Protein–RNA interactions for Protein: Q08624

Hoxc4, Homeobox protein Hox-C4, mousemouse

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Length 264 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxc4Q08624 Ispd-205ENSMUST00000221895 4022 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Hoxc4Q08624 Lynx1-201ENSMUST00000023259 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Hoxc4Q08624 Adat3-201ENSMUST00000178231 4516 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Hoxc4Q08624 Sptb-201ENSMUST00000021458 10394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Hoxc4Q08624 Gm15082-201ENSMUST00000147045 1960 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Hoxc4Q08624 5430419D17Rik-201ENSMUST00000050586 2928 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Hoxc4Q08624 Eya1-203ENSMUST00000168081 4366 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Hoxc4Q08624 Cd72-205ENSMUST00000107926 1419 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Hoxc4Q08624 Cd79b-201ENSMUST00000044228 1431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Hoxc4Q08624 Cd72-203ENSMUST00000098105 1420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Hoxc4Q08624 Nsf-202ENSMUST00000103075 3766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Hoxc4Q08624 5330439B14Rik-201ENSMUST00000194811 1392 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Hoxc4Q08624 Gm12802-201ENSMUST00000145510 1813 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Hoxc4Q08624 Hnrnpf-209ENSMUST00000180020 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Hoxc4Q08624 Ago1-201ENSMUST00000097888 7227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Hoxc4Q08624 Slc19a2-201ENSMUST00000044021 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Hoxc4Q08624 Pde4d-205ENSMUST00000119507 2163 ntTSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Hoxc4Q08624 Cyfip1-201ENSMUST00000032629 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Hoxc4Q08624 Cdc14a-202ENSMUST00000106491 4292 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Hoxc4Q08624 Rpl11-201ENSMUST00000102536 833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Hoxc4Q08624 Ppil6-201ENSMUST00000105507 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Hoxc4Q08624 Mrpl55-202ENSMUST00000108784 729 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Hoxc4Q08624 Gm13611-201ENSMUST00000118269 318 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Hoxc4Q08624 Gm12201-201ENSMUST00000120657 1234 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Hoxc4Q08624 C230038L03Rik-202ENSMUST00000136294 1197 ntTSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Hoxc4Q08624 Gm53-203ENSMUST00000143887 757 ntTSL 3 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Hoxc4Q08624 4930562C15Rik-202ENSMUST00000171105 1299 ntTSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Hoxc4Q08624 U2af1l4-234ENSMUST00000171850 564 ntTSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Hoxc4Q08624 1110038B12Rik-208ENSMUST00000174714 520 ntTSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Hoxc4Q08624 5430405H02Rik-202ENSMUST00000176134 1196 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Hoxc4Q08624 Mir124-2hg-207ENSMUST00000189868 535 ntTSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Hoxc4Q08624 Rpl36-ps9-201ENSMUST00000196458 277 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Hoxc4Q08624 Gm44100-201ENSMUST00000204329 436 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Hoxc4Q08624 Gm21057-202ENSMUST00000206111 512 ntTSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Hoxc4Q08624 Lrrc74b-201ENSMUST00000023442 2135 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Hoxc4Q08624 Rbp2-201ENSMUST00000035029 672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Hoxc4Q08624 Fam25c-201ENSMUST00000052126 408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Hoxc4Q08624 Rnf17-202ENSMUST00000223627 2077 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Hoxc4Q08624 Cbs-203ENSMUST00000118504 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Hoxc4Q08624 4732471J01Rik-204ENSMUST00000206436 2430 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Hoxc4Q08624 Capn3-204ENSMUST00000110716 2752 ntTSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Hoxc4Q08624 Lrrfip1-204ENSMUST00000097650 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Hoxc4Q08624 Ahdc1-203ENSMUST00000105915 6341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Hoxc4Q08624 Rabgef1-203ENSMUST00000119797 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Hoxc4Q08624 Asphd2-201ENSMUST00000031291 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Hoxc4Q08624 Nphp4-201ENSMUST00000056567 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Hoxc4Q08624 Map6-201ENSMUST00000068973 3430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Hoxc4Q08624 3200001D21Rik-201ENSMUST00000221603 2283 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Hoxc4Q08624 Arhgef2-229ENSMUST00000177303 3000 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Hoxc4Q08624 