Protein–RNA interactions for Protein: P52955

Lbx1, Transcription factor LBX1, mousemouse

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Length 282 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lbx1P52955 Dpp6-201ENSMUST00000071500 3826 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Lbx1P52955 Olfr130-201ENSMUST00000087129 954 ntAPPRIS P1 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Lbx1P52955 Olfr372-201ENSMUST00000093434 1016 ntAPPRIS P1 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Lbx1P52955 Brsk1-204ENSMUST00000205666 1398 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Lbx1P52955 Akr1b8-201ENSMUST00000038406 1358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Lbx1P52955 Dnmt3b-204ENSMUST00000088976 4130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Lbx1P52955 Mfsd13b-205ENSMUST00000216241 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Lbx1P52955 Etfdh-201ENSMUST00000029386 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Lbx1P52955 Xylb-201ENSMUST00000039610 3383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Lbx1P52955 Cacnb2-202ENSMUST00000114719 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Lbx1P52955 Ate1-204ENSMUST00000178534 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Lbx1P52955 Asb10-202ENSMUST00000117900 1432 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Lbx1P52955 Hk1-202ENSMUST00000099691 4278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Lbx1P52955 Tectb-202ENSMUST00000120936 1349 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Lbx1P52955 Tlr9-201ENSMUST00000062241 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Lbx1P52955 Gzf1-201ENSMUST00000028928 4232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Lbx1P52955 Prkca-202ENSMUST00000100302 2265 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Lbx1P52955 Pnoc-201ENSMUST00000059339 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Lbx1P52955 Dmkn-205ENSMUST00000165887 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Lbx1P52955 Gm12626-201ENSMUST00000117339 1983 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Lbx1P52955 Thrb-203ENSMUST00000091471 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Lbx1P52955 Arcn1-201ENSMUST00000034607 4072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Lbx1P52955 Sp100-213ENSMUST00000155094 1666 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Lbx1P52955 Fam155a-201ENSMUST00000110969 3388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Lbx1P52955 Adcyap1r1-202ENSMUST00000070756 6107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Lbx1P52955 Serpinh1-201ENSMUST00000094154 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Lbx1P52955 Gm13192-201ENSMUST00000101199 208 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Lbx1P52955 Gm23062-201ENSMUST00000102349 110 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Lbx1P52955 Gm2000-201ENSMUST00000102782 445 ntAPPRIS P1 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Lbx1P52955 Banf2-202ENSMUST00000110032 409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Lbx1P52955 Rbmx-202ENSMUST00000114726 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
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Lbx1P52955 Gm10443-201ENSMUST00000119024 210 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Lbx1P52955 Gm12961-201ENSMUST00000120507 1050 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Lbx1P52955 Tnfrsf14-201ENSMUST00000123514 1018 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Lbx1P52955 Gm26838-201ENSMUST00000180485 911 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Lbx1P52955 Gm33707-201ENSMUST00000195135 569 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Lbx1P52955 Gm20568-201ENSMUST00000197129 208 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Lbx1P52955 Mrpl23-207ENSMUST00000210803 590 ntTSL 3 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Lbx1P52955 AC159263.1-201ENSMUST00000220746 482 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Lbx1P52955 Banf2-201ENSMUST00000037722 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Lbx1P52955 Rpl3-201ENSMUST00000081650 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Lbx1P52955 Apbb2-203ENSMUST00000159512 6632 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Lbx1P52955 Clmp-201ENSMUST00000034522 4154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Lbx1P52955 Amz2-203ENSMUST00000103061 1832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Lbx1P52955 Cul5-209ENSMUST00000166367 5942 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Lbx1P52955 Cpt2-201ENSMUST00000030345 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Lbx1P52955 Llgl2-201ENSMUST00000103032 3551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Lbx1P52955 Bap1-201ENSMUST00000022458 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Lbx1P52955 Cxcr5-204ENSMUST00000215293 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Lbx1P52955 Angptl7-201ENSMUST00000030840 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Lbx1P52955 Sema7a-201ENSMUST00000043059 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
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Lbx1P52955 Xlr-202ENSMUST00000067782 1860 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Lbx1P52955 Cep97-202ENSMUST00000117468 2887 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Lbx1P52955 Ska1-201ENSMUST00000040188 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
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Lbx1P52955 Hdgfl2-201ENSMUST00000002911 2264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Lbx1P52955 Prkx-202ENSMUST00000114044 2639 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Lbx1P52955 Notch1-201ENSMUST00000028288 9488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Lbx1P52955 G3bp2-203ENSMUST00000167918 4232 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
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Lbx1P52955 Slc8b1-204ENSMUST00000111890 2775 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Lbx1P52955 Gnai1-201ENSMUST00000074694 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
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Lbx1P52955 Fam187b-203ENSMUST00000129773 1213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
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Lbx1P52955 Gm21844-201ENSMUST00000178699 663 ntTSL 3 BASIC11.84□□□□□ -0.51
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Lbx1P52955 Tbc1d21-201ENSMUST00000040217 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Lbx1P52955 BC030500-201ENSMUST00000062978 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Lbx1P52955 Mlkl-202ENSMUST00000120432 1976 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Lbx1P52955 Gucy2e-202ENSMUST00000108664 4415 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Lbx1P52955 Dpysl4-202ENSMUST00000121184 2727 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Lbx1P52955 Epb41-207ENSMUST00000105975 5235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Lbx1P52955 Fam46a-201ENSMUST00000034802 5479 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Lbx1P52955 Gm15850-201ENSMUST00000134998 2049 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Lbx1P52955 Rph3a-203ENSMUST00000202326 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Lbx1P52955 Add2-208ENSMUST00000203786 2289 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Lbx1P52955 Kifc3-202ENSMUST00000169353 2898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Lbx1P52955 Gm43273-201ENSMUST00000199649 2594 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Lbx1P52955 Sema4b-201ENSMUST00000032754 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Lbx1P52955 Ccser2-202ENSMUST00000090024 7509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Lbx1P52955 Gm8206-201ENSMUST00000164139 1956 ntTSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Lbx1P52955 Cacna1g-209ENSMUST00000107791 8002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Lbx1P52955 Rbpjl-201ENSMUST00000017151 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Lbx1P52955 Edil3-203ENSMUST00000118731 2721 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
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