Protein–RNA interactions for Protein: P50704

Defa6, Alpha-defensin 6/12, mousemouse

Predictions only

Length 93 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Defa6P50704 Tmx2-203ENSMUST00000111665 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
Defa6P50704 Micalcl-201ENSMUST00000033033 2259 ntTSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
Defa6P50704 Rita1-201ENSMUST00000031599 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
Defa6P50704 Zfp366-201ENSMUST00000056558 6382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
Defa6P50704 Krt7-201ENSMUST00000068904 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
Defa6P50704 Pex26-201ENSMUST00000088561 4093 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
Defa6P50704 Ppp1r10-201ENSMUST00000087210 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
Defa6P50704 Add2-204ENSMUST00000203366 3407 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.19□□□□□ -0.94
Defa6P50704 Krt35-201ENSMUST00000103127 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
Defa6P50704 2810404F17Rik-201ENSMUST00000156615 1704 ntTSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
Defa6P50704 Fbxl18-202ENSMUST00000110766 7857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
Defa6P50704 Spata20-201ENSMUST00000041705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
Defa6P50704 Pla2g4b-201ENSMUST00000126150 2790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.19□□□□□ -0.94
Defa6P50704 Brd3-210ENSMUST00000164296 2791 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.19□□□□□ -0.94
Defa6P50704 Myo5a-206ENSMUST00000136731 6480 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.19□□□□□ -0.94
Defa6P50704 Ipo4-201ENSMUST00000047131 3846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
Defa6P50704 Pnkd-202ENSMUST00000087225 2859 ntTSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
Defa6P50704 Gm13657-201ENSMUST00000135682 1939 ntTSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
Defa6P50704 Syn2-202ENSMUST00000169345 3854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
Defa6P50704 Tfr2-201ENSMUST00000031729 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
Defa6P50704 Evl-204ENSMUST00000172409 1955 ntTSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
Defa6P50704 Git2-202ENSMUST00000086564 2984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.19□□□□□ -0.94
Defa6P50704 Rapgef3-203ENSMUST00000126854 4005 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
Defa6P50704 Hao1-201ENSMUST00000028704 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
Defa6P50704 Sec16a-201ENSMUST00000091252 8737 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.19□□□□□ -0.94
Defa6P50704 Tyro3-202ENSMUST00000110783 4460 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
Defa6P50704 Svop-201ENSMUST00000058472 3379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
Defa6P50704 Apol7a-203ENSMUST00000175919 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
Defa6P50704 Nup50-201ENSMUST00000165443 4741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
Defa6P50704 Srp54b-202ENSMUST00000218879 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
Defa6P50704 4833439L19Rik-208ENSMUST00000153065 2502 ntTSL 5 BASIC9.19□□□□□ -0.94
Defa6P50704 Cyb5r3-202ENSMUST00000162178 2547 ntTSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
Defa6P50704 Tmem53-202ENSMUST00000106433 913 ntTSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
Defa6P50704 Ndufa13-201ENSMUST00000110167 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
Defa6P50704 Gm13185-201ENSMUST00000131044 944 ntTSL 3 BASIC9.19□□□□□ -0.94
Defa6P50704 Nsd3-203ENSMUST00000136107 3818 ntTSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
Defa6P50704 Ube4bos1-202ENSMUST00000151896 1286 ntTSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
Defa6P50704 Abhd14a-202ENSMUST00000171678 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
Defa6P50704 Gm28911-201ENSMUST00000188837 117 ntBASIC9.19□□□□□ -0.94
Defa6P50704 2810429I04Rik-210ENSMUST00000189464 868 ntTSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
Defa6P50704 Gm29608-201ENSMUST00000190444 463 ntBASIC9.19□□□□□ -0.94
Defa6P50704 Gm7653-201ENSMUST00000214567 508 ntBASIC9.19□□□□□ -0.94
Defa6P50704 Gm17870-201ENSMUST00000219489 1174 ntBASIC9.19□□□□□ -0.94
Defa6P50704 Timm9-206ENSMUST00000221367 836 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.19□□□□□ -0.94
Defa6P50704 AC147241.1-201ENSMUST00000222173 785 ntTSL 3 BASIC9.19□□□□□ -0.94
Defa6P50704 Swi5-201ENSMUST00000050410 775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
Defa6P50704 Cby3-201ENSMUST00000052596 703 ntTSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
Defa6P50704 A730061H03Rik-201ENSMUST00000066106 465 ntAPPRIS P1 BASIC9.19□□□□□ -0.94
Defa6P50704 Gm10322-201ENSMUST00000095646 336 ntAPPRIS P1 BASIC9.19□□□□□ -0.94
Defa6P50704 Pip5k1b-201ENSMUST00000025800 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
