Protein–RNA interactions for Protein: Q01065

Pde1b, Calcium/calmodulin-dependent 3',5'-cyclic nucleotide phosphodiesterase 1B, mousemouse

Predictions only

Length 535 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pde1bQ01065 Gm9361-201ENSMUST00000198695 1507 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
Pde1bQ01065 Ptbp1-216ENSMUST00000172282 3110 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Pde1bQ01065 Fbxo44-208ENSMUST00000167160 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Pde1bQ01065 Napsa-201ENSMUST00000002274 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Pde1bQ01065 Chil1-201ENSMUST00000082060 1687 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Pde1bQ01065 Gpld1-201ENSMUST00000021773 5224 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Pde1bQ01065 Tsku-202ENSMUST00000164726 2620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Pde1bQ01065 Adgrl3-210ENSMUST00000119788 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Pde1bQ01065 Galc-201ENSMUST00000021390 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Pde1bQ01065 Tsga10-202ENSMUST00000088072 3837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Pde1bQ01065 Rmi1-201ENSMUST00000042450 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Pde1bQ01065 Esco2-201ENSMUST00000022613 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Pde1bQ01065 Hr-205ENSMUST00000163060 5278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Pde1bQ01065 Ict1os-201ENSMUST00000125653 1052 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Pde1bQ01065 1700037C18Rik-205ENSMUST00000177323 915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Pde1bQ01065 Gm37008-201ENSMUST00000195712 319 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
Pde1bQ01065 AC160029.2-201ENSMUST00000218285 548 ntTSL 3 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Pde1bQ01065 Gm18636-201ENSMUST00000218846 1066 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
Pde1bQ01065 Asphd1-201ENSMUST00000052937 730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Pde1bQ01065 1500011B03Rik-201ENSMUST00000061251 579 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Pde1bQ01065 Gm22058-201ENSMUST00000083393 310 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
Pde1bQ01065 Ptcd3-201ENSMUST00000082094 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Pde1bQ01065 Spata20-201ENSMUST00000041705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Pde1bQ01065 Art3-204ENSMUST00000119587 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Pde1bQ01065 Mei4-201ENSMUST00000057067 2670 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Pde1bQ01065 Bean1-206ENSMUST00000213077 1373 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Pde1bQ01065 Ripor1-201ENSMUST00000043531 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Pde1bQ01065 Gm5884-201ENSMUST00000036712 1479 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
Pde1bQ01065 Pacrg-201ENSMUST00000041463 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Pde1bQ01065 CT025678.1-201ENSMUST00000214795 2972 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
Pde1bQ01065 6030442K20Rik-201ENSMUST00000180835 1540 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Pde1bQ01065 Gm38187-201ENSMUST00000195609 4709 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
Pde1bQ01065 Otub2-202ENSMUST00000101094 3228 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Pde1bQ01065 Clasp1-216ENSMUST00000189738 5373 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Pde1bQ01065 Gm12802-201ENSMUST00000145510 1813 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Pde1bQ01065 Osgin1-206ENSMUST00000152420 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Pde1bQ01065 Mroh7-201ENSMUST00000106770 4346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Pde1bQ01065 Vdr-201ENSMUST00000023119 4370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Pde1bQ01065 Myo16-201ENSMUST00000042103 6725 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Pde1bQ01065 Robo3-201ENSMUST00000034643 4712 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Pde1bQ01065 Als2cl-203ENSMUST00000130386 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Pde1bQ01065 Hps1-209ENSMUST00000162061 2608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Pde1bQ01065 Trappc8-202ENSMUST00000097658 2703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Pde1bQ01065 BC052040-203ENSMUST00000166472 2770 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Pde1bQ01065 Zfp362-202ENSMUST00000106072 2812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Pde1bQ01065 H3f3a-205ENSMUST00000161308 2841 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Pde1bQ01065 Phf21a-209ENSMUST00000111297 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Pde1bQ01065 Phf21a-201ENSMUST00000044036 6187 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Pde1bQ01065 Eya1-202ENSMUST00000080664 3426 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Pde1bQ01065 