Protein–RNA interactions for Protein: Q08189

Tgm3, Protein-glutamine gamma-glutamyltransferase E, mousemouse

Predictions only

Length 693 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tgm3Q08189 Ankrd2-201ENSMUST00000026172 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Tgm3Q08189 Gas7-201ENSMUST00000041611 2968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Tgm3Q08189 Gpr45-201ENSMUST00000114761 1546 ntAPPRIS P1 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Tgm3Q08189 Chpf2-202ENSMUST00000121863 3715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Tgm3Q08189 Lrfn3-201ENSMUST00000046351 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Tgm3Q08189 Gm37513-201ENSMUST00000194830 2268 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
Tgm3Q08189 Gm38378-201ENSMUST00000195153 2268 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
Tgm3Q08189 Dctn1-205ENSMUST00000113919 4292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Tgm3Q08189 A430108G06Rik-201ENSMUST00000153461 1428 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Tgm3Q08189 Gm43154-214ENSMUST00000211225 1420 ntTSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Tgm3Q08189 Serpina11-201ENSMUST00000074693 1447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Tgm3Q08189 Stxbp2-207ENSMUST00000160708 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Tgm3Q08189 5430419D17Rik-201ENSMUST00000050586 2928 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Tgm3Q08189 Dgkz-203ENSMUST00000111303 4169 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Tgm3Q08189 Mrps30-201ENSMUST00000022245 3319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Tgm3Q08189 Rbm39-217ENSMUST00000146297 2580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Tgm3Q08189 9030407P20Rik-201ENSMUST00000180933 2310 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Tgm3Q08189 Gm13187-202ENSMUST00000133873 1321 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Tgm3Q08189 BC055324-202ENSMUST00000097493 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Tgm3Q08189 Ehd1-201ENSMUST00000025684 3353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Tgm3Q08189 Fut8-201ENSMUST00000062804 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Tgm3Q08189 B230398E01Rik-201ENSMUST00000125186 1958 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Tgm3Q08189 Sema4a-213ENSMUST00000165898 3125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Tgm3Q08189 Ttyh1-202ENSMUST00000079415 2882 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.47
Tgm3Q08189 Crcp-201ENSMUST00000026608 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.47
Tgm3Q08189 Ephb3-201ENSMUST00000006112 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.47
Tgm3Q08189 Cgnl1-202ENSMUST00000121322 6541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Tgm3Q08189 Rapgef3-203ENSMUST00000126854 4005 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Tgm3Q08189 Sltm-206ENSMUST00000216816 3755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Tgm3Q08189 Treh-202ENSMUST00000071219 1927 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Tgm3Q08189 Gm5053-201ENSMUST00000208361 1678 ntBASIC12.08□□□□□ -0.48
Tgm3Q08189 4930522L14Rik-201ENSMUST00000100937 599 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Tgm3Q08189 Lcn6-203ENSMUST00000114199 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Tgm3Q08189 Zar1l-201ENSMUST00000118769 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Tgm3Q08189 Gm15610-201ENSMUST00000120584 195 ntBASIC12.08□□□□□ -0.48
Tgm3Q08189 Gm15891-201ENSMUST00000127307 611 ntTSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Tgm3Q08189 Gm34728-201ENSMUST00000201510 414 ntTSL 3 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Tgm3Q08189 Gm18730-201ENSMUST00000218038 343 ntBASIC12.08□□□□□ -0.48
Tgm3Q08189 Zfp706-203ENSMUST00000226453 517 ntAPPRIS P1 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Tgm3Q08189 Lgals1-201ENSMUST00000089377 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Tgm3Q08189 Dgcr8-202ENSMUST00000115633 4522 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Tgm3Q08189 Prc1-211ENSMUST00000174199 2128 ntTSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Tgm3Q08189 Usp13-201ENSMUST00000072312 7580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Tgm3Q08189 Lrp8-206ENSMUST00000126573 2590 ntTSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Tgm3Q08189 Fig4-201ENSMUST00000043814 3282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Tgm3Q08189 Ctnnb1-214ENSMUST00000178812 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Tgm3Q08189 Fbn1-202ENSMUST00000103234 11971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Tgm3Q08189 Exosc1-202ENSMUST00000112123 1499 