Protein–RNA interactions for Protein: P50207

Hoxc13, Homeobox protein Hox-C13, mousemouse

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Length 328 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxc13P50207 Mapk4-202ENSMUST00000159162 3514 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Hoxc13P50207 Trpv6-203ENSMUST00000201471 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Hoxc13P50207 2310035C23Rik-201ENSMUST00000039173 4328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Hoxc13P50207 Ankrd33b-204ENSMUST00000123325 7466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Hoxc13P50207 Trim26-205ENSMUST00000130367 3187 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Hoxc13P50207 Phrf1-201ENSMUST00000106027 5248 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Hoxc13P50207 Gtf2ird1-224ENSMUST00000202280 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Hoxc13P50207 Kif2a-202ENSMUST00000117423 2023 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Hoxc13P50207 5033428I22Rik-201ENSMUST00000181638 2040 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Hoxc13P50207 Armcx2-203ENSMUST00000119010 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Hoxc13P50207 Trim9-209ENSMUST00000222316 3049 ntTSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Hoxc13P50207 H3f3b-201ENSMUST00000016703 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Hoxc13P50207 Gpd1-201ENSMUST00000023760 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Hoxc13P50207 Fam49b-201ENSMUST00000063838 3797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Hoxc13P50207 AC138329.2-201ENSMUST00000225579 1842 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Hoxc13P50207 Cpsf7-201ENSMUST00000038379 3604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Hoxc13P50207 Tbx10-201ENSMUST00000041871 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Hoxc13P50207 Acsf3-202ENSMUST00000212781 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Hoxc13P50207 Rbm5-201ENSMUST00000035199 3064 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Hoxc13P50207 Pphln1-203ENSMUST00000109256 3759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Hoxc13P50207 Riox2-206ENSMUST00000160571 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Hoxc13P50207 Tubb4a-201ENSMUST00000071135 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Hoxc13P50207 Gm43289-201ENSMUST00000200537 1475 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Hoxc13P50207 Lzts3-201ENSMUST00000045761 4201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Hoxc13P50207 Gm19692-201ENSMUST00000203856 2084 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Hoxc13P50207 Pde9a-201ENSMUST00000047168 2065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Hoxc13P50207 Phactr3-202ENSMUST00000103066 2680 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Hoxc13P50207 Gm20605-201ENSMUST00000177545 4464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Hoxc13P50207 Gm13205-201ENSMUST00000123548 562 ntTSL 3 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Hoxc13P50207 Asb8-202ENSMUST00000123626 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Hoxc13P50207 Asb8-203ENSMUST00000123922 1162 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Hoxc13P50207 Omt2a-203ENSMUST00000166056 1167 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Hoxc13P50207 Sap25-201ENSMUST00000166099 1101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Hoxc13P50207 Gm26759-201ENSMUST00000181773 1251 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Hoxc13P50207 Gm42682-201ENSMUST00000198349 1265 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Hoxc13P50207 D530033B14Rik-202ENSMUST00000206282 216 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
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Hoxc13P50207 Gm45781-201ENSMUST00000212860 539 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Hoxc13P50207 Cox6a2-201ENSMUST00000033049 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Hoxc13P50207 Lcn8-201ENSMUST00000038482 651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Hoxc13P50207 Kiss1r-201ENSMUST00000045529 3163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Hoxc13P50207 Maged2-202ENSMUST00000112697 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
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Hoxc13P50207 Actn1-201ENSMUST00000021554 3734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Hoxc13P50207 Sdc4-201ENSMUST00000017153 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Hoxc13P50207 C5ar1-201ENSMUST00000050770 2481 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Hoxc13P50207 Spag1-201ENSMUST00000047348 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Hoxc13P50207 Gm45428-201ENSMUST00000209619 1789 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Hoxc13P50207 Cnst-201ENSMUST00000040706 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Hoxc13P50207 Uba6-202ENSMUST00000113373 3504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Hoxc13P50207 Hells-201ENSMUST00000025965 5868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Hoxc13P50207 Armcx2-201ENSMUST00000035559 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Hoxc13P50207 Sema6d-208ENSMUST00000103241 6157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Hoxc13P50207 Wdr18-201ENSMUST00000045247 3911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Hoxc13P50207 C130050O18Rik-202ENSMUST00000163940 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Hoxc13P50207 Myh14-201ENSMUST00000048102 6457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Hoxc13P50207 Acap2-201ENSMUST00000058033 6493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Hoxc13P50207 Tubgcp3-201ENSMUST00000000776 3797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
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Hoxc13P50207 Psap-203ENSMUST00000165878 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Hoxc13P50207 Zfp444-204ENSMUST00000108567 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Hoxc13P50207 Cyp2c53-ps-203ENSMUST00000176493 1443 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
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Hoxc13P50207 E130018N17Rik-201ENSMUST00000129713 1309 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
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Hoxc13P50207 Nudt18-201ENSMUST00000089049 3926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Hoxc13P50207 Slc39a9-204ENSMUST00000217889 2155 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Hoxc13P50207 Aspm-205ENSMUST00000200083 6072 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Hoxc13P50207 Slc6a18-204ENSMUST00000220650 1728 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Hoxc13P50207 Trav13-1-201ENSMUST00000103651 331 ntAPPRIS P1 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Hoxc13P50207 Gm15207-201ENSMUST00000119259 442 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
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Hoxc13P50207 Cep97-206ENSMUST00000122280 1057 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Hoxc13P50207 1700001G11Rik-203ENSMUST00000153646 764 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Hoxc13P50207 Ctdspl-202ENSMUST00000172464 798 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Hoxc13P50207 1110038B12Rik-208ENSMUST00000174714 520 ntTSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Hoxc13P50207 Mir3102-201ENSMUST00000175555 104 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Hoxc13P50207 Crnde-207ENSMUST00000180102 732 ntTSL 3 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Hoxc13P50207 Rbakdn-201ENSMUST00000198334 520 ntTSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Hoxc13P50207 Gm6450-201ENSMUST00000200896 574 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Hoxc13P50207 Mcee-201ENSMUST00000037205 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Hoxc13P50207 Nudt7-201ENSMUST00000066514 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Hoxc13P50207 Rpl9-ps6-201ENSMUST00000078034 691 ntAPPRIS P1 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Hoxc13P50207 Rpl35a-201ENSMUST00000078804 491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Hoxc13P50207 Fam13c-202ENSMUST00000105436 3380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Hoxc13P50207 C77080-202ENSMUST00000097873 5033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Hoxc13P50207 Dcaf4-201ENSMUST00000021645 2008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Hoxc13P50207 C1qtnf6-201ENSMUST00000023075 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Hoxc13P50207 Slc38a1-201ENSMUST00000088452 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
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Hoxc13P50207 AC093022.4-203ENSMUST00000228523 2657 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
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