Tmem159-201ENSMUST00000033210 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Hoxc4Q08624 Arhgap22-202ENSMUST00000111956 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Hoxc4Q08624 Ntsr1-202ENSMUST00000170448 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Hoxc4Q08624 Qrfp-201ENSMUST00000057407 2927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Hoxc4Q08624 Cpn1-201ENSMUST00000026210 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Hoxc4Q08624 Fgfr3-215ENSMUST00000202138 3960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Hoxc4Q08624 Celf1-202ENSMUST00000068726 7851 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Hoxc4Q08624 Evi5l-202ENSMUST00000176072 3932 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Hoxc4Q08624 Gnas-204ENSMUST00000087877 3947 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Hoxc4Q08624 Ccng1-201ENSMUST00000020576 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Hoxc4Q08624 Pax6-203ENSMUST00000111082 3116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Hoxc4Q08624 Asl-202ENSMUST00000159619 2088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Hoxc4Q08624 Crym-201ENSMUST00000033198 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Hoxc4Q08624 Pcdhb18-201ENSMUST00000055949 5041 ntAPPRIS P1 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Hoxc4Q08624 Cr1l-201ENSMUST00000075451 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Hoxc4Q08624 Olfr1349-204ENSMUST00000207820 1325 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Hoxc4Q08624 Mxd3-201ENSMUST00000021941 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Hoxc4Q08624 Espn-213ENSMUST00000105659 3595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Hoxc4Q08624 Cyp2d34-201ENSMUST00000109515 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Hoxc4Q08624 Gm8155-201ENSMUST00000216363 1612 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Hoxc4Q08624 Usp2-201ENSMUST00000034508 3867 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Hoxc4Q08624 Rbm39-217ENSMUST00000146297 2580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Hoxc4Q08624 Cdk2ap1-202ENSMUST00000111472 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Hoxc4Q08624 Gm13408-201ENSMUST00000119822 798 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Hoxc4Q08624 Gm8199-201ENSMUST00000121323 823 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Hoxc4Q08624 Gm13935-201ENSMUST00000121859 798 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Hoxc4Q08624 Gm13133-201ENSMUST00000143888 736 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Hoxc4Q08624 Spaca6-209ENSMUST00000172097 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Hoxc4Q08624 Gm8815-201ENSMUST00000173809 620 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Hoxc4Q08624 Rpl19-201ENSMUST00000017548 751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Hoxc4Q08624 Gm9034-201ENSMUST00000182071 1005 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Hoxc4Q08624 Gm9211-201ENSMUST00000182882 975 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Hoxc4Q08624 Gm28686-201ENSMUST00000187404 609 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Hoxc4Q08624 Gm42599-201ENSMUST00000201308 469 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Hoxc4Q08624 Gm3786-201ENSMUST00000202659 378 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Hoxc4Q08624 AC113082.1-201ENSMUST00000217324 327 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Hoxc4Q08624 Gm1821-202ENSMUST00000227415 750 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Hoxc4Q08624 Immp1l-201ENSMUST00000037499 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Hoxc4Q08624 1700001J03Rik-201ENSMUST00000073721 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Hoxc4Q08624 Rpl19-202ENSMUST00000092425 737 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Hoxc4Q08624 Tagln3-201ENSMUST00000096057 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Hoxc4Q08624 Olfr1250-201ENSMUST00000099768 1139 ntAPPRIS P1 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Hoxc4Q08624 Tagln2-202ENSMUST00000111230 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Hoxc4Q08624 Fam71f1-201ENSMUST00000090487 1584 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Hoxc4Q08624 1300017J02Rik-202ENSMUST00000123530 1874 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Hoxc4Q08624 Il4ra-201ENSMUST00000033004 5256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Hoxc4Q08624 Tspyl3-201ENSMUST00000099194 3072 ntAPPRIS P1 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Hoxc4Q08624 Sh3bp5l-201ENSMUST00000073128 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Hoxc4Q08624 Ncor2-206ENSMUST00000111402 8862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Hoxc4Q08624 Polrmt-202ENSMUST00000159016 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Hoxc4Q08624 Sypl-201ENSMUST00000020885 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
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