Protein–RNA interactions for Protein: P61961

Ufm1, Ubiquitin-fold modifier 1, mousemouse

Predictions only

Length 85 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ufm1P61961 Eif5a2-201ENSMUST00000060500 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ufm1P61961 Pabpc4-204ENSMUST00000106243 3111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ufm1P61961 Cacng5-201ENSMUST00000039071 3705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ufm1P61961 Mfap3l-203ENSMUST00000161421 4142 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ufm1P61961 Ebag9-201ENSMUST00000022964 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ufm1P61961 Pou4f2-201ENSMUST00000034115 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ufm1P61961 Pfas-201ENSMUST00000021282 6373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ufm1P61961 Plxnb2-201ENSMUST00000060808 6394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ufm1P61961 Vdr-201ENSMUST00000023119 4370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ufm1P61961 Nars2-201ENSMUST00000044466 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ufm1P61961 Ahsa2-202ENSMUST00000109539 3583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ufm1P61961 Mfsd13b-205ENSMUST00000216241 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ufm1P61961 Dhx58os-201ENSMUST00000137154 1594 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ufm1P61961 Gm13848-202ENSMUST00000211663 1560 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ufm1P61961 Evi5l-208ENSMUST00000176825 3728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ufm1P61961 Ubxn10-203ENSMUST00000105811 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ufm1P61961 Pygo2-202ENSMUST00000107413 2911 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ufm1P61961 Kdm2a-201ENSMUST00000047898 8578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ufm1P61961 Srr-201ENSMUST00000065211 3699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ufm1P61961 Tpra1-218ENSMUST00000203185 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ufm1P61961 Arvcf-202ENSMUST00000115610 3829 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ufm1P61961 Ppp1r3b-204ENSMUST00000211648 4386 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ufm1P61961 Pnma5-202ENSMUST00000114540 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ufm1P61961 Rnf123-218ENSMUST00000178267 4309 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ufm1P61961 Nr1h3-203ENSMUST00000111355 1672 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ufm1P61961 Gm10851-201ENSMUST00000192087 1685 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ufm1P61961 Shtn1-201ENSMUST00000047511 4081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ufm1P61961 Cers6-201ENSMUST00000028426 7038 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ufm1P61961 Grik3-201ENSMUST00000030676 8973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ufm1P61961 Ighv1-80-201ENSMUST00000103547 351 ntAPPRIS P1 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ufm1P61961 Pyy-202ENSMUST00000127381 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ufm1P61961 Gm13376-201ENSMUST00000128743 448 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ufm1P61961 Gm16191-201ENSMUST00000141445 520 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ufm1P61961 Fhit-206ENSMUST00000162278 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ufm1P61961 Gm3890-201ENSMUST00000182416 207 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Ufm1P61961 Gm42937-201ENSMUST00000197360 752 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Ufm1P61961 Gm45641-201ENSMUST00000209775 452 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ufm1P61961 Ppcdc-207ENSMUST00000214339 738 ntTSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ufm1P61961 AC087891.2-201ENSMUST00000219293 658 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ufm1P61961 Gm4935-201ENSMUST00000221316 1198 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Ufm1P61961 Pcgf5-203ENSMUST00000224679 1269 ntAPPRIS P5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ufm1P61961 St13-201ENSMUST00000023039 1089 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ufm1P61961 Nudt17-201ENSMUST00000029742 1039 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ufm1P61961 Aga-201ENSMUST00000033920 1181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ufm1P61961 Got2-201ENSMUST00000034097 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ufm1P61961 Lrriq1-203ENSMUST00000166240 5232 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ufm1P61961 Acvr1c-201ENSMUST00000028178 9162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ufm1P61961 Gimap5-201ENSMUST00000055558 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ufm1P61961 Fam60a-201ENSMUST00000054080 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ufm1P61961 AC108858.2-201ENSMUST00000228186 1425 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Ufm1P61961 Il21r-201ENSMUST00000033000 2499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ufm1P61961 Lbr-201ENSMUST00000005003 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ufm1P61961 Gnb1l-202ENSMUST00000090086 3549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ufm1P61961 Coro6-205ENSMUST00000108391 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ufm1P61961 Gfap-201ENSMUST00000067444 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ufm1P61961 Jmjd8-201ENSMUST00000026832 2091 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ufm1P61961 Vmn1r45-206ENSMUST00000227977 3297 ntAPPRIS P1 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ufm1P61961 Cnmd-203ENSMUST00000165835 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ufm1P61961 Abat-201ENSMUST00000065987 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ufm1P61961 Ctps2-205ENSMUST00000112302 3223 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ufm1P61961 Ciz1-204ENSMUST00000113334 2871 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ufm1P61961 Epm2aip1-202ENSMUST00000135807 4245 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ufm1P61961 Tbl1xr1-211ENSMUST00000202747 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ufm1P61961 Arhgap4-201ENSMUST00000064376 3353 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ufm1P61961 Mmd2-201ENSMUST00000037048 3317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ufm1P61961 Asb13-201ENSMUST00000042288 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ufm1P61961 Gm15163-201ENSMUST00000120749 1302 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Ufm1P61961 Gm45897-201ENSMUST00000212679 1998 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ufm1P61961 C2-201ENSMUST00000025230 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ufm1P61961 Polr1b-201ENSMUST00000028874 2769 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ufm1P61961 Nek5-202ENSMUST00000209656 2253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ufm1P61961 Gstt2-208ENSMUST00000220440 2254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ufm1P61961 Kansl3-201ENSMUST00000010597 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ufm1P61961 Ctsd-201ENSMUST00000066401 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ufm1P61961 Tmem136-201ENSMUST00000061833 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ufm1P61961 Gripap1-202ENSMUST00000101694 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ufm1P61961 Defb30-203ENSMUST00000111208 503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ufm1P61961 Defb30-204ENSMUST00000111209 721 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ufm1P61961 Ccdc169-203ENSMUST00000118963 740 ntTSL 3 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ufm1P61961 Dgcr6-203ENSMUST00000143343 1280 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ufm1P61961 Gm20404-201ENSMUST00000174032 621 ntTSL 3 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ufm1P61961 Gm25927-201ENSMUST00000175058 117 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Ufm1P61961 Gm8494-201ENSMUST00000178171 1233 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Ufm1P61961 Nat8f7-202ENSMUST00000179613 686 ntAPPRIS P1 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ufm1P61961 Gm40466-201ENSMUST00000212174 422 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Ufm1P61961 Gm5781-201ENSMUST00000219792 443 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Ufm1P61961 Ccdc169-202ENSMUST00000061099 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ufm1P61961 n-R5s195-201ENSMUST00000082891 119 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Ufm1P61961 Mroh1-204ENSMUST00000159218 5085 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ufm1P61961 Ldhal6b-201ENSMUST00000189788 1445 ntAPPRIS P1 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ufm1P61961 AC093022.4-203ENSMUST00000228523 2657 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Ufm1P61961 Ntng2-202ENSMUST00000071201 1881 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ufm1P61961 Trpc6-201ENSMUST00000050433 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ufm1P61961 Acsf3-202ENSMUST00000212781 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ufm1P61961 Ppnr-201ENSMUST00000190974 3525 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ufm1P61961 Trnt1-203ENSMUST00000113248 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Ufm1P61961 Lrrfip2-214ENSMUST00000217117 1363 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.55
Ufm1P61961 Dppa4-201ENSMUST00000050705 1378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.55
Ufm1P61961 1700110I01Rik-201ENSMUST00000112775 1671 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.55
Ufm1P61961 Gm36235-201ENSMUST00000223158 1694 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.7 ms