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Tgm3Q08189 Dab2ip-207ENSMUST00000112992 6184 ntTSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Tgm3Q08189 Maml3-201ENSMUST00000118075 5450 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Tgm3Q08189 Mrap2-201ENSMUST00000049457 1931 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Tgm3Q08189 Slc37a2-201ENSMUST00000115068 5943 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Tgm3Q08189 Rnf10-202ENSMUST00000112096 3112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Tgm3Q08189 Fbxo46-201ENSMUST00000053109 4873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Tgm3Q08189 Ndufs4-201ENSMUST00000022286 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Tgm3Q08189 Lman1l-202ENSMUST00000093832 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Tgm3Q08189 Gm12802-201ENSMUST00000145510 1813 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Tgm3Q08189 Olfr707-203ENSMUST00000210644 1817 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Tgm3Q08189 Baiap3-202ENSMUST00000182056 4645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Tgm3Q08189 Celf2-205ENSMUST00000114927 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Tgm3Q08189 Gm14028-201ENSMUST00000117434 479 ntBASIC12.07□□□□□ -0.48
Tgm3Q08189 Gm14508-201ENSMUST00000127049 901 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Tgm3Q08189 Nbdy-201ENSMUST00000140575 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Tgm3Q08189 Nbdy-202ENSMUST00000149514 775 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Tgm3Q08189 Arf4os-201ENSMUST00000166902 566 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Tgm3Q08189 Dnm2-206ENSMUST00000172482 2613 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Tgm3Q08189 Prox2os-201ENSMUST00000177043 1133 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Tgm3Q08189 Gm27390-201ENSMUST00000184516 176 ntBASIC12.07□□□□□ -0.48
Tgm3Q08189 Gm37666-201ENSMUST00000194110 866 ntBASIC12.07□□□□□ -0.48
Tgm3Q08189 Gm10305-201ENSMUST00000195331 2475 ntBASIC12.07□□□□□ -0.48
Tgm3Q08189 Gm18038-201ENSMUST00000197900 485 ntBASIC12.07□□□□□ -0.48
Tgm3Q08189 Gm4607-201ENSMUST00000206649 577 ntBASIC12.07□□□□□ -0.48
Tgm3Q08189 Gm17827-201ENSMUST00000211825 742 ntBASIC12.07□□□□□ -0.48
Tgm3Q08189 AC153954.1-201ENSMUST00000216959 255 ntBASIC12.07□□□□□ -0.48
Tgm3Q08189 Olfr1347-205ENSMUST00000220413 964 ntBASIC12.07□□□□□ -0.48
Tgm3Q08189 Mfsd13b-201ENSMUST00000033166 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Tgm3Q08189 Olfr1347-201ENSMUST00000036357 964 ntAPPRIS P1 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Tgm3Q08189 Gm6994-201ENSMUST00000088880 1163 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Tgm3Q08189 Gm10308-201ENSMUST00000095183 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Tgm3Q08189 Slc25a25-205ENSMUST00000113310 3278 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Tgm3Q08189 Ankrd42-205ENSMUST00000138267 2827 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Tgm3Q08189 Tmc4-202ENSMUST00000121743 2204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Tgm3Q08189 Abca7-202ENSMUST00000132517 6696 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Tgm3Q08189 Slc29a1-204ENSMUST00000163492 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Tgm3Q08189 Colgalt2-201ENSMUST00000044311 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Tgm3Q08189 Klc2-204ENSMUST00000116563 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Tgm3Q08189 Ywhaz-203ENSMUST00000110361 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Tgm3Q08189 CT573086.2-201ENSMUST00000227277 4992 ntBASIC12.07□□□□□ -0.48
Tgm3Q08189 Gm17435-202ENSMUST00000212699 1998 ntBASIC12.07□□□□□ -0.48
Tgm3Q08189 Banp-201ENSMUST00000026354 1970 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Tgm3Q08189 Chrna9-201ENSMUST00000031108 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Tgm3Q08189 Lhfpl1-201ENSMUST00000040084 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Tgm3Q08189 Wdr59-201ENSMUST00000034437 4896 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Tgm3Q08189 Gm43447-201ENSMUST00000198471 1535 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
Tgm3Q08189 Gm45871-202ENSMUST00000209969 1368 ntTSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Tgm3Q08189 Kars-201ENSMUST00000034426 2008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Tgm3Q08189 Wnt9a-202ENSMUST00000108783 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Tgm3Q08189 Ppargc1b-202ENSMUST00000075299 3656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Tgm3Q08189 Kmt2e-201ENSMUST00000094962 7252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Tgm3Q08189 Gm43677-201ENSMUST00000198098 2378 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.5 ms