Protein–RNA interactions for Protein: Q06138

Cab39, Calcium-binding protein 39, mousemouse

Predictions only

Length 341 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cab39Q06138 1700030J22Rik-201ENSMUST00000070577 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Cab39Q06138 Sh2d7-202ENSMUST00000118413 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Cab39Q06138 Jak3-203ENSMUST00000110013 4009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Cab39Q06138 Jak3-201ENSMUST00000051995 4019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Cab39Q06138 Arrb1-201ENSMUST00000032995 3715 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Cab39Q06138 Stra6-202ENSMUST00000085677 2725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Cab39Q06138 Slc36a4-201ENSMUST00000061568 6539 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Cab39Q06138 Rabggtb-201ENSMUST00000089950 1381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Cab39Q06138 Smpd4-206ENSMUST00000163997 1722 ntTSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Cab39Q06138 4933440M02Rik-203ENSMUST00000206609 1747 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Cab39Q06138 Sel1l-201ENSMUST00000021347 6300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Cab39Q06138 Ubtf-203ENSMUST00000107115 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Cab39Q06138 Ccpg1-201ENSMUST00000037977 3151 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Cab39Q06138 Rnf214-208ENSMUST00000161187 2847 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Cab39Q06138 Otub2-202ENSMUST00000101094 3228 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Cab39Q06138 Ints6l-207ENSMUST00000186445 3608 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Cab39Q06138 Fam217a-204ENSMUST00000225242 1811 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Cab39Q06138 Dnmt3c-201ENSMUST00000119996 2223 ntAPPRIS P1 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Cab39Q06138 Gpcpd1-205ENSMUST00000110142 3703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Cab39Q06138 Gm26872-201ENSMUST00000180862 2261 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Cab39Q06138 Usp3-211ENSMUST00000174387 1901 ntTSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Cab39Q06138 Kalrn-206ENSMUST00000114954 4677 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Cab39Q06138 Maip1-201ENSMUST00000027114 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Cab39Q06138 Dennd4a-201ENSMUST00000038890 8645 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Cab39Q06138 Slc30a8-201ENSMUST00000037240 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Cab39Q06138 Myh2-201ENSMUST00000018641 6018 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Cab39Q06138 Alg14-201ENSMUST00000039442 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Cab39Q06138 Cmklr1-201ENSMUST00000047936 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Cab39Q06138 Ccnb1-201ENSMUST00000072119 2489 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Cab39Q06138 Acsm1-201ENSMUST00000047929 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Cab39Q06138 Fnbp1-203ENSMUST00000100207 1680 ntTSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Cab39Q06138 Rpl38-204ENSMUST00000106602 371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Cab39Q06138 Id1-202ENSMUST00000109824 1160 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Cab39Q06138 Gm13391-202ENSMUST00000147685 816 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Cab39Q06138 Mmgt2-207ENSMUST00000155759 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Cab39Q06138 Tnfrsf12a-202ENSMUST00000167059 858 ntTSL 2 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Cab39Q06138 Glo1-202ENSMUST00000167624 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Cab39Q06138 Gm5745-201ENSMUST00000183748 313 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Cab39Q06138 Gm43416-201ENSMUST00000201916 1015 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Cab39Q06138 Tdrp-206ENSMUST00000210414 323 ntTSL 3 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Cab39Q06138 AC166051.1-201ENSMUST00000214313 210 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Cab39Q06138 9230020A06Rik-204ENSMUST00000215201 1116 ntTSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Cab39Q06138 AC110091.3-202ENSMUST00000217104 791 ntTSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Cab39Q06138 AC155286.1-201ENSMUST00000218632 448 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Cab39Q06138 AC156560.2-201ENSMUST00000221232 264 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Cab39Q06138 Tnfrsf12a-201ENSMUST00000024698 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Cab39Q06138 Cript-201ENSMUST00000024959 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Cab39Q06138 H2-Oa-201ENSMUST00000025192 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Cab39Q06138 Nudt22-201ENSMUST00000041686 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Cab39Q06138 