Protein–RNA interactions for Protein: P97358

Taf1b, TATA box-binding protein-associated factor RNA polymerase I subunit B, mousemouse

Predictions only

Length 586 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Taf1bP97358 Crhr2-208ENSMUST00000212633 2041 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Taf1bP97358 Ccdc89-201ENSMUST00000061391 2093 ntAPPRIS P1 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Taf1bP97358 Uprt-201ENSMUST00000087867 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Taf1bP97358 Txlng-203ENSMUST00000112315 2525 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Taf1bP97358 Cbl-206ENSMUST00000206147 3452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Taf1bP97358 Cap2-201ENSMUST00000021802 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Taf1bP97358 Vash2-201ENSMUST00000047409 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Taf1bP97358 Ptpn9-201ENSMUST00000034832 4101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Taf1bP97358 Has3-203ENSMUST00000176144 4150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Taf1bP97358 Sugp2-201ENSMUST00000093458 3874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Taf1bP97358 Dbn1-201ENSMUST00000021950 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Taf1bP97358 Sh3bp5l-202ENSMUST00000116376 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Taf1bP97358 Podn-202ENSMUST00000106708 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Taf1bP97358 Ccdc162-203ENSMUST00000099932 2742 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Taf1bP97358 4732471J01Rik-204ENSMUST00000206436 2430 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Taf1bP97358 Ggt1-208ENSMUST00000134503 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Taf1bP97358 Trim34a-202ENSMUST00000106848 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Taf1bP97358 Cd200r1-201ENSMUST00000057488 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Taf1bP97358 Nxf1-211ENSMUST00000184970 5591 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Taf1bP97358 Sun1-203ENSMUST00000100517 1522 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Taf1bP97358 Krtap10-10-201ENSMUST00000218843 1306 ntAPPRIS P1 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Taf1bP97358 Ppil6-201ENSMUST00000105507 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Taf1bP97358 Prdx1-202ENSMUST00000106470 877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Taf1bP97358 Gm14724-201ENSMUST00000118400 537 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Taf1bP97358 Gm13408-201ENSMUST00000119822 798 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Taf1bP97358 Gm8566-201ENSMUST00000120174 465 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Taf1bP97358 Gm13935-201ENSMUST00000121859 798 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Taf1bP97358 Gm44793-201ENSMUST00000136923 582 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Taf1bP97358 AA672651-201ENSMUST00000151550 489 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Taf1bP97358 Tbc1d22bos-201ENSMUST00000159875 826 ntTSL 3 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Taf1bP97358 Snrpa-206ENSMUST00000163311 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Taf1bP97358 Gm24514-201ENSMUST00000174961 285 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Taf1bP97358 A430027H14Rik-202ENSMUST00000192797 618 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Taf1bP97358 Gm18893-201ENSMUST00000198416 943 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Taf1bP97358 Gm8956-201ENSMUST00000203939 825 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Taf1bP97358 Acy1-208ENSMUST00000214275 1284 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Taf1bP97358 AC159819.2-201ENSMUST00000216151 342 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Taf1bP97358 AC154680.1-201ENSMUST00000224376 859 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Taf1bP97358 Il1f10-201ENSMUST00000058056 538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Taf1bP97358 Lcn6-201ENSMUST00000059693 1254 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Taf1bP97358 1110025L11Rik-201ENSMUST00000089104 591 ntAPPRIS P1 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Taf1bP97358 Acadsb-201ENSMUST00000015829 6081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Taf1bP97358 Twnk-201ENSMUST00000026227 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Taf1bP97358 Mcm8-202ENSMUST00000066559 3397 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Taf1bP97358 Mrps35-201ENSMUST00000036111 4162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Taf1bP97358 Pdyn-201ENSMUST00000028883 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Taf1bP97358 Borcs7-201ENSMUST00000074912 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Taf1bP97358 Man1a2-201ENSMUST00000008907 7969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Taf1bP97358 Macrod2-204ENSMUST00000110062 3554 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Taf1bP97358 