Protein–RNA interactions for Protein: Q3TGF2

Fam107b, Protein FAM107B, mousemouse

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Length 131 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam107bQ3TGF2 Scn8a-203ENSMUST00000108908 7030 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.5□□□□□ -0.41
Fam107bQ3TGF2 Gtf2h4-207ENSMUST00000160734 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.5□□□□□ -0.41
Fam107bQ3TGF2 Gm36235-201ENSMUST00000223158 1694 ntTSL 5 BASIC12.5□□□□□ -0.41
Fam107bQ3TGF2 Gm21319-201ENSMUST00000164517 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Fam107bQ3TGF2 Tardbp-204ENSMUST00000105699 1904 ntTSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Fam107bQ3TGF2 D130051D11Rik-201ENSMUST00000189171 6188 ntBASIC12.5□□□□□ -0.41
Fam107bQ3TGF2 Ash2l-210ENSMUST00000166078 2234 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.5□□□□□ -0.41
Fam107bQ3TGF2 Aldh4a1-201ENSMUST00000039818 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Fam107bQ3TGF2 Trim11-202ENSMUST00000108809 3522 ntTSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Fam107bQ3TGF2 Pnpla6-201ENSMUST00000004681 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Fam107bQ3TGF2 Myh13-203ENSMUST00000180845 5991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.5□□□□□ -0.41
Fam107bQ3TGF2 Foxn2-201ENSMUST00000112238 5085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Fam107bQ3TGF2 Map3k12-208ENSMUST00000171565 4318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Fam107bQ3TGF2 Brat1-202ENSMUST00000100505 3431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Fam107bQ3TGF2 Zfp384-206ENSMUST00000112425 2691 ntTSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Fam107bQ3TGF2 Dld-201ENSMUST00000110857 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Fam107bQ3TGF2 Tm9sf1-202ENSMUST00000120041 2164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Fam107bQ3TGF2 Acsl1-202ENSMUST00000110371 2100 ntTSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Fam107bQ3TGF2 Fggy-201ENSMUST00000043335 1910 ntTSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Fam107bQ3TGF2 F3-201ENSMUST00000029771 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Fam107bQ3TGF2 4930423C22Rik-201ENSMUST00000193863 1311 ntBASIC12.49□□□□□ -0.41
Fam107bQ3TGF2 Dlk1-202ENSMUST00000109841 879 ntTSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Fam107bQ3TGF2 Acyp1-203ENSMUST00000117138 735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Fam107bQ3TGF2 Gm14966-202ENSMUST00000129675 649 ntTSL 2 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Fam107bQ3TGF2 Tac2-202ENSMUST00000179960 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Fam107bQ3TGF2 Ighv8-10-201ENSMUST00000199579 358 ntBASIC12.49□□□□□ -0.41
Fam107bQ3TGF2 Gm5312-201ENSMUST00000203728 547 ntBASIC12.49□□□□□ -0.41
Fam107bQ3TGF2 Gm32926-202ENSMUST00000215162 1176 ntTSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Fam107bQ3TGF2 Olfr1227-ps1-201ENSMUST00000215627 928 ntBASIC12.49□□□□□ -0.41
Fam107bQ3TGF2 Gm18165-201ENSMUST00000217426 928 ntBASIC12.49□□□□□ -0.41
Fam107bQ3TGF2 Rbfox2-208ENSMUST00000227930 1218 ntBASIC12.49□□□□□ -0.41
Fam107bQ3TGF2 H2-Oa-201ENSMUST00000025192 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Fam107bQ3TGF2 Tac2-201ENSMUST00000026466 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Fam107bQ3TGF2 Lce1b-201ENSMUST00000029531 647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Fam107bQ3TGF2 Gm11149-201ENSMUST00000068730 1250 ntTSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Fam107bQ3TGF2 Ndst1-201ENSMUST00000169273 6070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Fam107bQ3TGF2 Smim1-214ENSMUST00000182191 3535 ntTSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Fam107bQ3TGF2 Invs-201ENSMUST00000030029 5633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Fam107bQ3TGF2 Als2-204ENSMUST00000163058 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Fam107bQ3TGF2 4932443L11Rik-202ENSMUST00000177130 2827 ntTSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Fam107bQ3TGF2 Rad17-201ENSMUST00000022136 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Fam107bQ3TGF2 Myo15b-201ENSMUST00000040703 2825 ntTSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Fam107bQ3TGF2 Chrng-201ENSMUST00000027470 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Fam107bQ3TGF2 Mybl1-202ENSMUST00000115468 2493 ntTSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Fam107bQ3TGF2 Pbx1-208ENSMUST00000188912 3970 ntTSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Fam107bQ3TGF2 Timd4-201ENSMUST00000068877 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Fam107bQ3TGF2 Usp2-203ENSMUST00000114830 2122 ntTSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Fam107bQ3TGF2 Scrn1-201ENSMUST00000019268 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Fam107bQ3TGF2 Man2b2-201ENSMUST00000031002 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Fam107bQ3TGF2 