Protein–RNA interactions for Protein: Q08423

Tff1, Trefoil factor 1, mousemouse

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Length 87 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tff1Q08423 Gm10097-201ENSMUST00000180100 2784 ntAPPRIS P1 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Tff1Q08423 Tspan14-201ENSMUST00000047652 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Tff1Q08423 Zfp341-201ENSMUST00000081926 3299 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Tff1Q08423 Dpysl5-201ENSMUST00000088081 5022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Tff1Q08423 Mfsd4b5-205ENSMUST00000170579 1554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Tff1Q08423 Pmp22-204ENSMUST00000108702 1822 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Tff1Q08423 Gm43823-201ENSMUST00000197391 1808 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Tff1Q08423 Fbxl12-201ENSMUST00000086458 2056 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Tff1Q08423 Fbxl12-202ENSMUST00000086459 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Tff1Q08423 Klhl8-202ENSMUST00000112811 2577 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Tff1Q08423 Psap-203ENSMUST00000165878 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Tff1Q08423 Cbln3-201ENSMUST00000063871 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Tff1Q08423 Ighv2-9-201ENSMUST00000103451 362 ntAPPRIS P1 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Tff1Q08423 Hemk1-202ENSMUST00000118051 453 ntTSL 3 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Tff1Q08423 Isg20-204ENSMUST00000121645 1087 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Tff1Q08423 D930015M05Rik-201ENSMUST00000126002 1190 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Tff1Q08423 Gm45692-201ENSMUST00000131138 557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Tff1Q08423 Gm14064-201ENSMUST00000134833 727 ntTSL 3 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Tff1Q08423 Gm15738-202ENSMUST00000140892 427 ntTSL 2 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Tff1Q08423 Sumo3-206ENSMUST00000141228 772 ntTSL 3 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Tff1Q08423 Pcp2-206ENSMUST00000144977 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Tff1Q08423 Gm13391-202ENSMUST00000147685 816 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Tff1Q08423 Egfl7-211ENSMUST00000152988 723 ntTSL 2 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Tff1Q08423 Tmem205-202ENSMUST00000178988 862 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Tff1Q08423 1700045I11Rik-201ENSMUST00000194752 493 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Tff1Q08423 Mymx-204ENSMUST00000208801 437 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Tff1Q08423 Gm45865-201ENSMUST00000211815 945 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Tff1Q08423 Cldnd2-201ENSMUST00000040227 664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Tff1Q08423 Krtap4-7-201ENSMUST00000055121 984 ntAPPRIS P1 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Tff1Q08423 Atp6v1b1-201ENSMUST00000006431 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Tff1Q08423 Sgce-201ENSMUST00000004750 1703 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Tff1Q08423 Pnck-203ENSMUST00000114473 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Tff1Q08423 Gm18227-201ENSMUST00000211082 1468 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Tff1Q08423 Dnmt1-201ENSMUST00000004202 5367 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Tff1Q08423 Oprm1-205ENSMUST00000078634 1695 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Tff1Q08423 L3mbtl2-208ENSMUST00000174229 2578 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Tff1Q08423 A730071L15Rik-201ENSMUST00000181545 1615 ntAPPRIS P1 BASIC10.15□□□□□ -0.79
Tff1Q08423 Ccdc89-201ENSMUST00000061391 2093 ntAPPRIS P1 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Tff1Q08423 Zic4-204ENSMUST00000172646 2535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Tff1Q08423 Tmem80-204ENSMUST00000128906 1387 ntTSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Tff1Q08423 Rnf113a2-201ENSMUST00000183146 1383 ntAPPRIS P1 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Tff1Q08423 Rab8a-201ENSMUST00000003121 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Tff1Q08423 Kansl3-201ENSMUST00000010597 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Tff1Q08423 Adamts1-201ENSMUST00000023610 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Tff1Q08423 Egr2-202ENSMUST00000105438 2864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Tff1Q08423 Rprd1b-203ENSMUST00000109518 4399 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Tff1Q08423 4931409K22Rik-201ENSMUST00000088302 2613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Tff1Q08423 Serpinf2-202ENSMUST00000108437 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Tff1Q08423 Nxph1-202ENSMUST00000160300 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Tff1Q08423 Gm14132-201ENSMUST00000117188 1719 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Tff1Q08423 Ctps2-205ENSMUST00000112302 3223 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Tff1Q08423 Ndufs5-202ENSMUST00000106206 599 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Tff1Q08423 Gm12216-202ENSMUST00000120776 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
