Protein–RNA interactions for Protein: P70270

Rad54l, DNA repair and recombination protein RAD54-like, mousemouse

Predictions only

Length 747 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rad54lP70270 Erdr1-201ENSMUST00000177591 774 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Rad54lP70270 Gm26740-201ENSMUST00000180456 358 ntTSL 3 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Rad54lP70270 Gm17586-201ENSMUST00000181502 908 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Rad54lP70270 Gm29054-201ENSMUST00000187589 1185 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Rad54lP70270 Gm8885-201ENSMUST00000189382 598 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Rad54lP70270 Gm3961-201ENSMUST00000204425 994 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Rad54lP70270 4930504D19Rik-201ENSMUST00000204799 349 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Rad54lP70270 Txndc17-201ENSMUST00000021158 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Rad54lP70270 AC154252.2-201ENSMUST00000223593 767 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Rad54lP70270 Cks1b-201ENSMUST00000029679 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Rad54lP70270 Ctrb1-201ENSMUST00000034435 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Rad54lP70270 Cnpy2-202ENSMUST00000219037 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Rad54lP70270 Amer2-201ENSMUST00000022561 10506 ntAPPRIS P1 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Rad54lP70270 Gm19692-201ENSMUST00000203856 2084 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Rad54lP70270 Tmx2-203ENSMUST00000111665 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Rad54lP70270 Thap1-201ENSMUST00000036807 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Rad54lP70270 Ptprm-203ENSMUST00000224091 3773 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Rad54lP70270 Camsap3-205ENSMUST00000207432 3865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Rad54lP70270 Trappc9-204ENSMUST00000170633 4688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Rad54lP70270 Mrvi1-201ENSMUST00000005751 6198 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Rad54lP70270 Dysf-210ENSMUST00000153860 6525 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Rad54lP70270 Rubcn-202ENSMUST00000089684 5311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Rad54lP70270 Kpna1-201ENSMUST00000004054 5039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Rad54lP70270 Lynx1-201ENSMUST00000023259 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Rad54lP70270 Api5-201ENSMUST00000028617 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Rad54lP70270 Itga2b-201ENSMUST00000103086 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Rad54lP70270 Tti2-202ENSMUST00000209851 3133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Rad54lP70270 Slc38a6-206ENSMUST00000140523 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Rad54lP70270 Wasf2-202ENSMUST00000105912 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Rad54lP70270 Dpm2-203ENSMUST00000140592 1412 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Rad54lP70270 Mafk-202ENSMUST00000110836 3097 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Rad54lP70270 Rbm5-201ENSMUST00000035199 3064 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Rad54lP70270 Lrig2-201ENSMUST00000046316 7099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Rad54lP70270 Rabepk-207ENSMUST00000145903 2968 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Rad54lP70270 1110046J04Rik-202ENSMUST00000180906 2776 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
Rad54lP70270 Dnaic2-202ENSMUST00000092469 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Rad54lP70270 Synpo-211ENSMUST00000155195 4442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Rad54lP70270 Myocd-201ENSMUST00000101042 2585 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Rad54lP70270 Sorbs3-202ENSMUST00000227259 2481 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Rad54lP70270 Borcs7-201ENSMUST00000074912 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Rad54lP70270 Nfe2l1-210ENSMUST00000167110 3547 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Rad54lP70270 Herpud1-201ENSMUST00000034220 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Rad54lP70270 Otud7b-201ENSMUST00000035519 8043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Rad54lP70270 Col14a1-203ENSMUST00000110221 5679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Rad54lP70270 Ddx46-202ENSMUST00000172272 5676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Rad54lP70270 Izumo1-201ENSMUST00000033100 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Rad54lP70270 Gm5580-201ENSMUST00000122096 1362 ntAPPRIS P1 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Rad54lP70270 1700003D09Rik-201ENSMUST00000141929 1389 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Rad54lP70270 Prr29-202ENSMUST00000106816 771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Rad54lP70270 Rps3-202ENSMUST00000107096 952 ntTSL 3 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Rad54lP70270 Mymx-201ENSMUST00000113529 442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Rad54lP70270 Dgcr2-203ENSMUST00000117082 2987 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Rad54lP70270 Zscan10-203ENSMUST00000117606 891 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
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Rad54lP70270 1700120C18Rik-201ENSMUST00000182952 985 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
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Rad54lP70270 Rtn4-202ENSMUST00000078830 3615 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
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Rad54lP70270 Myo15b-208ENSMUST00000222123 5154 ntTSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Rad54lP70270 Tcn2-201ENSMUST00000020710 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Rad54lP70270 Plcxd3-201ENSMUST00000061925 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Rad54lP70270 Akt1-205ENSMUST00000128300 1342 ntTSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Rad54lP70270 Jup-201ENSMUST00000001592 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Rad54lP70270 Astl-204ENSMUST00000179618 2236 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Rad54lP70270 Pcdhgb6-201ENSMUST00000003599 4684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Rad54lP70270 Gm36235-201ENSMUST00000223158 1694 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
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Rad54lP70270 Dusp14-201ENSMUST00000018792 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Rad54lP70270 Zfp12-203ENSMUST00000077485 4294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Rad54lP70270 Ppp1r10-202ENSMUST00000087211 4255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Rad54lP70270 Gnb4-205ENSMUST00000155737 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Rad54lP70270 Gm43677-201ENSMUST00000198098 2378 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Rad54lP70270 Pdcd1-201ENSMUST00000027507 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Rad54lP70270 Mgll-207ENSMUST00000163271 3991 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Rad54lP70270 6030458C11Rik-201ENSMUST00000057256 3966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Rad54lP70270 Gm26516-201ENSMUST00000180943 1397 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Rad54lP70270 Lrp2-203ENSMUST00000100051 4359 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Rad54lP70270 Gm10767-202ENSMUST00000168767 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Rad54lP70270 Tfb2m-201ENSMUST00000027769 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Rad54lP70270 Slc39a3-205ENSMUST00000168076 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Rad54lP70270 Skap1-202ENSMUST00000100519 1100 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Rad54lP70270 H2-M6-ps-201ENSMUST00000119193 1034 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Rad54lP70270 B230206L02Rik-202ENSMUST00000132584 695 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Rad54lP70270 Gm6963-201ENSMUST00000147879 379 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Rad54lP70270 Hsbp1l1-201ENSMUST00000166219 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Rad54lP70270 Gm5070-201ENSMUST00000177599 862 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Rad54lP70270 Hspb9-201ENSMUST00000017976 652 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Rad54lP70270 Gm9230-201ENSMUST00000188228 532 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.3 ms