Protein–RNA interactions for Protein: P70122

Sbds, Ribosome maturation protein SBDS, mousemouse

Predictions only

Length 250 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SbdsP70122 1700030J22Rik-202ENSMUST00000213068 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
SbdsP70122 Gm7553-201ENSMUST00000185805 1426 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
SbdsP70122 Rbm47-209ENSMUST00000201544 5211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
SbdsP70122 Gm7537-201ENSMUST00000221660 1414 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
SbdsP70122 Kalrn-209ENSMUST00000114963 3207 ntTSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
SbdsP70122 Myo16-203ENSMUST00000207477 7169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
SbdsP70122 Ptbp1-216ENSMUST00000172282 3110 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
SbdsP70122 Rabep2-202ENSMUST00000106407 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
SbdsP70122 9330199G10Rik-202ENSMUST00000221607 1728 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
SbdsP70122 Gm13736-201ENSMUST00000119272 253 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
SbdsP70122 Gm11591-201ENSMUST00000120063 702 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
SbdsP70122 Dgcr6-203ENSMUST00000143343 1280 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
SbdsP70122 AI480526-203ENSMUST00000160099 1017 ntTSL 2 BASIC12.72□□□□□ -0.37
SbdsP70122 Ndufaf2-201ENSMUST00000163558 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
SbdsP70122 Gm17040-201ENSMUST00000168672 548 ntTSL 3 BASIC12.72□□□□□ -0.37
SbdsP70122 Gm25927-201ENSMUST00000175058 117 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
SbdsP70122 1700037F24Rik-201ENSMUST00000181254 973 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
SbdsP70122 Gm29856-201ENSMUST00000191905 1257 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
SbdsP70122 Gm42920-201ENSMUST00000196616 409 ntTSL 3 BASIC12.72□□□□□ -0.37
SbdsP70122 Gm45184-201ENSMUST00000206354 955 ntTSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
SbdsP70122 Gm44702-201ENSMUST00000209194 592 ntTSL 3 BASIC12.72□□□□□ -0.37
SbdsP70122 Spc24-204ENSMUST00000216057 627 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
SbdsP70122 AC162938.2-203ENSMUST00000216604 1134 ntTSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
SbdsP70122 AC139319.1-201ENSMUST00000223331 690 ntTSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
SbdsP70122 AC125209.1-201ENSMUST00000225812 766 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
SbdsP70122 Olfr117-201ENSMUST00000073636 954 ntAPPRIS P1 BASIC12.72□□□□□ -0.37
SbdsP70122 Olfr130-201ENSMUST00000087129 954 ntAPPRIS P1 BASIC12.72□□□□□ -0.37
SbdsP70122 Ascc2-202ENSMUST00000109930 4844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
SbdsP70122 Nudt15-201ENSMUST00000043813 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
SbdsP70122 Maats1-201ENSMUST00000023501 2750 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
SbdsP70122 Syk-201ENSMUST00000055087 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
SbdsP70122 Grm5-201ENSMUST00000107263 3516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
SbdsP70122 Zfp710-202ENSMUST00000164056 5871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
SbdsP70122 Axin2-201ENSMUST00000052915 4260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
SbdsP70122 Gm10545-201ENSMUST00000097612 4969 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
SbdsP70122 Xpnpep1-209ENSMUST00000183108 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
SbdsP70122 Myo7a-204ENSMUST00000107128 7506 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
SbdsP70122 Rims3-202ENSMUST00000106283 6437 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
SbdsP70122 Mapk4-202ENSMUST00000159162 3514 ntTSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
SbdsP70122 BC052040-203ENSMUST00000166472 2770 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
SbdsP70122 Atg4c-203ENSMUST00000180278 2792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
SbdsP70122 Hrg-201ENSMUST00000023590 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
SbdsP70122 Ppp2r1b-202ENSMUST00000114437 3430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
SbdsP70122 Vamp1-203ENSMUST00000100942 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
SbdsP70122 Tctn3-203ENSMUST00000135795 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
SbdsP70122 Dlk1-204ENSMUST00000109843 1300 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
SbdsP70122 AC122197.2-201ENSMUST00000219196 1635 ntBASIC12.71□□□□□ -0.37
SbdsP70122 Gm24830-201ENSMUST00000102024 166 ntBASIC12.71□□□□□ -0.37
SbdsP70122 Arl5c-202ENSMUST00000107563 823 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
