Protein–RNA interactions for Protein: P62274

Rps29, 40S ribosomal protein S29, mousemouse

Predictions only

Length 56 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rps29P62274 Gm14597-202ENSMUST00000129769 715 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC6.85□□□□□ -1.31
Rps29P62274 Lypd1-203ENSMUST00000159529 989 ntTSL 2 BASIC6.85□□□□□ -1.31
Rps29P62274 Gm26636-201ENSMUST00000181696 1115 ntTSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
Rps29P62274 Pfn1-201ENSMUST00000018437 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
Rps29P62274 Ip6k2-202ENSMUST00000192028 1199 ntTSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
Rps29P62274 Dmrt1i-203ENSMUST00000197311 718 ntTSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
Rps29P62274 Gm4607-201ENSMUST00000206649 577 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
Rps29P62274 Tmem205-203ENSMUST00000213698 705 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.85□□□□□ -1.31
Rps29P62274 AC125206.1-201ENSMUST00000214070 739 ntTSL 5 BASIC6.85□□□□□ -1.31
Rps29P62274 Gm6082-201ENSMUST00000215204 454 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
Rps29P62274 AC110091.1-201ENSMUST00000216004 691 ntTSL 3 BASIC6.85□□□□□ -1.31
Rps29P62274 1700008C04Rik-201ENSMUST00000218606 797 ntTSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
Rps29P62274 Cldn17-201ENSMUST00000069549 1172 ntAPPRIS P1 BASIC6.85□□□□□ -1.31
Rps29P62274 Ifi27-203ENSMUST00000076788 708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
Rps29P62274 Actn1-201ENSMUST00000021554 3734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
Rps29P62274 Synpo-211ENSMUST00000155195 4442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
Rps29P62274 Gabpb1-205ENSMUST00000110424 2613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
Rps29P62274 Srrt-209ENSMUST00000197466 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.85□□□□□ -1.31
Rps29P62274 Srrt-212ENSMUST00000199243 2988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
Rps29P62274 Tcf4-250ENSMUST00000202458 2610 ntTSL 5 BASIC6.85□□□□□ -1.31
Rps29P62274 Add2-208ENSMUST00000203786 2289 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
Rps29P62274 Galnt10-201ENSMUST00000066987 4715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
Rps29P62274 Krt31-201ENSMUST00000007318 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
Rps29P62274 Ppargc1b-202ENSMUST00000075299 3656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
Rps29P62274 Gm20700-201ENSMUST00000176749 2206 ntTSL 3 BASIC6.85□□□□□ -1.31
Rps29P62274 Gga3-202ENSMUST00000106508 3582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
Rps29P62274 Cadm2-202ENSMUST00000120594 3248 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6.85□□□□□ -1.31
Rps29P62274 Zfp810-201ENSMUST00000086278 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
Rps29P62274 Trim56-201ENSMUST00000054384 9279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
Rps29P62274 Crem-233ENSMUST00000154135 2530 ntTSL 5 BASIC6.85□□□□□ -1.31
Rps29P62274 Myo18a-211ENSMUST00000130627 6202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.85□□□□□ -1.31
Rps29P62274 Armcx1-203ENSMUST00000113197 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
Rps29P62274 Dysf-212ENSMUST00000203695 6504 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.85□□□□□ -1.31
Rps29P62274 Hectd2-208ENSMUST00000169036 3842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
Rps29P62274 Spdye4a-201ENSMUST00000085733 1819 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
Rps29P62274 Gm17767-201ENSMUST00000189410 1470 ntTSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
Rps29P62274 Rbfox2-202ENSMUST00000111581 3072 ntTSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
Rps29P62274 Tbx10-201ENSMUST00000041871 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
Rps29P62274 Gm43760-201ENSMUST00000202120 3015 ntBASIC6.84□□□□□ -1.31
Rps29P62274 Coasy-202ENSMUST00000107308 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.84□□□□□ -1.31
Rps29P62274 Fam173b-203ENSMUST00000161061 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.84□□□□□ -1.31
Rps29P62274 Gm36445-201ENSMUST00000209344 1432 ntTSL 5 BASIC6.84□□□□□ -1.31
Rps29P62274 Pgm3-201ENSMUST00000070064 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.84□□□□□ -1.31
Rps29P62274 5033428I22Rik-201ENSMUST00000181638 2040 ntTSL 1 (best) BASIC6.84□□□□□ -1.31
Rps29P62274 Mcpt9-201ENSMUST00000095798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.84□□□□□ -1.31
Rps29P62274 Dgkz-203ENSMUST00000111303 4169 ntTSL 1 (best) BASIC6.84□□□□□ -1.31
Rps29P62274 Git1-201ENSMUST00000037285 3512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.84□□□□□ -1.31
Rps29P62274 Kdelr1-205ENSMUST00000211716 1350 ntTSL 1 (best) BASIC6.84□□□□□ -1.31
