Protein–RNA interactions for Protein: Q00690

Sele, E-selectin, mousemouse

Predictions only

Length 612 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SeleQ00690 Glo1-201ENSMUST00000024823 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
SeleQ00690 Syne3-203ENSMUST00000109927 5263 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.97□□□□□ -0.81
SeleQ00690 Synj2-202ENSMUST00000080283 4793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
SeleQ00690 AI314180-202ENSMUST00000102889 7045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
SeleQ00690 Tmem132a-201ENSMUST00000025645 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
SeleQ00690 Slc4a2-202ENSMUST00000115047 4264 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.97□□□□□ -0.81
SeleQ00690 Gm15326-202ENSMUST00000128198 1422 ntTSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
SeleQ00690 Eif4ebp2-202ENSMUST00000167087 1422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.97□□□□□ -0.81
SeleQ00690 Tbc1d1-204ENSMUST00000121370 5419 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
SeleQ00690 Pcdh8-204ENSMUST00000195355 3704 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
SeleQ00690 Wdr25-202ENSMUST00000167816 2657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.97□□□□□ -0.81
SeleQ00690 4930534D22Rik-201ENSMUST00000181438 2715 ntTSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
SeleQ00690 Cyp4f39-201ENSMUST00000003413 1599 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.97□□□□□ -0.81
SeleQ00690 Agpat3-205ENSMUST00000105390 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.96□□□□□ -0.81
SeleQ00690 Rnf182-201ENSMUST00000059986 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
SeleQ00690 C030034I22Rik-202ENSMUST00000188481 4231 ntBASIC9.96□□□□□ -0.81
SeleQ00690 Wdr33-201ENSMUST00000025264 6206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.96□□□□□ -0.81
SeleQ00690 Dgcr2-203ENSMUST00000117082 2987 ntTSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
SeleQ00690 Abcg5-201ENSMUST00000066175 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
SeleQ00690 Ap5b1-201ENSMUST00000096318 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
SeleQ00690 4930428O21Rik-201ENSMUST00000198537 1740 ntTSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
SeleQ00690 Tekt3-201ENSMUST00000035732 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
SeleQ00690 Sdc1-201ENSMUST00000020911 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
SeleQ00690 Usp16-201ENSMUST00000026710 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
SeleQ00690 Tnn-202ENSMUST00000131919 3987 ntTSL 5 BASIC9.96□□□□□ -0.81
SeleQ00690 A930024N18Rik-201ENSMUST00000181251 3955 ntTSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
SeleQ00690 Olfm2-201ENSMUST00000034692 1836 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
SeleQ00690 Arhgap4-203ENSMUST00000114405 6299 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.96□□□□□ -0.81
SeleQ00690 Rapgef3-217ENSMUST00000177352 3395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.96□□□□□ -0.81
SeleQ00690 Gm9866-202ENSMUST00000182473 1882 ntTSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
SeleQ00690 Kremen1-201ENSMUST00000020662 4856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
SeleQ00690 Rpe-202ENSMUST00000113995 2713 ntTSL 3 BASIC9.96□□□□□ -0.81
SeleQ00690 Pggt1b-201ENSMUST00000025354 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
SeleQ00690 Mroh1-204ENSMUST00000159218 5085 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.96□□□□□ -0.81
SeleQ00690 Olfr288-202ENSMUST00000165379 2083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.96□□□□□ -0.81
SeleQ00690 Gprc5a-201ENSMUST00000050104 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
SeleQ00690 Zbtb40-201ENSMUST00000049583 7192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
SeleQ00690 Itk-202ENSMUST00000101306 1185 ntTSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
SeleQ00690 Eif3i-201ENSMUST00000102593 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
SeleQ00690 Rbm3-202ENSMUST00000115615 1183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
SeleQ00690 Rbm3-203ENSMUST00000115616 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
SeleQ00690 Rgs20-202ENSMUST00000118000 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.96□□□□□ -0.82
SeleQ00690 Gm12216-202ENSMUST00000120776 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.96□□□□□ -0.82
SeleQ00690 Gm15869-201ENSMUST00000126427 734 ntTSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
SeleQ00690 Gm14064-201ENSMUST00000134833 727 ntTSL 3 BASIC9.96□□□□□ -0.82
SeleQ00690 Gm11791-201ENSMUST00000139327 336 ntTSL 3 BASIC9.96□□□□□ -0.82
SeleQ00690 Nat8f1-201ENSMUST00000161198 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
SeleQ00690 Rps13-201ENSMUST00000170953 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