SbdsP70122 Gm13342-201ENSMUST00000121055 207 ntBASIC12.71□□□□□ -0.37
SbdsP70122 4932443L11Rik-201ENSMUST00000148353 414 ntTSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
SbdsP70122 Gm7653-201ENSMUST00000214567 508 ntBASIC12.71□□□□□ -0.37
SbdsP70122 Colca2-202ENSMUST00000215038 1269 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
SbdsP70122 AC148335.1-201ENSMUST00000218778 818 ntTSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
SbdsP70122 Gm18636-201ENSMUST00000218846 1066 ntBASIC12.71□□□□□ -0.37
SbdsP70122 Arhgef33-209ENSMUST00000225223 714 ntBASIC12.71□□□□□ -0.37
SbdsP70122 Wdyhv1-206ENSMUST00000227142 786 ntBASIC12.71□□□□□ -0.37
SbdsP70122 4921530L21Rik-201ENSMUST00000045892 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
SbdsP70122 Rpl10l-201ENSMUST00000081908 1023 ntAPPRIS P1 BASIC12.71□□□□□ -0.37
SbdsP70122 Gm26232-201ENSMUST00000083360 166 ntBASIC12.71□□□□□ -0.37
SbdsP70122 Rnu1b6-201ENSMUST00000083839 166 ntBASIC12.71□□□□□ -0.37
SbdsP70122 Gm11559-201ENSMUST00000092694 1096 ntAPPRIS P1 BASIC12.71□□□□□ -0.37
SbdsP70122 Gm10432-202ENSMUST00000223300 4791 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
SbdsP70122 Ash2l-210ENSMUST00000166078 2234 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
SbdsP70122 Tbx4-203ENSMUST00000108047 3153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
SbdsP70122 Nars2-201ENSMUST00000044466 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
SbdsP70122 Spata13-207ENSMUST00000160973 7467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
SbdsP70122 Eif2s1-201ENSMUST00000071230 3405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
SbdsP70122 A230072I06Rik-201ENSMUST00000098935 1839 ntAPPRIS P1 BASIC12.71□□□□□ -0.38
SbdsP70122 Kctd18-210ENSMUST00000164963 2114 ntTSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.38
SbdsP70122 Gng5-202ENSMUST00000118280 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
SbdsP70122 Tctn1-201ENSMUST00000111738 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
SbdsP70122 Mei4-201ENSMUST00000057067 2670 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
SbdsP70122 Cluap1-201ENSMUST00000040881 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
SbdsP70122 Aldoa-203ENSMUST00000106348 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
SbdsP70122 Fads1-201ENSMUST00000010807 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
SbdsP70122 Brsk1-202ENSMUST00000120836 2867 ntTSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.38
SbdsP70122 Tgfbr1-202ENSMUST00000044234 2861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
SbdsP70122 Ms4a15-201ENSMUST00000087923 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
SbdsP70122 Pcgf3-201ENSMUST00000046975 7708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
SbdsP70122 Bpifb6-201ENSMUST00000088955 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
SbdsP70122 Zfp629-202ENSMUST00000084564 5829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
SbdsP70122 1700047I17Rik2-201ENSMUST00000177978 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
SbdsP70122 Eng-202ENSMUST00000113272 3021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
SbdsP70122 Gm37885-201ENSMUST00000192568 1391 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
SbdsP70122 Sec23a-201ENSMUST00000021375 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
SbdsP70122 Gm18983-201ENSMUST00000222884 2729 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
SbdsP70122 Patl1-201ENSMUST00000061618 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
SbdsP70122 Cacna1s-202ENSMUST00000112068 6018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
SbdsP70122 Grm1-203ENSMUST00000105561 4435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
SbdsP70122 Zdhhc20-201ENSMUST00000089473 5186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
SbdsP70122 Ptcd3-201ENSMUST00000082094 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
SbdsP70122 Ngf-202ENSMUST00000106925 1187 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
SbdsP70122 Spata3-209ENSMUST00000152501 743 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
SbdsP70122 Gm7809-201ENSMUST00000153199 742 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
SbdsP70122 Ucma-204ENSMUST00000167607 785 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
SbdsP70122 Faap20-210ENSMUST00000178473 1076 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
SbdsP70122 4930589O11Rik-201ENSMUST00000200768 920 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
SbdsP70122 Slc35d2-202ENSMUST00000220792 917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
SbdsP70122 H1foo-201ENSMUST00000037831 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.2 ms