Protein–RNA interactions for Protein: P49769

Psen1, Presenilin-1, mousemouse

Predictions only

Length 467 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Psen1P49769 Cngb1-201ENSMUST00000093268 1512 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Psen1P49769 Lgals12-203ENSMUST00000159983 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Psen1P49769 AC153938.1-201ENSMUST00000220354 1425 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Psen1P49769 Fmo2-202ENSMUST00000111510 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Psen1P49769 Ccdc7a-202ENSMUST00000108747 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Psen1P49769 Nek3-202ENSMUST00000110730 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Psen1P49769 Scrn3-202ENSMUST00000112050 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Psen1P49769 Tcf4-250ENSMUST00000202458 2610 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Psen1P49769 Tollip-204ENSMUST00000151890 1753 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Psen1P49769 Pitpnm2-205ENSMUST00000161273 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Psen1P49769 Pir-201ENSMUST00000033749 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Psen1P49769 Capn3-205ENSMUST00000110719 2778 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Psen1P49769 Kcnd3-201ENSMUST00000079169 2102 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Psen1P49769 Rbm11-203ENSMUST00000114253 2699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Psen1P49769 Prx-203ENSMUST00000108355 5433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Psen1P49769 Prkd1-201ENSMUST00000002765 3653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Psen1P49769 Gm14481-201ENSMUST00000117178 629 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Psen1P49769 Gm8805-201ENSMUST00000117848 313 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Psen1P49769 Gm14660-201ENSMUST00000119809 575 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Psen1P49769 Cdk4-202ENSMUST00000120226 714 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Psen1P49769 Gm13792-201ENSMUST00000121350 423 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Psen1P49769 Gm22985-201ENSMUST00000122754 116 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Psen1P49769 Gm2639-201ENSMUST00000156881 1297 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Psen1P49769 Gm16147-201ENSMUST00000162143 373 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Psen1P49769 Gm15716-201ENSMUST00000162457 404 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Psen1P49769 S100a14-201ENSMUST00000164481 915 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Psen1P49769 Gm27731-201ENSMUST00000185192 107 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Psen1P49769 Gm28450-201ENSMUST00000187349 638 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Psen1P49769 Lsmem2-201ENSMUST00000191791 369 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Psen1P49769 Ssr2-202ENSMUST00000192495 620 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Psen1P49769 Lamtor1-202ENSMUST00000193465 661 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Psen1P49769 Gm38250-202ENSMUST00000195108 462 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Psen1P49769 Gm42619-201ENSMUST00000197564 1136 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Psen1P49769 Gm5717-201ENSMUST00000198243 1062 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Psen1P49769 Sult3a1-202ENSMUST00000218204 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Psen1P49769 4930466K18Rik-201ENSMUST00000219458 906 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Psen1P49769 AC165254.1-201ENSMUST00000220736 599 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Psen1P49769 AC122924.1-201ENSMUST00000222044 163 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Psen1P49769 Mrto4-201ENSMUST00000030513 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Psen1P49769 Gps2-201ENSMUST00000057884 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Psen1P49769 Dmrtc1c2-201ENSMUST00000087896 1255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Psen1P49769 Vmn1r195-201ENSMUST00000091736 1088 ntAPPRIS P1 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Psen1P49769 Sult3a1-201ENSMUST00000092597 1047 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Psen1P49769 Tcf4-230ENSMUST00000201205 2270 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Psen1P49769 Mdh1b-201ENSMUST00000114094 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Psen1P49769 Ftsj1-201ENSMUST00000033513 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Psen1P49769 Tbc1d1-201ENSMUST00000043893 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Psen1P49769 Apol9b-201ENSMUST00000109775 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Psen1P49769 Trim2-203ENSMUST00000107691 7428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Psen1P49769 Ngly1-207ENSMUST00000224656 2329 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Psen1P49769 Tmtc3-201ENSMUST00000058154 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Psen1P49769 Cpped1-202ENSMUST00000096272 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Psen1P49769 Mageb10-ps-201ENSMUST00000119697 1407 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Psen1P49769 Serpine3-201ENSMUST00000171692 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Psen1P49769 Wdr59-202ENSMUST00000038193 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Psen1P49769 Dennd6b-201ENSMUST00000078953 4607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Psen1P49769 Gm8110-202ENSMUST00000211297 1782 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Psen1P49769 Tnks1bp1-201ENSMUST00000048400 4799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Psen1P49769 Dnajb4-204ENSMUST00000144950 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Psen1P49769 Elk3-204ENSMUST00000151153 1336 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Psen1P49769 Gm5605-201ENSMUST00000208940 1305 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Psen1P49769 Zmynd15-201ENSMUST00000039093 2804 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Psen1P49769 Tktl2-201ENSMUST00000002025 2021 ntAPPRIS P1 BASIC13.12□□□□□ -0.31
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Psen1P49769 Cpa1-201ENSMUST00000031806 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Psen1P49769 Micalcl-201ENSMUST00000033033 2259 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Psen1P49769 Cldn12-201ENSMUST00000060947 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Psen1P49769 Rxra-206ENSMUST00000166775 3216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Psen1P49769 Hk3-202ENSMUST00000123097 2896 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Psen1P49769 Zfp541-202ENSMUST00000209369 4879 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
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Psen1P49769 Faah-201ENSMUST00000049095 3827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Psen1P49769 Pars2-202ENSMUST00000106781 3046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Psen1P49769 Elp4-202ENSMUST00000122965 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Psen1P49769 Ndufaf7-201ENSMUST00000024887 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Psen1P49769 Zbtb7b-201ENSMUST00000029677 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Psen1P49769 Pou5f2-201ENSMUST00000175955 1394 ntAPPRIS P1 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Psen1P49769 Rnf113a2-201ENSMUST00000183146 1383 ntAPPRIS P1 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Psen1P49769 Cops7b-202ENSMUST00000121534 5383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Psen1P49769 Ifna13-201ENSMUST00000105149 819 ntAPPRIS P1 BASIC13.11□□□□□ -0.31
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Psen1P49769 Gm12539-201ENSMUST00000121549 1098 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Psen1P49769 4933427G23Rik-202ENSMUST00000126393 544 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Psen1P49769 Gm11948-201ENSMUST00000142322 539 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Psen1P49769 Gm14866-201ENSMUST00000149206 2118 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Psen1P49769 Psme1-202ENSMUST00000172738 681 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Psen1P49769 Gm28356-201ENSMUST00000186941 927 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Psen1P49769 Gm28195-201ENSMUST00000186992 372 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Psen1P49769 Gm29516-201ENSMUST00000190402 468 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Psen1P49769 Gm45233-201ENSMUST00000203633 898 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Psen1P49769 Gm6458-201ENSMUST00000211573 635 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Psen1P49769 Apoa5-203ENSMUST00000213878 727 ntTSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Psen1P49769 AC153962.4-201ENSMUST00000217878 242 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Psen1P49769 AC159263.1-201ENSMUST00000220746 482 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Psen1P49769 AC116589.9-201ENSMUST00000221462 908 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Psen1P49769 AC126253.1-201ENSMUST00000227974 824 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Psen1P49769 Tmem86b-201ENSMUST00000055085 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Psen1P49769 Gm9955-201ENSMUST00000067987 309 ntAPPRIS P1 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.7 ms