Protein–RNA interactions for Protein: P62270

Rps18, 40S ribosomal protein S18, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 152 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rps18P62270 Wdfy1-205ENSMUST00000113513 4551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Rps18P62270 Wdfy1-206ENSMUST00000113514 4551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Rps18P62270 Wdfy1-207ENSMUST00000113515 4551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Rps18P62270 Prpf19-203ENSMUST00000179297 6035 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Rps18P62270 Pcgf2-203ENSMUST00000103149 817 ntTSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Rps18P62270 Gm23596-201ENSMUST00000104304 132 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
Rps18P62270 Inca1-202ENSMUST00000108541 1150 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Rps18P62270 Stau1-204ENSMUST00000109238 2976 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Rps18P62270 Gm12196-201ENSMUST00000120954 262 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
Rps18P62270 A430060F13Rik-201ENSMUST00000124176 378 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
Rps18P62270 Inca1-205ENSMUST00000126114 1189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Rps18P62270 1700003G13Rik-202ENSMUST00000131342 705 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Rps18P62270 Gm11379-201ENSMUST00000154678 381 ntTSL 3 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Rps18P62270 Snrpa-206ENSMUST00000163311 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Rps18P62270 Gm17099-201ENSMUST00000166780 412 ntTSL 3 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Rps18P62270 Gm19459-201ENSMUST00000176240 835 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
Rps18P62270 Gm26782-202ENSMUST00000181697 971 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Rps18P62270 Rps13-ps2-201ENSMUST00000182017 453 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
Rps18P62270 Gm29539-201ENSMUST00000188031 758 ntTSL 3 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Rps18P62270 Gm42682-201ENSMUST00000198349 1265 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
Rps18P62270 Gm45021-201ENSMUST00000204521 369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Rps18P62270 Gm13522-202ENSMUST00000209682 997 ntTSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Rps18P62270 AC141438.2-201ENSMUST00000215068 271 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
Rps18P62270 CT571245.2-201ENSMUST00000218421 305 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
Rps18P62270 Gm270-201ENSMUST00000223010 976 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
Rps18P62270 Gm807-202ENSMUST00000224929 408 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
Rps18P62270 AC135114.1-201ENSMUST00000228682 270 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
Rps18P62270 Abcb6-201ENSMUST00000027396 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Rps18P62270 Gm9826-201ENSMUST00000029124 1299 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
Rps18P62270 Rbp2-201ENSMUST00000035029 672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Rps18P62270 Lcn8-201ENSMUST00000038482 651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Rps18P62270 Inca1-201ENSMUST00000073625 1218 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Rps18P62270 Mir219a-1-201ENSMUST00000083621 110 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
Rps18P62270 Fam227a-204ENSMUST00000187519 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Rps18P62270 Mob1a-201ENSMUST00000038658 4119 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Rps18P62270 Cnih4-204ENSMUST00000134115 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Rps18P62270 Cd79b-201ENSMUST00000044228 1431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Rps18P62270 Naa50-201ENSMUST00000063520 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Rps18P62270 Sugp2-201ENSMUST00000093458 3874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Rps18P62270 Tmc6-201ENSMUST00000026659 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Rps18P62270 Tspoap1-201ENSMUST00000039627 7616 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Rps18P62270 Gabpb1-206ENSMUST00000110425 4153 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Rps18P62270 Ramp1-201ENSMUST00000097648 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Rps18P62270 Gm28323-201ENSMUST00000186817 2499 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
