Protein–RNA interactions for Protein: Q02248

Ctnnb1, Catenin beta-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 781 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctnnb1Q02248 Odf3-201ENSMUST00000026555 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Ctnnb1Q02248 Cmbl-201ENSMUST00000070918 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Ctnnb1Q02248 Chfr-202ENSMUST00000112519 3159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Ctnnb1Q02248 Calm1-202ENSMUST00000110082 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Ctnnb1Q02248 Tagln2-202ENSMUST00000111230 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Ctnnb1Q02248 AC154671.1-201ENSMUST00000228617 1578 ntBASIC12.71□□□□□ -0.37
Ctnnb1Q02248 Kif3b-201ENSMUST00000028977 5635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Ctnnb1Q02248 Per2-201ENSMUST00000069620 5833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Ctnnb1Q02248 Kcp-203ENSMUST00000101614 4885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Ctnnb1Q02248 Pex3-201ENSMUST00000019945 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Ctnnb1Q02248 Sh2b1-206ENSMUST00000205889 3011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Ctnnb1Q02248 Gatad2a-206ENSMUST00000212478 3622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.38
Ctnnb1Q02248 BC048403-202ENSMUST00000136432 2968 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Ctnnb1Q02248 Sufu-203ENSMUST00000118440 2663 ntTSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.38
Ctnnb1Q02248 Rasl12-201ENSMUST00000085453 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Ctnnb1Q02248 Edrf1-202ENSMUST00000128901 4380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.38
Ctnnb1Q02248 Gm3765-201ENSMUST00000130985 1447 ntBASIC12.71□□□□□ -0.38
Ctnnb1Q02248 4930486L24Rik-201ENSMUST00000091569 1432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Ctnnb1Q02248 Enox1-201ENSMUST00000022589 3142 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Ctnnb1Q02248 Gm29480-201ENSMUST00000188589 1655 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Ctnnb1Q02248 Gm16070-203ENSMUST00000155588 1902 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Ctnnb1Q02248 Ntrk2-208ENSMUST00000225583 2719 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
Ctnnb1Q02248 Kars-203ENSMUST00000164470 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Ctnnb1Q02248 Psg23-201ENSMUST00000057810 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Ctnnb1Q02248 Ercc8-201ENSMUST00000054835 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Ctnnb1Q02248 Nsd3-208ENSMUST00000146919 3652 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Ctnnb1Q02248 Ip6k2-201ENSMUST00000085018 1846 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Ctnnb1Q02248 Srr-202ENSMUST00000108447 3138 ntTSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Ctnnb1Q02248 Spag1-201ENSMUST00000047348 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Ctnnb1Q02248 Mrps17-207ENSMUST00000121813 868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Ctnnb1Q02248 Gm22442-201ENSMUST00000157256 144 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
Ctnnb1Q02248 Hmgn3-201ENSMUST00000161796 862 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Ctnnb1Q02248 Gm18159-201ENSMUST00000174516 1070 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
Ctnnb1Q02248 Pgpep1l-202ENSMUST00000207874 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Ctnnb1Q02248 Gm35368-201ENSMUST00000209554 1244 ntTSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Ctnnb1Q02248 CT485606.1-201ENSMUST00000213187 878 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
Ctnnb1Q02248 Gm6867-201ENSMUST00000219165 425 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
Ctnnb1Q02248 AC154176.1-201ENSMUST00000225897 220 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
Ctnnb1Q02248 AC093022.5-201ENSMUST00000226841 1079 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
Ctnnb1Q02248 n-R5s211-201ENSMUST00000093689 119 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
Ctnnb1Q02248 Slc6a18-208ENSMUST00000222029 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Ctnnb1Q02248 Astl-202ENSMUST00000089673 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Ctnnb1Q02248 Fcrls-201ENSMUST00000090986 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Ctnnb1Q02248 Olfr607-202ENSMUST00000214347 5706 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Ctnnb1Q02248 Gpsm2-201ENSMUST00000029482 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Ctnnb1Q02248 Npy5r-203ENSMUST00000212563 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Ctnnb1Q02248 Csrnp1-201ENSMUST00000035101 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Ctnnb1Q02248 Mob1a-201ENSMUST00000038658 4119 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Ctnnb1Q02248 Atp8a1-201ENSMUST00000037380 8178 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Ctnnb1Q02248 Pdp1-205ENSMUST00000108301 2635 