Protein–RNA interactions for Protein: Q06649

Sh3bp2, SH3 domain-binding protein 2, mousemouse

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Length 559 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh3bp2Q06649 Map6-201ENSMUST00000068973 3430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Sh3bp2Q06649 Cnot10-201ENSMUST00000070117 2853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Sh3bp2Q06649 Poc1a-201ENSMUST00000072206 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Sh3bp2Q06649 Lysmd1-201ENSMUST00000066386 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Sh3bp2Q06649 Naa50-201ENSMUST00000063520 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Sh3bp2Q06649 Itga3-201ENSMUST00000001548 4861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Sh3bp2Q06649 Mecom-206ENSMUST00000172694 4381 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Sh3bp2Q06649 Hdac5-202ENSMUST00000107150 3759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Sh3bp2Q06649 Pdhx-201ENSMUST00000011058 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
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Sh3bp2Q06649 2810403D21Rik-207ENSMUST00000152089 852 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
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Sh3bp2Q06649 Ms4a8a-201ENSMUST00000025636 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Sh3bp2Q06649 Defb22-201ENSMUST00000028966 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Sh3bp2Q06649 Phpt1-201ENSMUST00000039156 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
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Sh3bp2Q06649 Tmem92-203ENSMUST00000162809 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Sh3bp2Q06649 Tfe3-204ENSMUST00000115677 2943 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
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Sh3bp2Q06649 Tspan14-201ENSMUST00000047652 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Sh3bp2Q06649 Brd2-201ENSMUST00000025193 4374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Sh3bp2Q06649 Grin3a-201ENSMUST00000076674 7431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Sh3bp2Q06649 Cd300lf-202ENSMUST00000106561 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
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Sh3bp2Q06649 Sntb2-203ENSMUST00000212524 9945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
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Sh3bp2Q06649 6430571L13Rik-201ENSMUST00000042581 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
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Sh3bp2Q06649 Arhgap1-202ENSMUST00000111329 3201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
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Sh3bp2Q06649 Limd2-203ENSMUST00000106875 936 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.75□□□□□ -0.37
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Sh3bp2Q06649 Capn11-201ENSMUST00000120717 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
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Sh3bp2Q06649 Fyn-206ENSMUST00000136659 1910 ntTSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Sh3bp2Q06649 F630206G17Rik-201ENSMUST00000137002 685 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Sh3bp2Q06649 1110028F11Rik-201ENSMUST00000137077 837 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
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Sh3bp2Q06649 Lpar2-202ENSMUST00000164890 5800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Sh3bp2Q06649 Gm17099-201ENSMUST00000166780 412 ntTSL 3 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Sh3bp2Q06649 9230114K14Rik-203ENSMUST00000199547 437 ntTSL 3 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Sh3bp2Q06649 Camsap3-203ENSMUST00000207077 3832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Sh3bp2Q06649 Gm45765-202ENSMUST00000212921 1313 ntTSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Sh3bp2Q06649 Gm21027-201ENSMUST00000219300 1236 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
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