Protein–RNA interactions for Protein: P47806

Gli1, Zinc finger protein GLI1, mousemouse

Predictions only

Length 1,111 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gli1P47806 Klhdc7b-202ENSMUST00000225666 3951 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Gli1P47806 Gm12968-201ENSMUST00000138291 1454 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Gli1P47806 Gpr139-201ENSMUST00000084650 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Gli1P47806 Pabpc4-202ENSMUST00000080178 3019 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Gli1P47806 L3mbtl2-208ENSMUST00000174229 2578 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Gli1P47806 Sdad1-201ENSMUST00000031364 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Gli1P47806 Ndc1-204ENSMUST00000139560 4584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Gli1P47806 Gm9881-201ENSMUST00000068783 3205 ntAPPRIS P1 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Gli1P47806 Inip-201ENSMUST00000095063 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Gli1P47806 Mtmr10-201ENSMUST00000032736 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Gli1P47806 Gm37105-201ENSMUST00000192251 2085 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
Gli1P47806 Atxn2l-203ENSMUST00000167759 4023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Gli1P47806 Gja8-201ENSMUST00000062944 6940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Gli1P47806 Dlgap1-210ENSMUST00000146730 3936 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Gli1P47806 Src-201ENSMUST00000029175 3906 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Gli1P47806 Arhgef2-206ENSMUST00000175779 3065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Gli1P47806 Krba1-202ENSMUST00000077093 8380 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Gli1P47806 Adipor2-202ENSMUST00000169744 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Gli1P47806 Gm14608-201ENSMUST00000120030 1553 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
Gli1P47806 Ercc2-201ENSMUST00000062831 3578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Gli1P47806 Kif26b-201ENSMUST00000160789 6216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Gli1P47806 Gm14132-201ENSMUST00000117188 1719 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
Gli1P47806 Kctd10-202ENSMUST00000102581 3103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Gli1P47806 Ptbp1-216ENSMUST00000172282 3110 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Gli1P47806 Mapk4-202ENSMUST00000159162 3514 ntTSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Gli1P47806 Mob1a-201ENSMUST00000038658 4119 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Gli1P47806 Rgs3-205ENSMUST00000107424 4084 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Gli1P47806 Vsx2-201ENSMUST00000021665 3270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Gli1P47806 Egr2-202ENSMUST00000105438 2864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Gli1P47806 Myoc-201ENSMUST00000028020 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Gli1P47806 Ccdc89-201ENSMUST00000061391 2093 ntAPPRIS P1 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Gli1P47806 Chil1-201ENSMUST00000082060 1687 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Gli1P47806 Ufc1-202ENSMUST00000111302 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Gli1P47806 Timm10-202ENSMUST00000111631 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Gli1P47806 Gm11658-201ENSMUST00000120913 1008 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
Gli1P47806 Bcas1os1-201ENSMUST00000133586 1239 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Gli1P47806 U2af1l4-215ENSMUST00000166257 546 ntTSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Gli1P47806 Gm20482-202ENSMUST00000174729 825 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
Gli1P47806 Gm2383-201ENSMUST00000181461 807 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
Gli1P47806 Gm4819-201ENSMUST00000182170 1009 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
Gli1P47806 Gm2467-201ENSMUST00000182266 1010 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
Gli1P47806 1700095B10Rik-201ENSMUST00000182349 978 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Gli1P47806 Gm6981-201ENSMUST00000182467 1008 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