Rps29P62274 Yae1d1-204ENSMUST00000222796 1382 ntTSL 5 BASIC6.84□□□□□ -1.31
Rps29P62274 Gramd2-201ENSMUST00000098661 1368 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.84□□□□□ -1.31
Rps29P62274 Myzap-201ENSMUST00000093823 2283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.84□□□□□ -1.31
Rps29P62274 Enah-201ENSMUST00000078719 2889 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.84□□□□□ -1.31
Rps29P62274 AI597479-201ENSMUST00000010434 3458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.84□□□□□ -1.31
Rps29P62274 Vmn1r38-201ENSMUST00000226457 3462 ntAPPRIS P1 BASIC6.84□□□□□ -1.31
Rps29P62274 Npr1-201ENSMUST00000029540 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.84□□□□□ -1.31
Rps29P62274 Spock1-202ENSMUST00000185502 4614 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6.84□□□□□ -1.31
Rps29P62274 Gm26616-202ENSMUST00000195676 3107 ntBASIC6.84□□□□□ -1.31
Rps29P62274 Pou2af1-201ENSMUST00000034554 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.84□□□□□ -1.31
Rps29P62274 Tmc4-202ENSMUST00000121743 2204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.84□□□□□ -1.31
Rps29P62274 Slc7a15-201ENSMUST00000036938 1907 ntTSL 1 (best) BASIC6.84□□□□□ -1.31
Rps29P62274 Sgce-209ENSMUST00000133306 1619 ntTSL 1 (best) BASIC6.84□□□□□ -1.31
Rps29P62274 Olfr1349-204ENSMUST00000207820 1325 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.84□□□□□ -1.31
Rps29P62274 Shc1-203ENSMUST00000107417 3079 ntTSL 1 (best) BASIC6.84□□□□□ -1.31
Rps29P62274 Ero1lb-201ENSMUST00000071973 4239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.84□□□□□ -1.31
Rps29P62274 Gatad2a-206ENSMUST00000212478 3622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.84□□□□□ -1.31
Rps29P62274 Gm26678-201ENSMUST00000181057 3025 ntTSL 5 BASIC6.84□□□□□ -1.31
Rps29P62274 Gm27177-202ENSMUST00000183514 2703 ntBASIC6.84□□□□□ -1.31
Rps29P62274 Nanos2-201ENSMUST00000063563 1563 ntAPPRIS P1 BASIC6.84□□□□□ -1.31
Rps29P62274 4732471J01Rik-204ENSMUST00000206436 2430 ntTSL 1 (best) BASIC6.84□□□□□ -1.31
Rps29P62274 Gm45278-201ENSMUST00000209650 2414 ntTSL 1 (best) BASIC6.84□□□□□ -1.31
Rps29P62274 Ighv5-4-201ENSMUST00000103444 425 ntAPPRIS P1 BASIC6.84□□□□□ -1.31
Rps29P62274 Mir877-201ENSMUST00000104738 85 ntBASIC6.84□□□□□ -1.31
Rps29P62274 Camk1d-202ENSMUST00000114987 1295 ntTSL 1 (best) BASIC6.84□□□□□ -1.31
Rps29P62274 Rpl35a-204ENSMUST00000115078 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.84□□□□□ -1.31
Rps29P62274 Rbm3-202ENSMUST00000115615 1183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.84□□□□□ -1.31
Rps29P62274 Rbm3-203ENSMUST00000115616 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.84□□□□□ -1.31
Rps29P62274 Gm14017-201ENSMUST00000121934 386 ntBASIC6.84□□□□□ -1.31
Rps29P62274 Igf1-206ENSMUST00000122100 651 ntTSL 1 (best) BASIC6.84□□□□□ -1.31
Rps29P62274 Nrg4-204ENSMUST00000130158 1000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.84□□□□□ -1.31
Rps29P62274 4930515B02Rik-201ENSMUST00000140588 591 ntTSL 1 (best) BASIC6.84□□□□□ -1.31
Rps29P62274 Gm16686-201ENSMUST00000141816 396 ntAPPRIS P1 BASIC6.84□□□□□ -1.31
Rps29P62274 C030017D09Rik-201ENSMUST00000163690 923 ntTSL 1 (best) BASIC6.84□□□□□ -1.31
Rps29P62274 Gm6548-201ENSMUST00000167498 1165 ntBASIC6.84□□□□□ -1.31
Rps29P62274 Tmcc1-205ENSMUST00000173031 1024 ntTSL 1 (best) BASIC6.84□□□□□ -1.31
Rps29P62274 Gm25700-201ENSMUST00000177693 110 ntBASIC6.84□□□□□ -1.31
Rps29P62274 Gm9034-201ENSMUST00000182071 1005 ntBASIC6.84□□□□□ -1.31
Rps29P62274 Gm28071-201ENSMUST00000190355 478 ntBASIC6.84□□□□□ -1.31
Rps29P62274 Vdac1-201ENSMUST00000020673 891 ntTSL 5 BASIC6.84□□□□□ -1.31
Rps29P62274 Gm45433-201ENSMUST00000209386 247 ntBASIC6.84□□□□□ -1.31
Rps29P62274 8030455M16Rik-201ENSMUST00000213014 902 ntTSL 1 (best) BASIC6.84□□□□□ -1.31
Rps29P62274 AC153954.1-201ENSMUST00000216959 255 ntBASIC6.84□□□□□ -1.31
Rps29P62274 Gm18730-201ENSMUST00000218038 343 ntBASIC6.84□□□□□ -1.31
Rps29P62274 Kcnk16-202ENSMUST00000225596 2127 ntBASIC6.84□□□□□ -1.31
Rps29P62274 Crip3-201ENSMUST00000024764 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.84□□□□□ -1.31
Rps29P62274 Prg2-201ENSMUST00000028467 838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.84□□□□□ -1.31
Rps29P62274 Fam25c-201ENSMUST00000052126 408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.84□□□□□ -1.31
Rps29P62274 Olfr981-201ENSMUST00000059859 997 ntAPPRIS P1 BASIC6.84□□□□□ -1.31
Rps29P62274 Ifi27-205ENSMUST00000085065 977 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.84□□□□□ -1.31
Rps29P62274 Slc7a7-201ENSMUST00000000984 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.84□□□□□ -1.31
Rps29P62274 Zfp1-201ENSMUST00000077791 1811 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.84□□□□□ -1.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.8 ms