Defa6P50704 Ccdc106-202ENSMUST00000108571 1318 ntTSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
Defa6P50704 Gm29455-201ENSMUST00000186504 2659 ntTSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
Defa6P50704 Lgi4-201ENSMUST00000039775 4037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
Defa6P50704 Nhsl1-202ENSMUST00000100054 6795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.19□□□□□ -0.94
Defa6P50704 Gpr101-201ENSMUST00000057645 5410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
Defa6P50704 Haus7-201ENSMUST00000033737 1380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
Defa6P50704 Dscaml1-201ENSMUST00000034592 6886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
Defa6P50704 Fhl2-202ENSMUST00000185893 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
Defa6P50704 Spr-ps1-203ENSMUST00000187705 2892 ntBASIC9.19□□□□□ -0.94
Defa6P50704 Tmem184a-202ENSMUST00000110832 4326 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
Defa6P50704 Mmel1-202ENSMUST00000080559 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.19□□□□□ -0.94
Defa6P50704 Nlgn1-205ENSMUST00000193603 11807 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
Defa6P50704 Myh1-203ENSMUST00000124516 6081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
Defa6P50704 Duoxa1-202ENSMUST00000110537 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
Defa6P50704 Rab8a-201ENSMUST00000003121 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
Defa6P50704 4931406P16Rik-202ENSMUST00000108074 6224 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.19□□□□□ -0.94
Defa6P50704 Dmrtc1c1-201ENSMUST00000118218 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
Defa6P50704 Dmrtc1c2-203ENSMUST00000120314 1611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
Defa6P50704 Gm12280-201ENSMUST00000155836 1624 ntTSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
Defa6P50704 Gpr19-208ENSMUST00000165392 1643 ntTSL 3 BASIC9.19□□□□□ -0.94
Defa6P50704 Mirt1-202ENSMUST00000180667 1633 ntTSL 5 BASIC9.19□□□□□ -0.94
Defa6P50704 A730071L15Rik-201ENSMUST00000181545 1615 ntAPPRIS P1 BASIC9.19□□□□□ -0.94
Defa6P50704 Gpr19-202ENSMUST00000066107 1647 ntTSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
Defa6P50704 Bcar3-201ENSMUST00000029766 3311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
Defa6P50704 Gm15684-201ENSMUST00000160605 1814 ntTSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
Defa6P50704 Gm8108-202ENSMUST00000170207 1961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC9.19□□□□□ -0.94
Defa6P50704 Cldn19-202ENSMUST00000094823 4168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
Defa6P50704 Trim9-202ENSMUST00000110522 4405 ntTSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
Defa6P50704 Bicd2-202ENSMUST00000110084 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
Defa6P50704 Lrmp-201ENSMUST00000032396 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
Defa6P50704 Gcc1-202ENSMUST00000090511 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
Defa6P50704 Zfp433-202ENSMUST00000200889 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
Defa6P50704 Gm32687-201ENSMUST00000220314 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
Defa6P50704 Stk10-201ENSMUST00000102821 5026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
Defa6P50704 Hhipl2-201ENSMUST00000065900 2525 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.19□□□□□ -0.94
Defa6P50704 5430419D17Rik-203ENSMUST00000208921 7948 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.18□□□□□ -0.94
Defa6P50704 Crispld2-202ENSMUST00000108972 2928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
Defa6P50704 Sox8-201ENSMUST00000025003 3000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
Defa6P50704 Ush1c-201ENSMUST00000009667 3072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
Defa6P50704 Gm43937-201ENSMUST00000204640 3122 ntBASIC9.18□□□□□ -0.94
Defa6P50704 Car12-202ENSMUST00000085420 3639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
Defa6P50704 Armc2-201ENSMUST00000095729 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.18□□□□□ -0.94
Defa6P50704 Gm11555-202ENSMUST00000104929 638 ntAPPRIS P1 BASIC9.18□□□□□ -0.94
Defa6P50704 Nox3-201ENSMUST00000115800 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
Defa6P50704 Fcnb-202ENSMUST00000117486 873 ntTSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
Defa6P50704 Rpl9-203ENSMUST00000120094 680 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.18□□□□□ -0.94
Defa6P50704 Gm15429-201ENSMUST00000151268 798 ntBASIC9.18□□□□□ -0.94
Defa6P50704 Uchl1os-201ENSMUST00000152002 1685 ntTSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
Defa6P50704 9230105E05Rik-201ENSMUST00000161291 2250 ntTSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
Defa6P50704 Nfatc2-209ENSMUST00000171689 2742 ntTSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.5 ms