Protein–RNA interactions for Protein: P50637

Tspo, Translocator protein, mousemouse

Predictions only

Length 169 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TspoP50637 Brap-202ENSMUST00000111765 3861 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
TspoP50637 Iqsec2-201ENSMUST00000096275 5252 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.27□□□□□ -0.77
TspoP50637 B930036N10Rik-202ENSMUST00000181170 3544 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
TspoP50637 Mthfd1l-201ENSMUST00000043735 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
TspoP50637 Chchd3-202ENSMUST00000115091 1363 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
TspoP50637 Nanos2-201ENSMUST00000063563 1563 ntAPPRIS P1 BASIC10.26□□□□□ -0.77
TspoP50637 Mfsd4b5-203ENSMUST00000164566 2372 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
TspoP50637 Paqr5-201ENSMUST00000034817 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
TspoP50637 Ipo13-201ENSMUST00000036156 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
TspoP50637 Onecut1-201ENSMUST00000056006 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
TspoP50637 Pars2-202ENSMUST00000106781 3046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
TspoP50637 Trpc7-207ENSMUST00000173817 2406 ntTSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
TspoP50637 Lhfpl1-201ENSMUST00000040084 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
TspoP50637 Abcb9-201ENSMUST00000031354 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
TspoP50637 Gm15587-201ENSMUST00000146326 3493 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
TspoP50637 Grhl2-201ENSMUST00000022895 4947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
TspoP50637 Gm43984-201ENSMUST00000204572 2864 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
TspoP50637 Gipr-201ENSMUST00000094790 2856 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
TspoP50637 Ttc14-201ENSMUST00000099153 9661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
TspoP50637 Tcf4-252ENSMUST00000202477 1873 ntTSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
TspoP50637 Tbc1d14-210ENSMUST00000140607 4649 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
TspoP50637 1700030J22Rik-202ENSMUST00000213068 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
TspoP50637 Gm12502-201ENSMUST00000120197 444 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
TspoP50637 Gm15806-201ENSMUST00000120696 955 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
TspoP50637 Gm13563-201ENSMUST00000125518 643 ntTSL 3 BASIC10.26□□□□□ -0.77
TspoP50637 Psme1-202ENSMUST00000172738 681 ntTSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
TspoP50637 Fgfr3-ps-201ENSMUST00000195511 1137 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
TspoP50637 Gm42442-201ENSMUST00000197951 1133 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
TspoP50637 Dera-204ENSMUST00000203216 688 ntTSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
TspoP50637 Gm44958-201ENSMUST00000203734 736 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
TspoP50637 Gm4598-201ENSMUST00000206756 1080 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
TspoP50637 Gm5904-201ENSMUST00000210286 865 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
TspoP50637 AC158516.1-201ENSMUST00000213921 205 ntTSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
TspoP50637 Erp27-201ENSMUST00000032343 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
TspoP50637 Wdr74-201ENSMUST00000049424 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
TspoP50637 Phgr1-201ENSMUST00000061360 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
TspoP50637 Mrvi1-202ENSMUST00000125758 5953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.26□□□□□ -0.77
TspoP50637 Olfr56-202ENSMUST00000102785 1930 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
TspoP50637 Sgce-201ENSMUST00000004750 1703 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
TspoP50637 Gm9008-201ENSMUST00000097218 2353 ntAPPRIS P1 BASIC10.26□□□□□ -0.77
TspoP50637 Serpine1-201ENSMUST00000041388 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
TspoP50637 Ppp2r5c-204ENSMUST00000221074 1971 ntTSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
TspoP50637 Osgin1-201ENSMUST00000098365 1959 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
TspoP50637 Nom1-201ENSMUST00000001611 9219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
TspoP50637 Wdr17-211ENSMUST00000175915 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
TspoP50637 Abat-201ENSMUST00000065987 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
TspoP50637 Asl-203ENSMUST00000160129 2413 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
TspoP50637 Stx4a-202ENSMUST00000121705 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
TspoP50637 Lgi4-201ENSMUST00000039775 4037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