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Ctnnb1Q02248 Capn3-201ENSMUST00000028748 2606 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Ctnnb1Q02248 A430108G06Rik-201ENSMUST00000153461 1428 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Ctnnb1Q02248 Zfp64-203ENSMUST00000109162 2848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Ctnnb1Q02248 Hps1-208ENSMUST00000162004 2847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Ctnnb1Q02248 Rab11a-208ENSMUST00000172298 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Ctnnb1Q02248 Sypl-201ENSMUST00000020885 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Ctnnb1Q02248 Gm26519-201ENSMUST00000181193 2249 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Ctnnb1Q02248 Gm43267-201ENSMUST00000199664 1796 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
Ctnnb1Q02248 Psmc2-201ENSMUST00000030769 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Ctnnb1Q02248 Pigk-201ENSMUST00000045029 1761 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Ctnnb1Q02248 Hpse2-201ENSMUST00000099428 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Ctnnb1Q02248 Atf7-202ENSMUST00000108828 2887 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Ctnnb1Q02248 Ddi2-202ENSMUST00000177592 3539 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Ctnnb1Q02248 Clmp-201ENSMUST00000034522 4154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Ctnnb1Q02248 Mtmr2-208ENSMUST00000155679 3088 ntTSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Ctnnb1Q02248 Dync1li1-201ENSMUST00000047404 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Ctnnb1Q02248 Eef2kmt-201ENSMUST00000064635 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Ctnnb1Q02248 Ccpg1-206ENSMUST00000140675 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Ctnnb1Q02248 Cnot3-201ENSMUST00000038913 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Ctnnb1Q02248 Ociad2-204ENSMUST00000200830 2384 ntTSL 3 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Ctnnb1Q02248 Fut9-202ENSMUST00000108199 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Ctnnb1Q02248 Gm14193-201ENSMUST00000105067 153 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
Ctnnb1Q02248 Rpl15-204ENSMUST00000112598 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Ctnnb1Q02248 Gm15207-201ENSMUST00000119259 442 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
Ctnnb1Q02248 4931406G06Rik-201ENSMUST00000147848 1252 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Ctnnb1Q02248 Prss36-208ENSMUST00000156152 1132 ntTSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Ctnnb1Q02248 Rwdd2a-202ENSMUST00000179212 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Ctnnb1Q02248 1700025F24Rik-201ENSMUST00000185238 894 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Ctnnb1Q02248 Gm29088-201ENSMUST00000189363 581 ntTSL 3 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Ctnnb1Q02248 6430531B16Rik-204ENSMUST00000209335 898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Ctnnb1Q02248 Gm18636-201ENSMUST00000218846 1066 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
Ctnnb1Q02248 Gm9661-201ENSMUST00000221611 1122 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
Ctnnb1Q02248 AC122350.1-201ENSMUST00000228135 533 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
Ctnnb1Q02248 Scg5-201ENSMUST00000024005 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Ctnnb1Q02248 Gm9962-201ENSMUST00000085241 321 ntTSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Ctnnb1Q02248 Gm44851-201ENSMUST00000205735 2309 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
Ctnnb1Q02248 Gm18227-201ENSMUST00000211082 1468 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
Ctnnb1Q02248 Cacna1c-227ENSMUST00000220022 7765 ntTSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Ctnnb1Q02248 Armcx1-202ENSMUST00000051256 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Ctnnb1Q02248 Evc2-201ENSMUST00000056365 4091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Ctnnb1Q02248 Rabggtb-202ENSMUST00000167111 1418 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Ctnnb1Q02248 Arhgef2-219ENSMUST00000176500 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Ctnnb1Q02248 Npnt-203ENSMUST00000093971 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Ctnnb1Q02248 Eme1-201ENSMUST00000039949 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Ctnnb1Q02248 Rbm4-206ENSMUST00000180248 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Ctnnb1Q02248 Dab2ip-205ENSMUST00000112986 5580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Ctnnb1Q02248 Gm4262-201ENSMUST00000180624 1986 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Ctnnb1Q02248 Ints7-201ENSMUST00000045450 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Ctnnb1Q02248 Phkg2-201ENSMUST00000033086 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Ctnnb1Q02248 Pfkl-201ENSMUST00000020522 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.9 ms