Nudt15-201ENSMUST00000043813 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Pde1bQ01065 Osbp2-201ENSMUST00000070552 4097 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Pde1bQ01065 Pofut1-201ENSMUST00000049863 5600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Pde1bQ01065 Zfp597-201ENSMUST00000090522 5668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Pde1bQ01065 Ins2-203ENSMUST00000105931 472 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Pde1bQ01065 Dlk1-204ENSMUST00000109843 1300 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Pde1bQ01065 Ppp2r1b-202ENSMUST00000114437 3430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Pde1bQ01065 Dync1i1-202ENSMUST00000115555 2669 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Pde1bQ01065 Fzr1-202ENSMUST00000118812 1215 ntTSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Pde1bQ01065 Msrb3-202ENSMUST00000130950 561 ntTSL 3 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Pde1bQ01065 Snhg20-201ENSMUST00000145438 459 ntTSL 3 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Pde1bQ01065 Ush1c-206ENSMUST00000154292 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Pde1bQ01065 4930524O07Rik-201ENSMUST00000161822 1050 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Pde1bQ01065 Gm16315-201ENSMUST00000163009 783 ntTSL 3 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Pde1bQ01065 Gm8018-201ENSMUST00000173536 789 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Pde1bQ01065 Gm42627-201ENSMUST00000197347 224 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Pde1bQ01065 Gm8706-201ENSMUST00000197372 1491 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Pde1bQ01065 Gm18584-201ENSMUST00000203098 964 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Pde1bQ01065 Tmem176b-206ENSMUST00000203355 1202 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Pde1bQ01065 Gm4598-201ENSMUST00000206756 1080 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Pde1bQ01065 D630033O11Rik-204ENSMUST00000210588 1358 ntTSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Pde1bQ01065 Rph3al-201ENSMUST00000021208 1690 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Pde1bQ01065 AC160411.1-201ENSMUST00000218544 4560 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Pde1bQ01065 4933434E20Rik-202ENSMUST00000029552 1080 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Pde1bQ01065 Asb9-201ENSMUST00000033756 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Pde1bQ01065 Nubp2-201ENSMUST00000044252 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Pde1bQ01065 Rpl18a-201ENSMUST00000054220 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Pde1bQ01065 Rfx1-201ENSMUST00000005600 4172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Pde1bQ01065 Prss2-201ENSMUST00000070380 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Pde1bQ01065 Eif2s1-201ENSMUST00000071230 3405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Pde1bQ01065 Dsc2-202ENSMUST00000075214 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Pde1bQ01065 n-R5s195-201ENSMUST00000082891 119 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Pde1bQ01065 Bcl11a-201ENSMUST00000000881 3061 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Pde1bQ01065 Mtf2-201ENSMUST00000081567 4060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Pde1bQ01065 Sstr3-201ENSMUST00000053239 3928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Pde1bQ01065 Prkd1-201ENSMUST00000002765 3653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Pde1bQ01065 Trak1-213ENSMUST00000211439 3533 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Pde1bQ01065 Rbm12b2-201ENSMUST00000063839 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Pde1bQ01065 Fyb2-201ENSMUST00000106803 3136 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Pde1bQ01065 Fam149a-201ENSMUST00000093526 5469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Pde1bQ01065 Wdr20rt-201ENSMUST00000046331 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Pde1bQ01065 Slc34a3-201ENSMUST00000006638 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Pde1bQ01065 Lrrc27-201ENSMUST00000016124 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Pde1bQ01065 Rps6ka6-202ENSMUST00000082034 4170 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Pde1bQ01065 Tardbp-204ENSMUST00000105699 1904 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Pde1bQ01065 Eif5-212ENSMUST00000222375 3547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Pde1bQ01065 Pnck-203ENSMUST00000114473 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Pde1bQ01065 Yae1d1-204ENSMUST00000222796 1382 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Pde1bQ01065 Dlx5-202ENSMUST00000142635 1324 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Pde1bQ01065 Tmem53-203ENSMUST00000106434 923 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Pde1bQ01065 Pkig-203ENSMUST00000109400 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.3 ms