TspoP50637 Gucy1a3-204ENSMUST00000193924 4710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
TspoP50637 Cd19-204ENSMUST00000206325 2452 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
TspoP50637 Slc31a2-201ENSMUST00000084530 1820 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
TspoP50637 Stk10-201ENSMUST00000102821 5026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
TspoP50637 Syt7-202ENSMUST00000076968 6624 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
TspoP50637 Fbxl22-201ENSMUST00000056890 3935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
TspoP50637 Plrg1-202ENSMUST00000122128 1608 ntTSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
TspoP50637 Smpd2-201ENSMUST00000019965 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
TspoP50637 Gm6157-201ENSMUST00000199935 1897 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
TspoP50637 Cd300lf-201ENSMUST00000051264 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
TspoP50637 H3f3a-205ENSMUST00000161308 2841 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
TspoP50637 Gm37542-201ENSMUST00000192563 2832 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
TspoP50637 Banp-204ENSMUST00000170857 5444 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
TspoP50637 Nfatc4-202ENSMUST00000172271 3775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
TspoP50637 Gsdme-205ENSMUST00000170142 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
TspoP50637 Gm43172-201ENSMUST00000202139 2137 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
TspoP50637 Atxn2l-203ENSMUST00000167759 4023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
TspoP50637 Fam160b2-201ENSMUST00000022690 4033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
TspoP50637 Zc3hc1-210ENSMUST00000152391 1673 ntTSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
TspoP50637 Lman1l-202ENSMUST00000093832 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
TspoP50637 Acad8-201ENSMUST00000060513 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
TspoP50637 Olfr658-202ENSMUST00000210641 2915 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
TspoP50637 Olfr658-201ENSMUST00000089296 2912 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
TspoP50637 Ssh1-201ENSMUST00000077689 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
TspoP50637 Pacrg-201ENSMUST00000041463 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
TspoP50637 Atp8a2-202ENSMUST00000131670 1725 ntTSL 2 BASIC10.25□□□□□ -0.77
TspoP50637 Mybl1-202ENSMUST00000115468 2493 ntTSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
TspoP50637 Tut1-201ENSMUST00000096239 2747 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.25□□□□□ -0.77
TspoP50637 Entpd5-203ENSMUST00000110272 4972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
TspoP50637 Rad54l-202ENSMUST00000102705 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
TspoP50637 4833439L19Rik-208ENSMUST00000153065 2502 ntTSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
TspoP50637 Ldhd-201ENSMUST00000070004 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
TspoP50637 Ctdspl2-201ENSMUST00000036647 5053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
TspoP50637 Rgs3-205ENSMUST00000107424 4084 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
TspoP50637 Alkbh2-202ENSMUST00000112279 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
TspoP50637 Eaf2-204ENSMUST00000114829 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
TspoP50637 Gm12314-201ENSMUST00000118104 538 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
TspoP50637 Car15-201ENSMUST00000118960 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
TspoP50637 Cdkn1a-202ENSMUST00000119901 748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.25□□□□□ -0.77
TspoP50637 Mpc1-202ENSMUST00000124023 555 ntTSL 2 BASIC10.25□□□□□ -0.77
TspoP50637 Cd209g-201ENSMUST00000130372 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
TspoP50637 2010320O07Rik-201ENSMUST00000160935 525 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
TspoP50637 Pfdn6-204ENSMUST00000174048 560 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.25□□□□□ -0.77
TspoP50637 1700065I16Rik-202ENSMUST00000185477 813 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
TspoP50637 Gm29649-201ENSMUST00000185649 419 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
TspoP50637 Gm44405-201ENSMUST00000198952 126 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
TspoP50637 Chfr-212ENSMUST00000200038 606 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
TspoP50637 Reep1-202ENSMUST00000212631 953 ntTSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
TspoP50637 Gm45925-201ENSMUST00000218882 744 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
TspoP50637 1500011B03Rik-201ENSMUST00000061251 579 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
TspoP50637 Gm22058-201ENSMUST00000083393 310 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.8 ms