Gm45449-201ENSMUST00000211485 1960 ntTSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Fam107bQ3TGF2 Tcof1-204ENSMUST00000176630 4529 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Fam107bQ3TGF2 Hoxc10-201ENSMUST00000001699 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Fam107bQ3TGF2 Zfp1-203ENSMUST00000212072 1930 ntTSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Fam107bQ3TGF2 Ces3b-201ENSMUST00000074403 1907 ntTSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Fam107bQ3TGF2 Dscaml1-201ENSMUST00000034592 6886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Fam107bQ3TGF2 Grem1-201ENSMUST00000099575 4148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Fam107bQ3TGF2 Pef1-201ENSMUST00000030563 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Fam107bQ3TGF2 Srr-201ENSMUST00000065211 3699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Fam107bQ3TGF2 AC160405.1-201ENSMUST00000218207 1545 ntBASIC12.48□□□□□ -0.41
Fam107bQ3TGF2 Dnajb4-201ENSMUST00000029669 1497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Fam107bQ3TGF2 Colec12-201ENSMUST00000040069 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Fam107bQ3TGF2 Rgs6-204ENSMUST00000185674 1362 ntTSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Fam107bQ3TGF2 Krt7-201ENSMUST00000068904 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Fam107bQ3TGF2 Gm38901-201ENSMUST00000202448 3008 ntTSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Fam107bQ3TGF2 Rasgrp4-210ENSMUST00000203070 3008 ntTSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Fam107bQ3TGF2 Rdm1-201ENSMUST00000010506 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Fam107bQ3TGF2 Rgs19-203ENSMUST00000108771 1110 ntTSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Fam107bQ3TGF2 Rgs19-205ENSMUST00000108776 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Fam107bQ3TGF2 Gm16202-201ENSMUST00000117532 544 ntBASIC12.48□□□□□ -0.41
Fam107bQ3TGF2 Gm11524-201ENSMUST00000119349 807 ntBASIC12.48□□□□□ -0.41
Fam107bQ3TGF2 Gm15467-201ENSMUST00000120582 445 ntBASIC12.48□□□□□ -0.41
Fam107bQ3TGF2 Mcfd2-202ENSMUST00000129616 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Fam107bQ3TGF2 Gm25911-201ENSMUST00000157621 56 ntBASIC12.48□□□□□ -0.41
Fam107bQ3TGF2 Gm10044-204ENSMUST00000170177 659 ntTSL 3 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Fam107bQ3TGF2 Esd-207ENSMUST00000176957 1117 ntTSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Fam107bQ3TGF2 Ighv8-4-201ENSMUST00000178949 294 ntAPPRIS P1 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Fam107bQ3TGF2 Gm25144-201ENSMUST00000179561 110 ntBASIC12.48□□□□□ -0.41
Fam107bQ3TGF2 Gm25352-201ENSMUST00000179815 110 ntBASIC12.48□□□□□ -0.41
Fam107bQ3TGF2 Hapln3-202ENSMUST00000205782 930 ntTSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Fam107bQ3TGF2 Timm13-204ENSMUST00000219896 542 ntTSL 3 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Fam107bQ3TGF2 Rsph1-201ENSMUST00000024832 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Fam107bQ3TGF2 Ephx4-201ENSMUST00000049146 1279 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Fam107bQ3TGF2 Lyzl4-201ENSMUST00000077706 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Fam107bQ3TGF2 Ppil3-201ENSMUST00000081677 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Fam107bQ3TGF2 Hist1h2bn-201ENSMUST00000091709 381 ntAPPRIS P1 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Fam107bQ3TGF2 Umad1-201ENSMUST00000159168 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Fam107bQ3TGF2 Rbbp5-202ENSMUST00000187505 1977 ntTSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Fam107bQ3TGF2 Olfr1121-202ENSMUST00000213792 1996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Fam107bQ3TGF2 Adk-207ENSMUST00000224069 1818 ntAPPRIS ALT1 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Fam107bQ3TGF2 Rgr-203ENSMUST00000225070 4704 ntBASIC12.48□□□□□ -0.41
Fam107bQ3TGF2 Kat7-203ENSMUST00000103159 3248 ntTSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Fam107bQ3TGF2 Olfr370-203ENSMUST00000214156 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Fam107bQ3TGF2 Vill-202ENSMUST00000074734 2440 ntTSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Fam107bQ3TGF2 Gm8334-201ENSMUST00000112755 1662 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Fam107bQ3TGF2 Ephb2-203ENSMUST00000105846 3653 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Fam107bQ3TGF2 Fbrs-207ENSMUST00000206394 2961 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Fam107bQ3TGF2 Abhd14b-209ENSMUST00000216130 1624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Fam107bQ3TGF2 Pyurf-201ENSMUST00000053386 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Fam107bQ3TGF2 Ywhaq-201ENSMUST00000049531 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Fam107bQ3TGF2 Ikzf4-204ENSMUST00000222067 2688 ntTSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52 ms