Rps18P62270 Plxna1-201ENSMUST00000049845 5810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Rps18P62270 Cacna1c-201ENSMUST00000075591 7584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Rps18P62270 Gabpb1-205ENSMUST00000110424 2613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Rps18P62270 Capn3-204ENSMUST00000110716 2752 ntTSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Rps18P62270 Clca2-203ENSMUST00000198993 2774 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Rps18P62270 Slx4-201ENSMUST00000040790 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Rps18P62270 Nr1i3-202ENSMUST00000075469 1305 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Rps18P62270 Rai1-203ENSMUST00000102688 6921 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Rps18P62270 Ndel1-202ENSMUST00000101017 1646 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Rps18P62270 Smarcb1-202ENSMUST00000121304 1622 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Rps18P62270 Cldn15-202ENSMUST00000111093 1902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Rps18P62270 Klhl26-201ENSMUST00000066597 2991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Rps18P62270 Zfp41-201ENSMUST00000054555 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Rps18P62270 Rps6ka6-203ENSMUST00000096348 4151 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Rps18P62270 Pprc1-201ENSMUST00000062322 5205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Rps18P62270 Ldb3-201ENSMUST00000022327 5119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Rps18P62270 Sowahb-201ENSMUST00000061328 3900 ntAPPRIS P1 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Rps18P62270 Rbbp5-207ENSMUST00000190997 2856 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Rps18P62270 Pex3-201ENSMUST00000019945 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Rps18P62270 Map3k4-201ENSMUST00000089058 5305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Rps18P62270 Gpr45-201ENSMUST00000114761 1546 ntAPPRIS P1 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Rps18P62270 Kcnn2-201ENSMUST00000066890 3682 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Rps18P62270 Parp16-201ENSMUST00000069000 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Rps18P62270 Lctl-201ENSMUST00000034969 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Rps18P62270 Tcn2-201ENSMUST00000020710 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Rps18P62270 Pepd-201ENSMUST00000075068 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Rps18P62270 0610040F04Rik-201ENSMUST00000137478 1734 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Rps18P62270 Gm7049-201ENSMUST00000223520 1712 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Rps18P62270 Egr3-204ENSMUST00000225200 3940 ntAPPRIS P2 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Rps18P62270 Abcg5-201ENSMUST00000066175 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Rps18P62270 Jrk-201ENSMUST00000050234 5853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Rps18P62270 Capn5-202ENSMUST00000107112 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Rps18P62270 Abca7-202ENSMUST00000132517 6696 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Rps18P62270 D6Ertd527e-203ENSMUST00000203747 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Rps18P62270 Gm12714-201ENSMUST00000143391 669 ntTSL 3 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Rps18P62270 Mcfd2-205ENSMUST00000145895 751 ntTSL 2 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Rps18P62270 Gm21976-204ENSMUST00000186911 528 ntTSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Rps18P62270 1700119H24Rik-201ENSMUST00000187558 588 ntTSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Rps18P62270 Gm5051-201ENSMUST00000204085 485 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Rps18P62270 Lysmd4-208ENSMUST00000208698 551 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Rps18P62270 Gm35368-201ENSMUST00000209554 1244 ntTSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Rps18P62270 Mt3-202ENSMUST00000211915 440 ntTSL 3 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Rps18P62270 Cct2-206ENSMUST00000219573 637 ntTSL 3 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Rps18P62270 4930578I06Rik-201ENSMUST00000022532 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Rps18P62270 Ms4a8a-201ENSMUST00000025636 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Rps18P62270 4930569F06Rik-201ENSMUST00000036821 433 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Rps18P62270 Micu1-204ENSMUST00000165563 2442 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Rps18P62270 Rhox9-202ENSMUST00000170643 2422 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Rps18P62270 Pax6-202ENSMUST00000090397 3069 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Rps18P62270 Smg7-203ENSMUST00000111836 3928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Rps18P62270 5031415H12Rik-201ENSMUST00000181546 2481 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Rps18P62270 Tmem56-204ENSMUST00000135818 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Rps18P62270 Klc2-204ENSMUST00000116563 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Rps18P62270 Rec8-201ENSMUST00000002395 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Rps18P62270 Plcb2-206ENSMUST00000159756 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Rps18P62270 Ppfia4-205ENSMUST00000189361 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
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