Protein–RNA interactions for Protein: P81067

Irx3, Iroquois-class homeodomain protein IRX-3, mousemouse

Predictions only

Length 507 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Irx3P81067 Cyb5r3-202ENSMUST00000162178 2547 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Irx3P81067 Alms1-ps1-201ENSMUST00000159498 2166 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Irx3P81067 N6amt1-203ENSMUST00000118310 1700 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Irx3P81067 2810404F17Rik-201ENSMUST00000156615 1704 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Irx3P81067 Fscn2-201ENSMUST00000026445 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Irx3P81067 Dcun1d2-201ENSMUST00000045366 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Irx3P81067 Gm6447-201ENSMUST00000118905 835 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Irx3P81067 Gm11210-201ENSMUST00000150203 422 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Irx3P81067 Gm25668-201ENSMUST00000157700 129 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Irx3P81067 Gm15851-201ENSMUST00000160564 662 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Irx3P81067 Ly6g5b-202ENSMUST00000172854 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Irx3P81067 Fundc1-204ENSMUST00000176638 448 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Irx3P81067 Caly-204ENSMUST00000211283 975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Irx3P81067 Fn3k-201ENSMUST00000026175 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Irx3P81067 Rps3a1-201ENSMUST00000029722 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Irx3P81067 Gm9843-201ENSMUST00000052867 504 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Irx3P81067 Rpl18a-201ENSMUST00000054220 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Irx3P81067 Gm5129-201ENSMUST00000065372 300 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Irx3P81067 Mirlet7c-2-201ENSMUST00000083674 95 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Irx3P81067 Tcirg1-204ENSMUST00000126070 3041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Irx3P81067 Prune1-201ENSMUST00000015855 3140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Irx3P81067 Tle1-201ENSMUST00000030095 2569 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Irx3P81067 Add2-203ENSMUST00000203279 1454 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Irx3P81067 Sspn-201ENSMUST00000032383 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Irx3P81067 Pxn-202ENSMUST00000086523 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Irx3P81067 Rps6ka6-202ENSMUST00000082034 4170 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Irx3P81067 0610009O20Rik-201ENSMUST00000025314 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Irx3P81067 4933406P04Rik-201ENSMUST00000092680 1789 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Irx3P81067 Atp6ap1-201ENSMUST00000019231 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Irx3P81067 G6pc3-201ENSMUST00000070334 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Irx3P81067 Inpp4b-215ENSMUST00000217122 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Irx3P81067 Brat1-202ENSMUST00000100505 3431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Irx3P81067 Crybg2-201ENSMUST00000121391 4761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Irx3P81067 Eno2-216ENSMUST00000204896 1640 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Irx3P81067 Slc25a42-202ENSMUST00000110127 3196 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Irx3P81067 Knop1-202ENSMUST00000063607 4884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Irx3P81067 Pafah1b3-202ENSMUST00000108410 689 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Irx3P81067 Rpl28-ps3-201ENSMUST00000116058 393 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Irx3P81067 Tead1-207ENSMUST00000165036 1248 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Irx3P81067 Tead1-212ENSMUST00000171197 1074 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Irx3P81067 Gm2310-201ENSMUST00000179217 1131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Irx3P81067 4930594M17Rik-201ENSMUST00000181204 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Irx3P81067 Sox2ot-207ENSMUST00000196987 727 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Irx3P81067 5830487J09Rik-201ENSMUST00000198600 1256 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Irx3P81067 Gm5363-201ENSMUST00000211927 938 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Irx3P81067 4930502A04Rik-201ENSMUST00000214059 865 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Irx3P81067 Gm19163-201ENSMUST00000223313 780 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Irx3P81067 Ggact-201ENSMUST00000038075 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Irx3P81067 Mutyh-201ENSMUST00000102699 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Irx3P81067 Usp14-201ENSMUST00000092096 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Irx3P81067 Gm43931-201ENSMUST00000204817 2870 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Irx3P81067 Trim35-201ENSMUST00000022623 3678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Irx3P81067 Smarcb1-202ENSMUST00000121304 1622 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Irx3P81067 1700088E04Rik-212ENSMUST00000190959 1403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Irx3P81067 Gm45765-202ENSMUST00000212921 1313 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Irx3P81067 Cd163l1-201ENSMUST00000084460 3454 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Irx3P81067 Txlna-202ENSMUST00000084264 4847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Irx3P81067 Usp24-201ENSMUST00000094933 10575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Irx3P81067 Sgk2-201ENSMUST00000018012 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Irx3P81067 Cd300lg-201ENSMUST00000017453 2353 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Irx3P81067 Sorcs1-202ENSMUST00000111756 3617 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Irx3P81067 Sorcs1-207ENSMUST00000211008 3617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Irx3P81067 Lhx9-204ENSMUST00000112026 2065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Irx3P81067 AC159195.1-201ENSMUST00000225867 2086 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Irx3P81067 Zfp516-202ENSMUST00000171238 7725 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Irx3P81067 Zfp516-201ENSMUST00000071233 7703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Irx3P81067 Sdccag8-202ENSMUST00000056773 1551 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Irx3P81067 Pink1-202ENSMUST00000105816 1465 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Irx3P81067 4933411K16Rik-201ENSMUST00000164518 1380 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Irx3P81067 Gm37885-201ENSMUST00000192568 1391 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Irx3P81067 Cox16-202ENSMUST00000110340 668 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Irx3P81067 Gm12363-201ENSMUST00000122250 668 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Irx3P81067 Pisd-ps1-203ENSMUST00000145164 789 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Irx3P81067 Gm15917-201ENSMUST00000162771 487 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Irx3P81067 Tex9-206ENSMUST00000183574 1264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Irx3P81067 4931406C07Rik-203ENSMUST00000180339 2756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Irx3P81067 Palld-204ENSMUST00000121785 6349 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Irx3P81067 Glipr2-202ENSMUST00000107855 1816 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Irx3P81067 AC087890.1-201ENSMUST00000219321 1823 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Irx3P81067 Ankmy2-201ENSMUST00000041640 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Irx3P81067 Zfp64-203ENSMUST00000109162 2848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Irx3P81067 Acsm1-201ENSMUST00000047929 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Irx3P81067 Cyth2-208ENSMUST00000211783 1983 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Irx3P81067 Mylip-202ENSMUST00000222178 1954 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Irx3P81067 Sppl2b-211ENSMUST00000220091 3629 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Irx3P81067 Grm7-202ENSMUST00000172951 4197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Irx3P81067 Sufu-204ENSMUST00000120778 1850 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Irx3P81067 Ccrl2-203ENSMUST00000199839 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Irx3P81067 Gm17029-203ENSMUST00000153443 2758 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Irx3P81067 Gm38140-201ENSMUST00000193617 2755 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Irx3P81067 Ap1g2-211ENSMUST00000170285 2596 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Irx3P81067 Duoxa2-201ENSMUST00000028656 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Irx3P81067 Hao1-201ENSMUST00000028704 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Irx3P81067 Plekhb1-203ENSMUST00000107044 1806 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Irx3P81067 Pparg-204ENSMUST00000203732 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Irx3P81067 Etfrf1-207ENSMUST00000111726 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Irx3P81067 Srek1-201ENSMUST00000074616 3934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Irx3P81067 Fchsd1-201ENSMUST00000043437 4270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Irx3P81067 Nrg1-202ENSMUST00000207417 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Irx3P81067 Fam71e1-201ENSMUST00000107927 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 68.1 ms