Protein–RNA interactions for Protein: P56213

Gfer, FAD-linked sulfhydryl oxidase ALR, mousemouse

Predictions only

Length 198 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GferP56213 Mip-201ENSMUST00000026455 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
GferP56213 Cfc1-201ENSMUST00000027298 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
GferP56213 Pemt-201ENSMUST00000000310 953 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.08□□□□□ -0.8
GferP56213 Sfxn3-201ENSMUST00000062213 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
GferP56213 Olfr117-201ENSMUST00000073636 954 ntAPPRIS P1 BASIC10.08□□□□□ -0.8
GferP56213 Olfr130-201ENSMUST00000087129 954 ntAPPRIS P1 BASIC10.08□□□□□ -0.8
GferP56213 Myo7a-213ENSMUST00000205746 6689 ntTSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
GferP56213 Irak2-201ENSMUST00000059286 3196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
GferP56213 Gm37885-201ENSMUST00000192568 1391 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
GferP56213 Tmc4-201ENSMUST00000038743 2310 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
GferP56213 Pacrg-201ENSMUST00000041463 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
GferP56213 Slc39a3-205ENSMUST00000168076 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
GferP56213 Dsc2-202ENSMUST00000075214 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
GferP56213 Nr1h3-203ENSMUST00000111355 1672 ntTSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
GferP56213 Hk1-205ENSMUST00000130422 2916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
GferP56213 Mpp4-204ENSMUST00000186477 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
GferP56213 Herpud1-201ENSMUST00000034220 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
GferP56213 Vmac-202ENSMUST00000164907 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
GferP56213 Ripk3-202ENSMUST00000168716 1964 ntTSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
GferP56213 Tsga10-202ENSMUST00000088072 3837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
GferP56213 Mbnl2-204ENSMUST00000227012 2390 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
GferP56213 Abat-201ENSMUST00000065987 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
GferP56213 Usp24-201ENSMUST00000094933 10575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
GferP56213 Brap-202ENSMUST00000111765 3861 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
GferP56213 Opn1sw-203ENSMUST00000147483 1426 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
GferP56213 Clasp1-216ENSMUST00000189738 5373 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
GferP56213 Pole3-201ENSMUST00000030091 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
GferP56213 Extl3-201ENSMUST00000022550 5977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
GferP56213 4833422C13Rik-202ENSMUST00000160385 2828 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
GferP56213 Thsd4-202ENSMUST00000098660 8796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
GferP56213 Ttc14-201ENSMUST00000099153 9661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
GferP56213 AC160411.1-201ENSMUST00000218544 4560 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
GferP56213 Tollip-201ENSMUST00000001950 3788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
GferP56213 Rbm5-201ENSMUST00000035199 3064 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
GferP56213 Birc3-201ENSMUST00000013949 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
GferP56213 Zscan29-201ENSMUST00000079024 2465 ntTSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
GferP56213 Slc34a3-201ENSMUST00000006638 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
GferP56213 Acsm1-201ENSMUST00000047929 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
GferP56213 H2-Ob-202ENSMUST00000167280 1878 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
GferP56213 Gm45428-201ENSMUST00000209619 1789 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
GferP56213 Aldoa-203ENSMUST00000106348 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
GferP56213 Klk1b16-201ENSMUST00000005933 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
GferP56213 Litaf-202ENSMUST00000117360 763 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.07□□□□□ -0.8
GferP56213 Isg20-204ENSMUST00000121645 1087 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
GferP56213 Mpc1-202ENSMUST00000124023 555 ntTSL 2 BASIC10.07□□□□□ -0.8
GferP56213 Tspan17-208ENSMUST00000163915 459 ntTSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
GferP56213 Psme1-202ENSMUST00000172738 681 ntTSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
GferP56213 Gm29233-201ENSMUST00000190311 281 ntTSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
GferP56213 2010310C07Rik-202ENSMUST00000190889 842 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