Kcnk2-202ENSMUST00000110920 3572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Taf1bP97358 Gramd1b-201ENSMUST00000045682 7488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Taf1bP97358 Gm26531-201ENSMUST00000181727 1967 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Taf1bP97358 Tbc1d22a-201ENSMUST00000063414 3229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Taf1bP97358 Chst4-201ENSMUST00000109222 1942 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Taf1bP97358 Gm37437-201ENSMUST00000194451 1937 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Taf1bP97358 Chrna9-201ENSMUST00000031108 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Taf1bP97358 Dph3-202ENSMUST00000067955 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Taf1bP97358 Ocln-201ENSMUST00000022140 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Taf1bP97358 Snap23-202ENSMUST00000110711 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Taf1bP97358 Cdc20b-201ENSMUST00000109244 1620 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Taf1bP97358 Wdr66-202ENSMUST00000121964 4873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Taf1bP97358 Fam114a2-201ENSMUST00000020831 2557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Taf1bP97358 A430108G06Rik-201ENSMUST00000153461 1428 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Taf1bP97358 Cd79b-201ENSMUST00000044228 1431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Taf1bP97358 Myo18a-202ENSMUST00000092884 5117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Taf1bP97358 Ephb3-201ENSMUST00000006112 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Taf1bP97358 Gm10152-201ENSMUST00000193475 1344 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Taf1bP97358 Prc1-211ENSMUST00000174199 2128 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Taf1bP97358 Gm8100-201ENSMUST00000182906 988 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Taf1bP97358 Gm37246-201ENSMUST00000192665 835 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Taf1bP97358 Csrp2-203ENSMUST00000219502 544 ntTSL 3 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Taf1bP97358 Gm40983-201ENSMUST00000222524 502 ntTSL 3 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Taf1bP97358 Gm5705-201ENSMUST00000066241 711 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Taf1bP97358 Mia-201ENSMUST00000071986 566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Taf1bP97358 Atp2b2-203ENSMUST00000101045 8877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Taf1bP97358 Reep3-201ENSMUST00000020023 5430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Taf1bP97358 Accs-201ENSMUST00000041593 2036 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Taf1bP97358 Gdf6-201ENSMUST00000057613 3532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Taf1bP97358 Eef1akmt3-201ENSMUST00000116231 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Taf1bP97358 Tmc8-204ENSMUST00000119455 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Taf1bP97358 Ttc23-202ENSMUST00000107470 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Taf1bP97358 Grb2-203ENSMUST00000106497 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Taf1bP97358 Gm5780-201ENSMUST00000217774 1834 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Taf1bP97358 Gm11924-201ENSMUST00000152306 1750 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Taf1bP97358 Sh3kbp1-206ENSMUST00000112456 7317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Taf1bP97358 Klhl18-201ENSMUST00000068025 4530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Taf1bP97358 Gm26677-201ENSMUST00000180553 1672 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Taf1bP97358 Abcb6-201ENSMUST00000027396 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Taf1bP97358 Cyb5rl-202ENSMUST00000106756 1604 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Taf1bP97358 Elovl6-202ENSMUST00000197070 2275 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Taf1bP97358 Rnf185-201ENSMUST00000064364 2906 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Taf1bP97358 Atxn7l3b-201ENSMUST00000099276 3566 ntAPPRIS P1 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Taf1bP97358 Ikzf5-202ENSMUST00000121033 2231 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Taf1bP97358 Setdb1-201ENSMUST00000015841 4658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Taf1bP97358 Celf2-225ENSMUST00000183091 2177 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Taf1bP97358 Lrrc18-204ENSMUST00000120951 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Taf1bP97358 Tmem104-201ENSMUST00000061450 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Taf1bP97358 Il20ra-201ENSMUST00000020185 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Taf1bP97358 2310035C23Rik-210ENSMUST00000190501 3852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Taf1bP97358 Rmi1-201ENSMUST00000042450 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.1 ms