Gli1P47806 Gm11523-203ENSMUST00000184482 802 ntTSL 3 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Gli1P47806 Hax1-207ENSMUST00000198782 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Gli1P47806 H2-Oa-201ENSMUST00000025192 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Gli1P47806 Ssc4d-201ENSMUST00000054895 1191 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Gli1P47806 Usmg5-201ENSMUST00000096014 341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Gli1P47806 Chrdl1-204ENSMUST00000166406 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Gli1P47806 4732471J01Rik-204ENSMUST00000206436 2430 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Gli1P47806 5930412G12Rik-201ENSMUST00000091324 2403 ntTSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Gli1P47806 Treh-201ENSMUST00000034609 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Gli1P47806 Ttbk2-202ENSMUST00000057135 11066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Gli1P47806 Avpr2-201ENSMUST00000033765 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Gli1P47806 Zfp1-201ENSMUST00000077791 1811 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Gli1P47806 BC052040-203ENSMUST00000166472 2770 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Gli1P47806 Retreg1-206ENSMUST00000228306 1430 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
Gli1P47806 Traf7-201ENSMUST00000070777 2384 ntTSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Gli1P47806 Tram1l1-201ENSMUST00000058994 3889 ntAPPRIS P1 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Gli1P47806 Slc25a22-203ENSMUST00000106007 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Gli1P47806 Nfe2l1-211ENSMUST00000167149 4596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Gli1P47806 Zfp516-202ENSMUST00000171238 7725 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Gli1P47806 Zfp516-201ENSMUST00000071233 7703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Gli1P47806 Poll-201ENSMUST00000026239 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Gli1P47806 Cdh7-202ENSMUST00000112701 4945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Gli1P47806 Kcnip4-207ENSMUST00000176191 2116 ntTSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Gli1P47806 Stox2-209ENSMUST00000211882 9696 ntTSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Gli1P47806 0610040F04Rik-201ENSMUST00000137478 1734 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Gli1P47806 3110062M04Rik-203ENSMUST00000115007 3326 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Gli1P47806 Tnk1-201ENSMUST00000001626 2778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Gli1P47806 Pla2g4f-201ENSMUST00000054651 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Gli1P47806 Lrriq1-203ENSMUST00000166240 5232 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Gli1P47806 Egfl7-201ENSMUST00000100290 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Gli1P47806 Gm38157-201ENSMUST00000194178 1698 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
Gli1P47806 Zfp263-201ENSMUST00000023176 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Gli1P47806 Dnmt3l-205ENSMUST00000138785 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Gli1P47806 Lrfn5-201ENSMUST00000055815 4410 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Gli1P47806 Cramp1l-201ENSMUST00000073337 7517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Gli1P47806 Tbl1xr1-211ENSMUST00000202747 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Gli1P47806 Dmbt1-206ENSMUST00000213064 5779 ntTSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Gli1P47806 Ocln-203ENSMUST00000159459 1950 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Gli1P47806 Kremen1-201ENSMUST00000020662 4856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Gli1P47806 Tspan4-202ENSMUST00000117634 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Gli1P47806 Emd-204ENSMUST00000119197 768 ntTSL 3 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Gli1P47806 Gm4986-201ENSMUST00000119731 549 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
Gli1P47806 Gm13297-201ENSMUST00000120205 934 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
Gli1P47806 Gm13123-201ENSMUST00000122173 492 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
Gli1P47806 Gm25668-201ENSMUST00000157700 129 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
Gli1P47806 Kctd18-210ENSMUST00000164963 2114 ntTSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Gli1P47806 Gm23363-201ENSMUST00000175024 79 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
Gli1P47806 Gm5441-202ENSMUST00000190132 449 ntTSL 2 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Gli1P47806 AC160029.2-201ENSMUST00000218285 548 ntTSL 3 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Gli1P47806 Ddit3-201ENSMUST00000026475 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Gli1P47806 Ctrc-201ENSMUST00000037059 951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Gli1P47806 Olfr1346-201ENSMUST00000056144 1051 ntAPPRIS P1 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Gli1P47806 Gm16958-201ENSMUST00000180603 1765 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Gli1P47806 Fmo2-202ENSMUST00000111510 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Gli1P47806 Sik2-205ENSMUST00000176663 4107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Gli1P47806 Kcnb1-204ENSMUST00000207917 11153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Gli1P47806 Mrap2-201ENSMUST00000049457 1931 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.91□□□□□ -0.5
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