Protein–RNA interactions for Protein: P40338

Vhl, von Hippel-Lindau disease tumor suppressor, mousemouse

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Length 181 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VhlP40338 Vsig10l-201ENSMUST00000107977 3836 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
VhlP40338 Rhox2b-201ENSMUST00000115191 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
VhlP40338 Gm12203-201ENSMUST00000118235 598 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
VhlP40338 Gm13369-201ENSMUST00000119442 987 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
VhlP40338 Gm11803-201ENSMUST00000119966 444 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
VhlP40338 Mrps17-205ENSMUST00000119985 859 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.01□□□□□ -0.81
VhlP40338 Gm12209-201ENSMUST00000120089 596 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
VhlP40338 Gm9083-201ENSMUST00000120423 819 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
VhlP40338 Gm11754-201ENSMUST00000156576 661 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
VhlP40338 Gm8810-201ENSMUST00000172895 754 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
VhlP40338 Gm8018-201ENSMUST00000173536 789 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
VhlP40338 Gm28911-201ENSMUST00000188837 117 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
VhlP40338 Gm18304-201ENSMUST00000189162 546 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
VhlP40338 Gm8515-201ENSMUST00000194852 576 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
VhlP40338 Gm18018-201ENSMUST00000198273 408 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
VhlP40338 Gm44958-201ENSMUST00000203734 736 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
VhlP40338 Phgr1-201ENSMUST00000061360 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
VhlP40338 Hist1h2ah-201ENSMUST00000091742 405 ntAPPRIS P1 BASIC10.01□□□□□ -0.81
VhlP40338 Alox5-202ENSMUST00000164547 1854 ntTSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
VhlP40338 Mpp4-204ENSMUST00000186477 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
VhlP40338 Spred2-201ENSMUST00000093298 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
VhlP40338 Susd5-201ENSMUST00000135338 4083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
VhlP40338 Lrrn1-201ENSMUST00000049285 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
VhlP40338 F730043M19Rik-204ENSMUST00000148740 3312 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
VhlP40338 Kctd10-202ENSMUST00000102581 3103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
VhlP40338 Gm43102-201ENSMUST00000201004 2324 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
VhlP40338 4921522P10Rik-201ENSMUST00000048606 2101 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
VhlP40338 Celf2-205ENSMUST00000114927 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
VhlP40338 Gm45677-201ENSMUST00000209975 1341 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
VhlP40338 Matn2-202ENSMUST00000163455 3577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
VhlP40338 Sorbs1-203ENSMUST00000165212 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
VhlP40338 Trip4-201ENSMUST00000117083 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
VhlP40338 Hk3-203ENSMUST00000126234 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
VhlP40338 Brap-202ENSMUST00000111765 3861 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
VhlP40338 Txndc5-204ENSMUST00000162075 2619 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
VhlP40338 Madd-207ENSMUST00000111369 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
VhlP40338 Exd1-201ENSMUST00000060009 6042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
VhlP40338 Hyal3-202ENSMUST00000148440 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
VhlP40338 Psmb9-204ENSMUST00000174576 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
VhlP40338 Itfg2-206ENSMUST00000203374 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
VhlP40338 Btbd9-201ENSMUST00000079924 6657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
VhlP40338 Cchcr1-205ENSMUST00000173903 3054 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
VhlP40338 Rcor3-201ENSMUST00000073279 3748 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
VhlP40338 Gripap1-202ENSMUST00000101694 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
VhlP40338 AC138329.2-201ENSMUST00000225579 1842 ntBASIC10□□□□□ -0.81
VhlP40338 Mybl1-202ENSMUST00000115468 2493 ntTSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
VhlP40338 Slc38a11-201ENSMUST00000112420 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
