Protein–RNA interactions for Protein: Q05020

Apoc2, Apolipoprotein C-II, mousemouse

Predictions only

Length 97 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apoc2Q05020 Igsf9-202ENSMUST00000111235 4205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Apoc2Q05020 Pla2g15-201ENSMUST00000034377 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Apoc2Q05020 Tirap-203ENSMUST00000176531 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Apoc2Q05020 Adcy8-201ENSMUST00000023007 6990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Apoc2Q05020 Natd1-201ENSMUST00000019075 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Apoc2Q05020 Rbms1-201ENSMUST00000028347 4436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Apoc2Q05020 Dna2-203ENSMUST00000131422 4122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Apoc2Q05020 Tbc1d14-210ENSMUST00000140607 4649 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.87□□□□□ -0.67
Apoc2Q05020 Etfrf1-205ENSMUST00000111724 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Apoc2Q05020 Herpud1-201ENSMUST00000034220 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Apoc2Q05020 Sertad2-201ENSMUST00000093292 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Apoc2Q05020 Slc7a4-207ENSMUST00000172164 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Apoc2Q05020 Gm5884-201ENSMUST00000036712 1479 ntBASIC10.87□□□□□ -0.67
Apoc2Q05020 Gtf2ird1-209ENSMUST00000171794 3524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Apoc2Q05020 B930036N10Rik-202ENSMUST00000181170 3544 ntBASIC10.87□□□□□ -0.67
Apoc2Q05020 Cbx7-203ENSMUST00000109616 2899 ntTSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Apoc2Q05020 Spock3-203ENSMUST00000118003 2860 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.87□□□□□ -0.67
Apoc2Q05020 Tpra1-218ENSMUST00000203185 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.87□□□□□ -0.67
Apoc2Q05020 Ces2a-201ENSMUST00000034346 1960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Apoc2Q05020 Pcgf2-207ENSMUST00000179765 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Apoc2Q05020 Lef1-201ENSMUST00000029611 3482 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Apoc2Q05020 Mindy1-202ENSMUST00000107187 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Apoc2Q05020 Adgrg5-201ENSMUST00000074570 2802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Apoc2Q05020 Lbh-201ENSMUST00000024857 3064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Apoc2Q05020 Slc9a1-201ENSMUST00000030669 4676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Apoc2Q05020 Grap2-201ENSMUST00000043149 3158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Apoc2Q05020 Thsd4-202ENSMUST00000098660 8796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Apoc2Q05020 Hs3st1-202ENSMUST00000117944 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Apoc2Q05020 4930550C17Rik-201ENSMUST00000181629 1411 ntTSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Apoc2Q05020 Ppnr-201ENSMUST00000190974 3525 ntTSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Apoc2Q05020 Cep97-203ENSMUST00000118500 3389 ntTSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Apoc2Q05020 Gm26685-201ENSMUST00000181831 2023 ntTSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Apoc2Q05020 Patl1-201ENSMUST00000061618 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Apoc2Q05020 Gm45428-201ENSMUST00000209619 1789 ntBASIC10.86□□□□□ -0.67
Apoc2Q05020 Rps6kl1-202ENSMUST00000221972 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Apoc2Q05020 Rnf144a-202ENSMUST00000062149 4812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Apoc2Q05020 Gnas-203ENSMUST00000087876 3719 ntTSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Apoc2Q05020 Hmgb3-201ENSMUST00000015361 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Apoc2Q05020 Slc36a4-201ENSMUST00000061568 6539 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Apoc2Q05020 Stk19-ps1-201ENSMUST00000174597 517 ntBASIC10.86□□□□□ -0.67
Apoc2Q05020 2700012I20Rik-201ENSMUST00000180525 684 ntTSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Apoc2Q05020 Gm27243-201ENSMUST00000183964 521 ntBASIC10.86□□□□□ -0.67
Apoc2Q05020 Lrcol1-202ENSMUST00000185691 764 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Apoc2Q05020 1700072B07Rik-201ENSMUST00000191141 445 ntTSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Apoc2Q05020 Gm35082-202ENSMUST00000208164 525 ntTSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Apoc2Q05020 AI463170-203ENSMUST00000219353 430 ntTSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Apoc2Q05020 Gm8598-201ENSMUST00000221184 836 ntBASIC10.86□□□□□ -0.67
Apoc2Q05020 Stard3nl-209ENSMUST00000221380 1268 ntTSL 5 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Apoc2Q05020 AC150560.1-201ENSMUST00000227731 1187 ntBASIC10.86□□□□□ -0.67