SeleQ00690 Nipsnap3a-204ENSMUST00000188045 1099 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
SeleQ00690 Gsdmcl-ps-204ENSMUST00000191285 637 ntTSL 3 BASIC9.96□□□□□ -0.82
SeleQ00690 Mlana-201ENSMUST00000025719 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
SeleQ00690 1110017D15Rik-201ENSMUST00000030152 1114 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.96□□□□□ -0.82
SeleQ00690 Pex11b-201ENSMUST00000048766 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
SeleQ00690 Mir433-201ENSMUST00000093564 124 ntBASIC9.96□□□□□ -0.82
SeleQ00690 Ppp1r9b-202ENSMUST00000107748 3095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
SeleQ00690 8430408G22Rik-201ENSMUST00000067354 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
SeleQ00690 Senp3-201ENSMUST00000005336 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
SeleQ00690 Sfmbt1-206ENSMUST00000228006 3299 ntAPPRIS P1 BASIC9.96□□□□□ -0.82
SeleQ00690 4933424N20Rik-201ENSMUST00000200749 1463 ntBASIC9.96□□□□□ -0.82
SeleQ00690 Hexim1-201ENSMUST00000053063 3495 ntAPPRIS P1 BASIC9.96□□□□□ -0.82
SeleQ00690 Tmem200a-203ENSMUST00000218232 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
SeleQ00690 Myo7a-203ENSMUST00000107127 6806 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.96□□□□□ -0.82
SeleQ00690 AC123857.2-201ENSMUST00000225756 1582 ntBASIC9.96□□□□□ -0.82
SeleQ00690 Rfx6-204ENSMUST00000219364 2682 ntTSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
SeleQ00690 Map4k1-203ENSMUST00000208227 2720 ntTSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
SeleQ00690 Map4k1-201ENSMUST00000085835 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
SeleQ00690 Ttc33-203ENSMUST00000118193 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
SeleQ00690 Uchl1os-201ENSMUST00000152002 1685 ntTSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
SeleQ00690 Abca3-201ENSMUST00000039013 6476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
SeleQ00690 4933439K11Rik-203ENSMUST00000169111 1869 ntTSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
SeleQ00690 Gm6210-201ENSMUST00000204734 1942 ntBASIC9.95□□□□□ -0.82
SeleQ00690 Tmbim1-202ENSMUST00000113796 11011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
SeleQ00690 Tmem104-202ENSMUST00000100235 4561 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
SeleQ00690 Tmem104-201ENSMUST00000061450 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
SeleQ00690 Pif1-202ENSMUST00000131483 3309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
SeleQ00690 Mast1-202ENSMUST00000119820 2078 ntTSL 5 BASIC9.95□□□□□ -0.82
SeleQ00690 Zc3h6-202ENSMUST00000110320 4916 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.95□□□□□ -0.82
SeleQ00690 Ccng1-201ENSMUST00000020576 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
SeleQ00690 Lipe-201ENSMUST00000003207 3613 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
SeleQ00690 Rabep2-202ENSMUST00000106407 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
SeleQ00690 Fcrls-201ENSMUST00000090986 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
SeleQ00690 Crat-201ENSMUST00000028207 3833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
SeleQ00690 Abcd1-202ENSMUST00000114461 2323 ntTSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
SeleQ00690 Slc24a4-201ENSMUST00000079020 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
SeleQ00690 Dtnb-201ENSMUST00000077930 2376 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
SeleQ00690 Cyb5rl-203ENSMUST00000106758 2516 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.95□□□□□ -0.82
SeleQ00690 Tbl1xr1-211ENSMUST00000202747 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
SeleQ00690 Sorcs1-201ENSMUST00000072685 4396 ntTSL 5 BASIC9.95□□□□□ -0.82
SeleQ00690 Zmym1-202ENSMUST00000106099 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
SeleQ00690 Trim26-205ENSMUST00000130367 3187 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.95□□□□□ -0.82
SeleQ00690 Acacb-201ENSMUST00000031583 8482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
SeleQ00690 Gm24231-201ENSMUST00000104315 133 ntBASIC9.95□□□□□ -0.82
SeleQ00690 Sectm1a-204ENSMUST00000106120 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.95□□□□□ -0.82
SeleQ00690 Prox1os-201ENSMUST00000110279 828 ntTSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
SeleQ00690 Cspp1-202ENSMUST00000117415 1272 ntTSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
SeleQ00690 Tnfrsf18-203ENSMUST00000122001 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
SeleQ00690 Gm11290-201ENSMUST00000124833 396 ntTSL 3 BASIC9.95□□□□□ -0.82
SeleQ00690 Gm13061-201ENSMUST00000137962 664 ntTSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
SeleQ00690 Asb17os-201ENSMUST00000156292 496 ntTSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
SeleQ00690 4732440D04Rik-202ENSMUST00000159618 413 ntTSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 66.7 ms