Protein–RNA interactions for Protein: Q1PSW8

Trim71, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM71, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 855 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim71Q1PSW8 Abcb6-201ENSMUST00000027396 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Trim71Q1PSW8 Ints6-202ENSMUST00000223585 10883 ntAPPRIS P1 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Trim71Q1PSW8 Fyn-206ENSMUST00000136659 1910 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Trim71Q1PSW8 Rnls-202ENSMUST00000163093 1378 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Trim71Q1PSW8 Epb41l2-207ENSMUST00000218903 4115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Trim71Q1PSW8 Vps52-201ENSMUST00000025178 3332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Trim71Q1PSW8 Capn5-202ENSMUST00000107112 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Trim71Q1PSW8 Ccpg1-208ENSMUST00000150826 2939 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Trim71Q1PSW8 Aff3-202ENSMUST00000039827 6010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Trim71Q1PSW8 Ddx17-201ENSMUST00000054014 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Trim71Q1PSW8 Rapgef3-217ENSMUST00000177352 3395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Trim71Q1PSW8 Thoc5-202ENSMUST00000101615 2116 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Trim71Q1PSW8 Spint5-201ENSMUST00000103097 443 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Trim71Q1PSW8 Fam166b-203ENSMUST00000107929 865 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Trim71Q1PSW8 Zar1l-201ENSMUST00000118769 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Trim71Q1PSW8 Gm16481-201ENSMUST00000119074 1227 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Trim71Q1PSW8 Gm15703-201ENSMUST00000120250 880 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Trim71Q1PSW8 Rtbdn-203ENSMUST00000121880 1223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Trim71Q1PSW8 A630014C17Rik-201ENSMUST00000150973 2984 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Trim71Q1PSW8 Rps28-202ENSMUST00000166693 271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Trim71Q1PSW8 Spint5-202ENSMUST00000180193 443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Trim71Q1PSW8 Ank3-234ENSMUST00000182993 1233 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Trim71Q1PSW8 Nipsnap3a-204ENSMUST00000188045 1099 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Trim71Q1PSW8 Gm36503-201ENSMUST00000204284 875 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Trim71Q1PSW8 Acsm5-207ENSMUST00000207813 1084 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Trim71Q1PSW8 Gm3898-202ENSMUST00000216905 328 ntTSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Trim71Q1PSW8 Defb22-201ENSMUST00000028966 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Trim71Q1PSW8 Olfr398-201ENSMUST00000053874 945 ntAPPRIS P1 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Trim71Q1PSW8 Olfr887-201ENSMUST00000074681 930 ntAPPRIS P1 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Trim71Q1PSW8 Lztr1-201ENSMUST00000023444 3112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Trim71Q1PSW8 Tcf4-230ENSMUST00000201205 2270 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Trim71Q1PSW8 Cdk10-212ENSMUST00000213005 1580 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Trim71Q1PSW8 Riok1-201ENSMUST00000021866 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Trim71Q1PSW8 Gpr19-203ENSMUST00000111932 1711 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Trim71Q1PSW8 Cdc7-203ENSMUST00000117196 2864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Trim71Q1PSW8 Rpap1-203ENSMUST00000110793 5458 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Trim71Q1PSW8 Rtn4rl1-201ENSMUST00000102514 3525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Trim71Q1PSW8 Aire-202ENSMUST00000105395 1630 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Trim71Q1PSW8 Gm36500-201ENSMUST00000221821 1626 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Trim71Q1PSW8 Slc29a1-204ENSMUST00000163492 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Trim71Q1PSW8 Prex1-203ENSMUST00000109246 2386 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Trim71Q1PSW8 Pappa-201ENSMUST00000084501 11027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Trim71Q1PSW8 Asrgl1-201ENSMUST00000049948 4195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Trim71Q1PSW8 Trim25-203ENSMUST00000107896 5590 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
Trim71Q1PSW8 Zfp641-201ENSMUST00000023722 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
Trim71Q1PSW8 Comt-204ENSMUST00000165430 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.35
Trim71Q1PSW8 6030442K20Rik-201ENSMUST00000180835 1540 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
Trim71Q1PSW8 Gm21964-203ENSMUST00000219454 1513 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.35
