Protein–RNA interactions for Protein: Q00LT2

Prcd, Progressive rod-cone degeneration protein homolog, mousemouse

Predictions only

Length 53 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrcdQ00LT2 Gm38266-201ENSMUST00000194931 421 ntBASIC8.59□□□□□ -1.03
PrcdQ00LT2 Gm44882-201ENSMUST00000205702 802 ntBASIC8.59□□□□□ -1.03
PrcdQ00LT2 AC098716.1-201ENSMUST00000213527 703 ntBASIC8.59□□□□□ -1.03
PrcdQ00LT2 Trex2-201ENSMUST00000033738 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.59□□□□□ -1.03
PrcdQ00LT2 U2af1l4-201ENSMUST00000043273 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.59□□□□□ -1.03
PrcdQ00LT2 Gm6502-202ENSMUST00000097478 1218 ntTSL 5 BASIC8.59□□□□□ -1.03
PrcdQ00LT2 Uap1l1-201ENSMUST00000102925 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.59□□□□□ -1.03
PrcdQ00LT2 Coasy-202ENSMUST00000107308 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.59□□□□□ -1.03
PrcdQ00LT2 Cyb5rl-201ENSMUST00000030364 2360 ntTSL 1 (best) BASIC8.59□□□□□ -1.03
PrcdQ00LT2 Nudt5-205ENSMUST00000179748 1590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.59□□□□□ -1.03
PrcdQ00LT2 Styxl1-201ENSMUST00000053906 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.59□□□□□ -1.03
PrcdQ00LT2 Allc-202ENSMUST00000110917 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.59□□□□□ -1.03
PrcdQ00LT2 D630033O11Rik-204ENSMUST00000210588 1358 ntTSL 5 BASIC8.59□□□□□ -1.03
PrcdQ00LT2 Klk1b16-201ENSMUST00000005933 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.59□□□□□ -1.03
PrcdQ00LT2 AC160405.1-201ENSMUST00000218207 1545 ntBASIC8.59□□□□□ -1.03
PrcdQ00LT2 Rab8a-201ENSMUST00000003121 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.59□□□□□ -1.03
PrcdQ00LT2 Zfp61-208ENSMUST00000165241 1668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.59□□□□□ -1.03
PrcdQ00LT2 Pmp22-204ENSMUST00000108702 1822 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC8.59□□□□□ -1.03
PrcdQ00LT2 Banp-201ENSMUST00000026354 1970 ntTSL 1 (best) BASIC8.59□□□□□ -1.03
PrcdQ00LT2 Mettl8-202ENSMUST00000100037 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.59□□□□□ -1.03
PrcdQ00LT2 Myo7a-201ENSMUST00000084979 6849 ntTSL 1 (best) BASIC8.59□□□□□ -1.03
PrcdQ00LT2 C1qtnf6-201ENSMUST00000023075 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.59□□□□□ -1.03
PrcdQ00LT2 Riok1-201ENSMUST00000021866 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.59□□□□□ -1.03
PrcdQ00LT2 Ivns1abp-202ENSMUST00000097543 3337 ntTSL 1 (best) BASIC8.59□□□□□ -1.04
PrcdQ00LT2 Nsf-202ENSMUST00000103075 3766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.59□□□□□ -1.04
PrcdQ00LT2 Arhgap39-201ENSMUST00000036176 4500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.59□□□□□ -1.04
PrcdQ00LT2 Itga2b-201ENSMUST00000103086 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.58□□□□□ -1.04
PrcdQ00LT2 Matn2-203ENSMUST00000226766 3252 ntBASIC8.58□□□□□ -1.04
PrcdQ00LT2 Kif2c-201ENSMUST00000065896 2842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.58□□□□□ -1.04
PrcdQ00LT2 Gm7224-201ENSMUST00000121359 2066 ntBASIC8.58□□□□□ -1.04
PrcdQ00LT2 Sgf29-201ENSMUST00000032956 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.58□□□□□ -1.04
PrcdQ00LT2 Sde2-201ENSMUST00000038091 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.58□□□□□ -1.04
