 Strc-201ENSMUST00000038389 5756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Trappc13Q3TIR1 Gpr26-201ENSMUST00000045840 11571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Trappc13Q3TIR1 Slc2a4-203ENSMUST00000141837 1776 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Trappc13Q3TIR1 Nmt2-202ENSMUST00000091504 1676 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Trappc13Q3TIR1 Fam110a-203ENSMUST00000109864 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Trappc13Q3TIR1 Apbb2-216ENSMUST00000162366 6540 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Trappc13Q3TIR1 Ppm1g-201ENSMUST00000031032 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Trappc13Q3TIR1 Frmd3-201ENSMUST00000084474 4136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Trappc13Q3TIR1 D130043K22Rik-201ENSMUST00000006893 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Trappc13Q3TIR1 Gm24934-201ENSMUST00000103764 111 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Trappc13Q3TIR1 Gm23912-201ENSMUST00000104687 87 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Trappc13Q3TIR1 Mroh5-202ENSMUST00000110021 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Trappc13Q3TIR1 Sgsm1-203ENSMUST00000112324 1102 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Trappc13Q3TIR1 Gm6023-201ENSMUST00000118217 606 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Trappc13Q3TIR1 Gm11658-201ENSMUST00000120913 1008 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Trappc13Q3TIR1 Ggnbp1-202ENSMUST00000122106 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Trappc13Q3TIR1 A430060F13Rik-201ENSMUST00000124176 378 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Trappc13Q3TIR1 Gm13316-201ENSMUST00000140537 691 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Trappc13Q3TIR1 Gm16302-201ENSMUST00000159268 428 ntTSL 3 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Trappc13Q3TIR1 Gm2467-201ENSMUST00000182266 1010 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Trappc13Q3TIR1 Gm6981-201ENSMUST00000182467 1008 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Trappc13Q3TIR1 Gm27514-201ENSMUST00000183692 110 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Trappc13Q3TIR1 Gm37667-201ENSMUST00000193103 752 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Trappc13Q3TIR1 Gm37008-201ENSMUST00000195712 319 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Trappc13Q3TIR1 Gm18187-201ENSMUST00000196476 984 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Trappc13Q3TIR1 Gm42937-201ENSMUST00000197360 752 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Trappc13Q3TIR1 Gm44756-201ENSMUST00000206172 1069 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Trappc13Q3TIR1 Coprs-202ENSMUST00000209371 601 ntTSL 3 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Trappc13Q3TIR1 Tmem108-206ENSMUST00000215136 724 ntTSL 3 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 68.3 ms