Protein–RNA interactions for Protein: Q03717

Kcnb1, Potassium voltage-gated channel subfamily B member 1, mousemouse

Predictions only

Length 857 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kcnb1Q03717 Gm26973-201ENSMUST00000182105 696 ntTSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Kcnb1Q03717 Gm28192-201ENSMUST00000189381 778 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Kcnb1Q03717 Gm45022-201ENSMUST00000208332 545 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Kcnb1Q03717 Fam168a-210ENSMUST00000216021 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Kcnb1Q03717 AC113031.8-201ENSMUST00000227856 631 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Kcnb1Q03717 Rwdd3-201ENSMUST00000039761 1145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Kcnb1Q03717 Itln1-201ENSMUST00000043094 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Kcnb1Q03717 Gemin7-201ENSMUST00000051364 763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Kcnb1Q03717 Olfr368-201ENSMUST00000053990 985 ntAPPRIS P1 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Kcnb1Q03717 Acyp1-202ENSMUST00000065913 448 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Kcnb1Q03717 Lgals1-201ENSMUST00000089377 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Kcnb1Q03717 Lsp1-205ENSMUST00000105968 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Kcnb1Q03717 Lbr-201ENSMUST00000005003 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Kcnb1Q03717 Timd2-201ENSMUST00000055102 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Kcnb1Q03717 Prkag3-206ENSMUST00000188073 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Kcnb1Q03717 Prr18-202ENSMUST00000163887 3251 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Kcnb1Q03717 1700110I01Rik-201ENSMUST00000112775 1671 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
Kcnb1Q03717 Gm10110-202ENSMUST00000228705 3220 ntBASIC13.46□□□□□ -0.26
Kcnb1Q03717 Cd276-202ENSMUST00000165365 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Kcnb1Q03717 Sod2-201ENSMUST00000007012 3824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Kcnb1Q03717 Cyp2s1-201ENSMUST00000043314 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Kcnb1Q03717 Abhd14b-207ENSMUST00000213179 1627 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.26
Kcnb1Q03717 Skp2-203ENSMUST00000190131 1819 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Kcnb1Q03717 Irf6-201ENSMUST00000076521 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Kcnb1Q03717 Sdf4-201ENSMUST00000050078 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Kcnb1Q03717 Sv2a-201ENSMUST00000035371 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Kcnb1Q03717 Zfp354c-202ENSMUST00000109135 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Kcnb1Q03717 Ppp2r1b-202ENSMUST00000114437 3430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Kcnb1Q03717 Gm45902-202ENSMUST00000140494 2390 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Kcnb1Q03717 Tubgcp2-201ENSMUST00000026547 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Kcnb1Q03717 1500009C09Rik-201ENSMUST00000136948 1526 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Kcnb1Q03717 Hsd3b6-202ENSMUST00000170847 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Kcnb1Q03717 Lsp1-211ENSMUST00000149521 1910 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Kcnb1Q03717 Kctd18-210ENSMUST00000164963 2114 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Kcnb1Q03717 Hmgcs2-202ENSMUST00000120541 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Kcnb1Q03717 Vmn1r45-206ENSMUST00000227977 3297 ntAPPRIS P1 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Kcnb1Q03717 Pcdha2-202ENSMUST00000195590 4645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Kcnb1Q03717 Dnmt3l-202ENSMUST00000123940 1452 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Kcnb1Q03717 Spata3-202ENSMUST00000113344 1047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Kcnb1Q03717 Pla2g10-202ENSMUST00000115807 964 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Kcnb1Q03717 Cspp1-202ENSMUST00000117415 1272 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Kcnb1Q03717 Gm4986-201ENSMUST00000119731 549 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Kcnb1Q03717 Gm8062-201ENSMUST00000139696 444 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Kcnb1Q03717 Gm16124-201ENSMUST00000146938 516 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Kcnb1Q03717 Gm11379-201ENSMUST00000154678 381 ntTSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Kcnb1Q03717 Snhg9-201ENSMUST00000161706 183 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Kcnb1Q03717 Stard10-207ENSMUST00000173270 670 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Kcnb1Q03717 BC023719-201ENSMUST00000174728 978 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Kcnb1Q03717 Gm29396-201ENSMUST00000185659 716 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Kcnb1Q03717 Olfr284-202ENSMUST00000206647 