VhlP40338 Gm13075-202ENSMUST00000149247 1621 ntTSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
VhlP40338 Retsat-205ENSMUST00000176364 1647 ntTSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
VhlP40338 Plin4-201ENSMUST00000002908 5755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
VhlP40338 A430108G06Rik-201ENSMUST00000153461 1428 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
VhlP40338 Arhgap20-204ENSMUST00000130405 3881 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
VhlP40338 Mbnl2-208ENSMUST00000227594 2334 ntAPPRIS P1 BASIC10□□□□□ -0.81
VhlP40338 Tram1l1-201ENSMUST00000058994 3889 ntAPPRIS P1 BASIC10□□□□□ -0.81
VhlP40338 Hoxa9-201ENSMUST00000048680 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
VhlP40338 Mob1a-201ENSMUST00000038658 4119 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
VhlP40338 1700110I01Rik-201ENSMUST00000112775 1671 ntTSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
VhlP40338 Lman1l-202ENSMUST00000093832 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
VhlP40338 Gm2128-201ENSMUST00000108009 2560 ntBASIC10□□□□□ -0.81
VhlP40338 Hdc-201ENSMUST00000028838 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
VhlP40338 Ntpcr-202ENSMUST00000065135 1497 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
VhlP40338 Fosb-203ENSMUST00000207716 3546 ntTSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
VhlP40338 AI314180-202ENSMUST00000102889 7045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
VhlP40338 Apold1-201ENSMUST00000167323 3567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10□□□□□ -0.81
VhlP40338 Fam206a-201ENSMUST00000045368 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
VhlP40338 Gm11597-201ENSMUST00000121423 964 ntBASIC10□□□□□ -0.81
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VhlP40338 Stk19-ps1-201ENSMUST00000174597 517 ntBASIC10□□□□□ -0.81
VhlP40338 Gm20652-201ENSMUST00000177314 383 ntTSL 2 BASIC10□□□□□ -0.81
VhlP40338 2610306M01Rik-201ENSMUST00000185414 1042 ntBASIC10□□□□□ -0.81
VhlP40338 Gm6745-201ENSMUST00000199216 526 ntBASIC10□□□□□ -0.81
VhlP40338 Il13-201ENSMUST00000020650 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
VhlP40338 Gm45338-203ENSMUST00000210371 1009 ntTSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
VhlP40338 Gm32926-201ENSMUST00000214043 681 ntTSL 3 BASIC10□□□□□ -0.81
VhlP40338 Gm45930-201ENSMUST00000221330 292 ntBASIC10□□□□□ -0.81
VhlP40338 Ndufa4l2-201ENSMUST00000035735 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
VhlP40338 H1foo-201ENSMUST00000037831 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
VhlP40338 Il25-201ENSMUST00000037863 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
VhlP40338 Olfr91-201ENSMUST00000087144 939 ntAPPRIS P1 BASIC10□□□□□ -0.81
VhlP40338 Rabep2-202ENSMUST00000106407 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
VhlP40338 CT010488.1-201ENSMUST00000214890 1522 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
VhlP40338 Fbxw17-201ENSMUST00000046974 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
VhlP40338 Corin-202ENSMUST00000167460 4639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
VhlP40338 Ttc3-202ENSMUST00000119131 3212 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
VhlP40338 Adipor2-202ENSMUST00000169744 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
VhlP40338 Gm16083-201ENSMUST00000125681 2547 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
VhlP40338 Dusp13-202ENSMUST00000119866 1342 ntTSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
VhlP40338 Ninj1-202ENSMUST00000120733 1321 ntTSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
VhlP40338 Polr1b-201ENSMUST00000028874 2769 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
VhlP40338 AC126257.2-201ENSMUST00000215507 2300 ntBASIC10□□□□□ -0.81
VhlP40338 Ipo13-201ENSMUST00000036156 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
VhlP40338 Etfrf1-205ENSMUST00000111724 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
VhlP40338 Gsdme-205ENSMUST00000170142 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
VhlP40338 4833422M21Rik-202ENSMUST00000181252 2410 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
VhlP40338 Gm5912-201ENSMUST00000122282 1438 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
VhlP40338 Prss47-204ENSMUST00000222769 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
VhlP40338 Cep128-210ENSMUST00000141429 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
VhlP40338 Eif5-213ENSMUST00000222388 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
VhlP40338 Zmiz1-208ENSMUST00000162645 7482 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
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