Hilpda-201ENSMUST00000054445 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Cab39Q06138 Tekt3-201ENSMUST00000035732 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Cab39Q06138 Nod1-201ENSMUST00000060655 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Cab39Q06138 Acsm4-201ENSMUST00000047045 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Cab39Q06138 Tcf7l2-207ENSMUST00000111653 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Cab39Q06138 Sema5b-201ENSMUST00000050625 4350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Cab39Q06138 Tmcc2-203ENSMUST00000132435 3514 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Cab39Q06138 Spag8-202ENSMUST00000107870 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Cab39Q06138 1110028F18Rik-201ENSMUST00000183365 1341 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Cab39Q06138 Alg12-201ENSMUST00000043087 1793 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Cab39Q06138 Bpnt1-201ENSMUST00000027916 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Cab39Q06138 Bcl2l14-201ENSMUST00000032321 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Cab39Q06138 Nrg1-202ENSMUST00000207417 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Cab39Q06138 Slc38a3-202ENSMUST00000167868 3151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Cab39Q06138 Creld2-201ENSMUST00000024042 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Cab39Q06138 Brd3-210ENSMUST00000164296 2791 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Cab39Q06138 Mtap-201ENSMUST00000058030 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Cab39Q06138 Arhgef9-206ENSMUST00000113884 3784 ntTSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Cab39Q06138 Sod2-201ENSMUST00000007012 3824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Cab39Q06138 Ccnc-204ENSMUST00000120679 1453 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Cab39Q06138 1110051M20Rik-203ENSMUST00000102594 1977 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Cab39Q06138 Fcgbp-203ENSMUST00000138392 7926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Cab39Q06138 Fcgbp-201ENSMUST00000076648 7928 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Cab39Q06138 Gm21964-203ENSMUST00000219454 1513 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Cab39Q06138 Dbh-201ENSMUST00000000910 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Cab39Q06138 Pcdhga10-201ENSMUST00000193404 4732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Cab39Q06138 AC091764.2-201ENSMUST00000218190 1590 ntTSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Cab39Q06138 Dnajc5g-201ENSMUST00000066544 1565 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Cab39Q06138 Alx1-203ENSMUST00000167156 2689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Cab39Q06138 Plrg1-202ENSMUST00000122128 1608 ntTSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Cab39Q06138 Fam149a-201ENSMUST00000093526 5469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Cab39Q06138 Zbtb21-203ENSMUST00000113734 6010 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Cab39Q06138 Dnmt3l-201ENSMUST00000000746 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Cab39Q06138 9330199G10Rik-202ENSMUST00000221607 1728 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Cab39Q06138 Hmox2-201ENSMUST00000004172 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Cab39Q06138 Siglec1-203ENSMUST00000110227 5790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Cab39Q06138 Supt16-201ENSMUST00000046709 4673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Cab39Q06138 Tnc-202ENSMUST00000107371 2928 ntTSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Cab39Q06138 Olfr1419-202ENSMUST00000213954 2918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Cab39Q06138 Gm4869-201ENSMUST00000197549 2955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Cab39Q06138 Cad-211ENSMUST00000202795 6559 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Cab39Q06138 Zfp809-206ENSMUST00000215902 1800 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Cab39Q06138 Ighv5-17-201ENSMUST00000103459 405 ntAPPRIS P1 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Cab39Q06138 Ldha-ps-201ENSMUST00000119390 995 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
Cab39Q06138 1700022A21Rik-201ENSMUST00000182745 1051 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
Cab39Q06138 Gm42929-201ENSMUST00000198374 1286 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
Cab39Q06138 Gm9794-201ENSMUST00000202370 423 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
Cab39Q06138 Hfe-201ENSMUST00000006787 516 ntTSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Cab39Q06138 Hfe-203ENSMUST00000091707 816 ntTSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Cab39Q06138 C1qtnf9-201ENSMUST00000025940 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Cab39Q06138 Gm13264-201ENSMUST00000138416 2011 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.6 ms