966 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Kcnb1Q03717 Ormdl2-204ENSMUST00000219524 724 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Kcnb1Q03717 AC163667.3-201ENSMUST00000225774 222 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Kcnb1Q03717 Sun2-201ENSMUST00000046259 3804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Kcnb1Q03717 Gm9823-201ENSMUST00000051212 327 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Kcnb1Q03717 2410002F23Rik-205ENSMUST00000107949 3610 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Kcnb1Q03717 Capn2-201ENSMUST00000068505 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Kcnb1Q03717 Alg13-202ENSMUST00000070801 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Kcnb1Q03717 6430571L13Rik-201ENSMUST00000042581 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Kcnb1Q03717 Hkdc1-201ENSMUST00000020277 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Kcnb1Q03717 Gm18626-201ENSMUST00000221512 1409 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Kcnb1Q03717 AC108858.2-201ENSMUST00000228186 1425 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Kcnb1Q03717 Zfand2a-202ENSMUST00000110851 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Kcnb1Q03717 Apopt1-203ENSMUST00000162316 3107 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Kcnb1Q03717 2410002F23Rik-204ENSMUST00000107948 2908 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Kcnb1Q03717 Ufd1-201ENSMUST00000005394 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Kcnb1Q03717 Mab21l3-202ENSMUST00000118411 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Kcnb1Q03717 Rab11fip5-201ENSMUST00000060837 4035 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Kcnb1Q03717 Tle3-202ENSMUST00000159050 2304 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Kcnb1Q03717 H2-M2-201ENSMUST00000016427 1550 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Kcnb1Q03717 Nmbr-201ENSMUST00000020015 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Kcnb1Q03717 Sppl2a-201ENSMUST00000028844 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Kcnb1Q03717 1700003D09Rik-201ENSMUST00000141929 1389 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Kcnb1Q03717 Spock1-202ENSMUST00000185502 4614 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Kcnb1Q03717 4930563D23Rik-201ENSMUST00000062638 2646 ntAPPRIS P1 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Kcnb1Q03717 Tmem41b-202ENSMUST00000118429 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Kcnb1Q03717 Psd2-205ENSMUST00000176873 4375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Kcnb1Q03717 Runx1-202ENSMUST00000113956 4738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Kcnb1Q03717 Setd1b-206ENSMUST00000174836 7515 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Kcnb1Q03717 Gm4864-201ENSMUST00000219894 1461 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Kcnb1Q03717 Gm43760-201ENSMUST00000202120 3015 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Kcnb1Q03717 Dhx57-202ENSMUST00000086555 5077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Kcnb1Q03717 Th-202ENSMUST00000105929 1950 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Kcnb1Q03717 Qrsl1-201ENSMUST00000020012 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Kcnb1Q03717 Nsd3-208ENSMUST00000146919 3652 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Kcnb1Q03717 Grm4-202ENSMUST00000118489 2976 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Kcnb1Q03717 Gm13944-201ENSMUST00000126572 721 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Kcnb1Q03717 Gm12298-201ENSMUST00000126999 731 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Kcnb1Q03717 Gm13966-201ENSMUST00000148420 832 ntTSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Kcnb1Q03717 Rpl19-201ENSMUST00000017548 751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Kcnb1Q03717 Gm2310-201ENSMUST00000179217 1131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Kcnb1Q03717 AC153929.1-201ENSMUST00000219009 303 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Kcnb1Q03717 AC158523.3-201ENSMUST00000220664 864 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Kcnb1Q03717 CT009486.1-201ENSMUST00000222047 661 ntTSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Kcnb1Q03717 Syngr4-201ENSMUST00000039049 967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Kcnb1Q03717 Rpl19-202ENSMUST00000092425 737 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Kcnb1Q03717 Nwd2-201ENSMUST00000159584 8534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Kcnb1Q03717 D330041H03Rik-205ENSMUST00000181014 1903 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Kcnb1Q03717 Plxnb2-202ENSMUST00000109331 6377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Kcnb1Q03717 Oraov1-204ENSMUST00000128057 2231 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Kcnb1Q03717 Tpra1-218ENSMUST00000203185 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.4 ms