GferP56213 Mrpl30-205ENSMUST00000193673 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.07□□□□□ -0.8
GferP56213 Gm44405-201ENSMUST00000198952 126 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
GferP56213 Tmem176b-206ENSMUST00000203355 1202 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
GferP56213 Gm9299-201ENSMUST00000206392 1140 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
GferP56213 Reep1-202ENSMUST00000212631 953 ntTSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
GferP56213 Lsm7-208ENSMUST00000220225 1129 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
GferP56213 AC130829.1-201ENSMUST00000221548 494 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
GferP56213 Tomm7-201ENSMUST00000030851 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
GferP56213 Ier3-201ENSMUST00000003635 1131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
GferP56213 Rpl18a-201ENSMUST00000054220 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
GferP56213 Utp23-201ENSMUST00000059599 740 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
GferP56213 Gm10268-201ENSMUST00000085340 555 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
GferP56213 Olfr1428-201ENSMUST00000087824 945 ntAPPRIS P1 BASIC10.07□□□□□ -0.8
GferP56213 Mei1-201ENSMUST00000089178 3974 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
GferP56213 Poc1a-201ENSMUST00000072206 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
GferP56213 Paqr5-201ENSMUST00000034817 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
GferP56213 Ccdc151-202ENSMUST00000115336 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
GferP56213 Ep400-202ENSMUST00000112433 3399 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
GferP56213 Zfp341-201ENSMUST00000081926 3299 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
GferP56213 Gal3st4-203ENSMUST00000161647 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
GferP56213 Syt15-202ENSMUST00000119693 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
GferP56213 Atxn2l-203ENSMUST00000167759 4023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
GferP56213 Ldhal6b-201ENSMUST00000189788 1445 ntAPPRIS P1 BASIC10.07□□□□□ -0.8
GferP56213 Cd74-202ENSMUST00000097563 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
GferP56213 Rgs3-205ENSMUST00000107424 4084 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
GferP56213 Tti2-202ENSMUST00000209851 3133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
GferP56213 Zfp853-203ENSMUST00000212715 3133 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
GferP56213 Cdh18-204ENSMUST00000165614 2162 ntTSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
GferP56213 Mmel1-207ENSMUST00000163732 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
GferP56213 Patl1-201ENSMUST00000061618 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
GferP56213 Smim1-208ENSMUST00000143047 3373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
GferP56213 Gm13848-202ENSMUST00000211663 1560 ntTSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
GferP56213 Kdelr1-201ENSMUST00000002855 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
GferP56213 Ggt1-208ENSMUST00000134503 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
GferP56213 Ttll3-206ENSMUST00000204026 1472 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
GferP56213 Hsd3b3-201ENSMUST00000090743 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
GferP56213 L3mbtl2-208ENSMUST00000174229 2578 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
GferP56213 Slx4ip-201ENSMUST00000028737 2556 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
GferP56213 Grpel2-201ENSMUST00000062991 4030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
GferP56213 Rgma-202ENSMUST00000119206 3481 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
GferP56213 Ggt6-201ENSMUST00000076443 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
GferP56213 Gm2606-201ENSMUST00000100754 1002 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
GferP56213 Gm24830-201ENSMUST00000102024 166 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
GferP56213 Gm12286-201ENSMUST00000119246 1002 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
GferP56213 Gm15824-201ENSMUST00000119516 955 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
GferP56213 Gm12036-201ENSMUST00000120008 530 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
GferP56213 Gm12502-201ENSMUST00000120197 444 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
GferP56213 Gm5637-201ENSMUST00000153890 1119 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
GferP56213 C130026I21Rik-205ENSMUST00000161267 652 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.06□□□□□ -0.8
GferP56213 Gm15494-202ENSMUST00000171665 451 ntTSL 2 BASIC10.06□□□□□ -0.8
GferP56213 Gm29127-201ENSMUST00000188304 517 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
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