PrcdQ00LT2 Ppp1r9b-202ENSMUST00000107748 3095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.58□□□□□ -1.04
PrcdQ00LT2 Nf1-202ENSMUST00000108251 9217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.58□□□□□ -1.04
PrcdQ00LT2 Rnf144a-202ENSMUST00000062149 4812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.58□□□□□ -1.04
PrcdQ00LT2 BC024139-201ENSMUST00000054022 2623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.58□□□□□ -1.04
PrcdQ00LT2 Lins1-202ENSMUST00000077967 2647 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC8.58□□□□□ -1.04
PrcdQ00LT2 Herc4-208ENSMUST00000219577 3914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC8.58□□□□□ -1.04
PrcdQ00LT2 Accs-201ENSMUST00000041593 2036 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.58□□□□□ -1.04
PrcdQ00LT2 Gm37269-201ENSMUST00000193906 1891 ntBASIC8.58□□□□□ -1.04
PrcdQ00LT2 Ripk4-202ENSMUST00000113743 3743 ntTSL 1 (best) BASIC8.58□□□□□ -1.04
PrcdQ00LT2 Klhl8-202ENSMUST00000112811 2577 ntTSL 5 BASIC8.58□□□□□ -1.04
PrcdQ00LT2 Lmbr1-203ENSMUST00000196321 3422 ntTSL 1 (best) BASIC8.58□□□□□ -1.04
PrcdQ00LT2 Gm24934-201ENSMUST00000103764 111 ntBASIC8.58□□□□□ -1.04
PrcdQ00LT2 Stpg3-202ENSMUST00000114363 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.58□□□□□ -1.04
PrcdQ00LT2 Dusp13-203ENSMUST00000120956 1070 ntTSL 1 (best) BASIC8.58□□□□□ -1.04
PrcdQ00LT2 Gm23119-201ENSMUST00000158610 140 ntBASIC8.58□□□□□ -1.04
PrcdQ00LT2 Gm16339-201ENSMUST00000160954 929 ntTSL 5 BASIC8.58□□□□□ -1.04
PrcdQ00LT2 Gm7008-202ENSMUST00000170019 402 ntTSL 2 BASIC8.58□□□□□ -1.04
PrcdQ00LT2 Gm2991-201ENSMUST00000173338 480 ntBASIC8.58□□□□□ -1.04
PrcdQ00LT2 Tmem52-204ENSMUST00000178188 908 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC8.58□□□□□ -1.04
PrcdQ00LT2 Tmem52-205ENSMUST00000178238 968 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC8.58□□□□□ -1.04
PrcdQ00LT2 Gm3893-201ENSMUST00000178882 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.58□□□□□ -1.04
PrcdQ00LT2 D930030I03Rik-201ENSMUST00000180735 920 ntTSL 1 (best) BASIC8.58□□□□□ -1.04
PrcdQ00LT2 Gm28882-201ENSMUST00000185504 314 ntBASIC8.58□□□□□ -1.04
PrcdQ00LT2 Ip6k2-204ENSMUST00000192307 1191 ntTSL 1 (best) BASIC8.58□□□□□ -1.04
PrcdQ00LT2 Gm42838-201ENSMUST00000196503 439 ntTSL 5 BASIC8.58□□□□□ -1.04
PrcdQ00LT2 4930589O11Rik-201ENSMUST00000200768 920 ntBASIC8.58□□□□□ -1.04
PrcdQ00LT2 Gm44066-201ENSMUST00000203263 519 ntTSL 3 BASIC8.58□□□□□ -1.04
PrcdQ00LT2 4930447K03Rik-201ENSMUST00000222745 1033 ntTSL 1 (best) BASIC8.58□□□□□ -1.04
PrcdQ00LT2 Itln1-201ENSMUST00000043094 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.58□□□□□ -1.04
PrcdQ00LT2 Olfr12-201ENSMUST00000081274 1121 ntAPPRIS P1 BASIC8.58□□□□□ -1.04
PrcdQ00LT2 Gm8399-201ENSMUST00000082300 1117 ntBASIC8.58□□□□□ -1.04
PrcdQ00LT2 Tsga10-202ENSMUST00000088072 3837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.58□□□□□ -1.04
PrcdQ00LT2 Cd37-202ENSMUST00000098461 1227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.58□□□□□ -1.04
PrcdQ00LT2 Tiprl-201ENSMUST00000043235 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.58□□□□□ -1.04
PrcdQ00LT2 Sp4-203ENSMUST00000222314 2677 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.58□□□□□ -1.04