Trim71Q1PSW8 Psd-210ENSMUST00000225323 3398 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Trim71Q1PSW8 A530016L24Rik-201ENSMUST00000057465 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Trim71Q1PSW8 Abhd18-202ENSMUST00000108078 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Trim71Q1PSW8 Capn8-202ENSMUST00000168514 2483 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Trim71Q1PSW8 CT009757.3-201ENSMUST00000223367 2320 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
Trim71Q1PSW8 Cplx1-201ENSMUST00000046892 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Trim71Q1PSW8 Alg14-201ENSMUST00000039442 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Trim71Q1PSW8 Pdxdc1-201ENSMUST00000023361 4228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Trim71Q1PSW8 5830411N06Rik-202ENSMUST00000093984 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Trim71Q1PSW8 BC030867-201ENSMUST00000100392 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Trim71Q1PSW8 Prx-204ENSMUST00000125990 4298 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Trim71Q1PSW8 Stx18-203ENSMUST00000114126 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Trim71Q1PSW8 Gm8494-201ENSMUST00000178171 1233 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
Trim71Q1PSW8 Gm27552-201ENSMUST00000183351 62 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
Trim71Q1PSW8 Gm27844-201ENSMUST00000183613 62 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
Trim71Q1PSW8 Gm32999-201ENSMUST00000192693 562 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
Trim71Q1PSW8 Gm31793-201ENSMUST00000218557 415 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Trim71Q1PSW8 AC138604.1-201ENSMUST00000226969 739 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
Trim71Q1PSW8 Agrp-201ENSMUST00000005849 661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Trim71Q1PSW8 Rpl29-201ENSMUST00000059802 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Trim71Q1PSW8 Carmil1-201ENSMUST00000072889 4988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Trim71Q1PSW8 Tom1-201ENSMUST00000078847 1769 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Trim71Q1PSW8 Jarid2-201ENSMUST00000044608 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Trim71Q1PSW8 Serpinb12-202ENSMUST00000112724 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Trim71Q1PSW8 Tfe3-204ENSMUST00000115677 2943 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Trim71Q1PSW8 Gm19817-201ENSMUST00000199764 2132 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
Trim71Q1PSW8 Ctdspl2-201ENSMUST00000036647 5053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Trim71Q1PSW8 Eno3-206ENSMUST00000170716 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Trim71Q1PSW8 Spatc1l-201ENSMUST00000009259 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Trim71Q1PSW8 Ankrd42-205ENSMUST00000138267 2827 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Trim71Q1PSW8 Trim29-201ENSMUST00000034511 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Trim71Q1PSW8 Gm13722-201ENSMUST00000117964 3066 ntBASIC12.82□□□□□ -0.36
Trim71Q1PSW8 Pak1-201ENSMUST00000033040 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Trim71Q1PSW8 Dnmt1-203ENSMUST00000178110 5870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Trim71Q1PSW8 Slc7a11-205ENSMUST00000194462 2419 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Trim71Q1PSW8 Tcf12-218ENSMUST00000184783 3489 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Trim71Q1PSW8 Gm37324-201ENSMUST00000194500 4504 ntBASIC12.82□□□□□ -0.36
Trim71Q1PSW8 Arl13b-201ENSMUST00000089289 3528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Trim71Q1PSW8 Olfr533-206ENSMUST00000217179 2825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Trim71Q1PSW8 Prkar1b-202ENSMUST00000110889 2457 ntTSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Trim71Q1PSW8 Zkscan3-207ENSMUST00000223831 2101 ntBASIC12.82□□□□□ -0.36
Trim71Q1PSW8 Mier1-205ENSMUST00000106858 4830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Trim71Q1PSW8 Grik3-201ENSMUST00000030676 8973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Trim71Q1PSW8 Cdk7-201ENSMUST00000091299 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Trim71Q1PSW8 Ttpa-203ENSMUST00000121491 2862 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Trim71Q1PSW8 Gm14644-201ENSMUST00000116671 647 ntBASIC12.82□□□□□ -0.36
Trim71Q1PSW8 Dnajb6-202ENSMUST00000012734 1024 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Trim71Q1PSW8 Gm11752-201ENSMUST00000143291 510 ntTSL 2 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Trim71Q1PSW8 Ip6k2-204ENSMUST00000192307 1191 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Trim71Q1PSW8 Gm42937-201ENSMUST00000197360 752 ntBASIC12.82□□□□□ -0.36
Trim71Q1PSW8 Gm42997-202ENSMUST00000200321 985 ntBASIC12.82□□□□□ -0.36
Trim71Q1PSW8 Gm43947-201ENSMUST00000203019 959 ntBASIC12.82□□□□□ -0.36
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