Apoc2Q05020 Recql4-201ENSMUST00000036852 3922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Apoc2Q05020 Clvs2-204ENSMUST00000161692 4283 ntTSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Apoc2Q05020 A430028G04Rik-201ENSMUST00000219095 1973 ntBASIC10.86□□□□□ -0.67
Apoc2Q05020 Klk6-203ENSMUST00000107968 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Apoc2Q05020 D630033O11Rik-204ENSMUST00000210588 1358 ntTSL 5 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Apoc2Q05020 Upk3b-201ENSMUST00000062606 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Apoc2Q05020 3830432H09Rik-202ENSMUST00000188909 2414 ntTSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Apoc2Q05020 Lsamp-208ENSMUST00000189358 2766 ntTSL 5 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Apoc2Q05020 Lhfpl1-201ENSMUST00000040084 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Apoc2Q05020 Abcc10-204ENSMUST00000167360 4866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Apoc2Q05020 Olfr763-201ENSMUST00000077460 2523 ntAPPRIS P1 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Apoc2Q05020 Trpv4-201ENSMUST00000071968 3228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Apoc2Q05020 Hnrnpm-206ENSMUST00000148178 3934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Apoc2Q05020 Ifnar1-201ENSMUST00000023689 3909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Apoc2Q05020 Igfbp5-201ENSMUST00000027377 6006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Apoc2Q05020 Sdccag8-202ENSMUST00000056773 1551 ntTSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Apoc2Q05020 Astl-201ENSMUST00000059839 2377 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Apoc2Q05020 AC122291.1-201ENSMUST00000228937 5748 ntBASIC10.85□□□□□ -0.67
Apoc2Q05020 Exd1-201ENSMUST00000060009 6042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Apoc2Q05020 Tnc-202ENSMUST00000107371 2928 ntTSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Apoc2Q05020 Scmh1-201ENSMUST00000000087 3353 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Apoc2Q05020 Aff3-203ENSMUST00000095027 5857 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Apoc2Q05020 Adamts13-201ENSMUST00000014996 3474 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Apoc2Q05020 Tmem47-201ENSMUST00000026760 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Apoc2Q05020 Sgpp2-201ENSMUST00000036172 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Apoc2Q05020 Tnip1-202ENSMUST00000102730 2787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Apoc2Q05020 E030013I19Rik-201ENSMUST00000148089 2754 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Apoc2Q05020 Gif-201ENSMUST00000025585 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Apoc2Q05020 A930038B10Rik-202ENSMUST00000181044 3415 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Apoc2Q05020 Trpm7-202ENSMUST00000103224 7107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Apoc2Q05020 Lcn5-203ENSMUST00000100313 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Apoc2Q05020 4933409G03Rik-201ENSMUST00000102713 1263 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Apoc2Q05020 Qdpr-203ENSMUST00000118097 1232 ntTSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Apoc2Q05020 Igfbp2-202ENSMUST00000120564 991 ntTSL 3 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Apoc2Q05020 Chchd7-208ENSMUST00000121651 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Apoc2Q05020 Gm10156-201ENSMUST00000122364 462 ntBASIC10.85□□□□□ -0.67
Apoc2Q05020 Gm2231-201ENSMUST00000125661 612 ntBASIC10.85□□□□□ -0.67
Apoc2Q05020 Pla2g10os-201ENSMUST00000141172 174 ntTSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Apoc2Q05020 Gm833-201ENSMUST00000143133 884 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Apoc2Q05020 Proscos-202ENSMUST00000178990 666 ntBASIC10.85□□□□□ -0.67
Apoc2Q05020 Gm29152-201ENSMUST00000189284 325 ntTSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Apoc2Q05020 C330022C24Rik-201ENSMUST00000190581 1077 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Apoc2Q05020 Gm7287-201ENSMUST00000205267 602 ntBASIC10.85□□□□□ -0.67
Apoc2Q05020 Timm9-206ENSMUST00000221367 836 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Apoc2Q05020 Csrp3-201ENSMUST00000032658 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Apoc2Q05020 Chchd7-201ENSMUST00000041122 672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Apoc2Q05020 Cyb5d1-201ENSMUST00000051620 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Apoc2Q05020 Pdlim4-202ENSMUST00000093109 962 ntTSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Apoc2Q05020 Tgm2-201ENSMUST00000103122 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Apoc2Q05020 Tmem80-204ENSMUST00000128906 1387 ntTSL 2 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Apoc2Q05020 Pou5f2-201ENSMUST00000175955 1394 ntAPPRIS P1 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.2 ms