PrcdQ00LT2 Susd5-201ENSMUST00000135338 4083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.58□□□□□ -1.04
PrcdQ00LT2 Skp2-203ENSMUST00000190131 1819 ntTSL 1 (best) BASIC8.58□□□□□ -1.04
PrcdQ00LT2 Rab17-201ENSMUST00000027529 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.58□□□□□ -1.04
PrcdQ00LT2 Mid1-215ENSMUST00000171433 2546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.58□□□□□ -1.04
PrcdQ00LT2 Ttll12-201ENSMUST00000016901 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.58□□□□□ -1.04
PrcdQ00LT2 Gpr17-201ENSMUST00000064016 5195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.58□□□□□ -1.04
PrcdQ00LT2 Usp5-202ENSMUST00000122110 3076 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC8.58□□□□□ -1.04
PrcdQ00LT2 Tctn3-203ENSMUST00000135795 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.58□□□□□ -1.04
PrcdQ00LT2 Gm5053-201ENSMUST00000208361 1678 ntBASIC8.58□□□□□ -1.04
PrcdQ00LT2 Cr1l-201ENSMUST00000075451 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.58□□□□□ -1.04
PrcdQ00LT2 Zdbf2-202ENSMUST00000114132 12629 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.58□□□□□ -1.04
PrcdQ00LT2 Gm42853-201ENSMUST00000201273 1387 ntBASIC8.58□□□□□ -1.04
PrcdQ00LT2 Gm18222-201ENSMUST00000202416 1387 ntBASIC8.58□□□□□ -1.04
PrcdQ00LT2 Sox7-201ENSMUST00000079652 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.58□□□□□ -1.04
PrcdQ00LT2 Gm27177-202ENSMUST00000183514 2703 ntBASIC8.58□□□□□ -1.04
PrcdQ00LT2 Oit3-201ENSMUST00000009798 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.58□□□□□ -1.04
PrcdQ00LT2 Tcof1-202ENSMUST00000175934 4595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC8.58□□□□□ -1.04
PrcdQ00LT2 Cyp2j13-203ENSMUST00000107078 1493 ntTSL 1 (best) BASIC8.57□□□□□ -1.04
PrcdQ00LT2 Gm13142-201ENSMUST00000117213 1453 ntBASIC8.57□□□□□ -1.04
PrcdQ00LT2 Gm20721-201ENSMUST00000168292 1484 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.57□□□□□ -1.04
PrcdQ00LT2 Igbp1b-201ENSMUST00000054786 1456 ntAPPRIS P1 BASIC8.57□□□□□ -1.04
PrcdQ00LT2 Klk2-ps-202ENSMUST00000206865 2684 ntTSL 5 BASIC8.57□□□□□ -1.04
PrcdQ00LT2 Slc36a4-201ENSMUST00000061568 6539 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.57□□□□□ -1.04
PrcdQ00LT2 Hspa2-202ENSMUST00000219555 2526 ntAPPRIS P1 BASIC8.57□□□□□ -1.04
PrcdQ00LT2 Thoc5-202ENSMUST00000101615 2116 ntTSL 5 BASIC8.57□□□□□ -1.04
PrcdQ00LT2 Gm44414-201ENSMUST00000203660 2109 ntBASIC8.57□□□□□ -1.04
PrcdQ00LT2 Triobp-204ENSMUST00000109690 7023 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC8.57□□□□□ -1.04
PrcdQ00LT2 Tnc-203ENSMUST00000107372 7106 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.57□□□□□ -1.04
PrcdQ00LT2 Zscan10-202ENSMUST00000115509 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.57□□□□□ -1.04
PrcdQ00LT2 Opcml-201ENSMUST00000073822 2378 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.57□□□□□ -1.04
PrcdQ00LT2 Slc6a1-201ENSMUST00000032454 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.57□□□□□ -1.04
PrcdQ00LT2 Prr18-202ENSMUST00000163887 3251 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC8.57□□□□□ -1.04
PrcdQ00LT2 Sfmbt1-206ENSMUST00000228006 3299 ntAPPRIS P1 BASIC8.57□□□□□ -1.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62.9 ms