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Tff1Q08423 Gm12315-201ENSMUST00000151599 911 ntTSL 3 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Tff1Q08423 2010001A14Rik-203ENSMUST00000152790 714 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Tff1Q08423 Creb3-206ENSMUST00000167751 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Tff1Q08423 A930009A15Rik-201ENSMUST00000173620 1001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Tff1Q08423 Gm25927-201ENSMUST00000175058 117 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Tff1Q08423 Gm11523-203ENSMUST00000184482 802 ntTSL 3 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Tff1Q08423 2810039B14Rik-206ENSMUST00000185040 1113 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Tff1Q08423 Pex3-201ENSMUST00000019945 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Tff1Q08423 4933424G06Rik-204ENSMUST00000208994 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Tff1Q08423 Cyb5d1-201ENSMUST00000051620 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Tff1Q08423 Mettl5-201ENSMUST00000060447 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Tff1Q08423 Ric3-201ENSMUST00000055993 5281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Tff1Q08423 Hs3st1-202ENSMUST00000117944 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Tff1Q08423 Eps15l1-201ENSMUST00000163643 3129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Tff1Q08423 Sh3tc1-201ENSMUST00000070203 4549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Tff1Q08423 Ints6-202ENSMUST00000223585 10883 ntAPPRIS P1 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Tff1Q08423 Tpx2-201ENSMUST00000028969 3654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Tff1Q08423 4930550C17Rik-201ENSMUST00000181629 1411 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Tff1Q08423 Gm30725-201ENSMUST00000195170 1419 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Tff1Q08423 Tbc1d24-209ENSMUST00000201301 4261 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Tff1Q08423 Gm6034-201ENSMUST00000097331 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Tff1Q08423 Prkcsh-201ENSMUST00000003493 2012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Tff1Q08423 Fam210b-201ENSMUST00000028995 3617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Tff1Q08423 Mmel1-204ENSMUST00000105635 2592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Tff1Q08423 4930430F08Rik-201ENSMUST00000054471 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Tff1Q08423 AC157950.1-201ENSMUST00000217561 2168 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Tff1Q08423 B230398E01Rik-201ENSMUST00000125186 1958 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Tff1Q08423 Mtmr4-201ENSMUST00000092802 5525 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Tff1Q08423 Thrb-203ENSMUST00000091471 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Tff1Q08423 Car6-201ENSMUST00000030817 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Tff1Q08423 Tmem159-202ENSMUST00000118737 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Tff1Q08423 C530043K16Rik-201ENSMUST00000201865 3109 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Tff1Q08423 Cckar-201ENSMUST00000031093 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Tff1Q08423 Fam163a-201ENSMUST00000015628 3882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Tff1Q08423 Gm44806-201ENSMUST00000205574 2303 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Tff1Q08423 Cc2d1a-202ENSMUST00000117424 3262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Tff1Q08423 Gm10544-202ENSMUST00000181887 1923 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Tff1Q08423 Brsk1-202ENSMUST00000120836 2867 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Tff1Q08423 Ctsc-201ENSMUST00000032779 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Tff1Q08423 Sin3b-201ENSMUST00000004494 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Tff1Q08423 Tfdp2-205ENSMUST00000179416 2408 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Tff1Q08423 Rnh1-202ENSMUST00000167493 1656 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Tff1Q08423 Gm44929-202ENSMUST00000209134 1653 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Tff1Q08423 Rnh1-204ENSMUST00000210314 1658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Tff1Q08423 Lrrc3-201ENSMUST00000057608 4296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Tff1Q08423 Pi16-202ENSMUST00000114701 2756 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
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