Protein–RNA interactions for Protein: P38585

Ttl, Tubulin--tyrosine ligase, mousemouse

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Length 377 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TtlP38585 4930562F07Rik-201ENSMUST00000028061 830 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
TtlP38585 Crat-201ENSMUST00000028207 3833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
TtlP38585 Morn3-201ENSMUST00000031437 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
TtlP38585 Fuk-201ENSMUST00000041382 3838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
TtlP38585 Zdhhc12-201ENSMUST00000081838 1187 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
TtlP38585 Rgs12-207ENSMUST00000114285 2924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
TtlP38585 Stk10-201ENSMUST00000102821 5026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
TtlP38585 Clspn-201ENSMUST00000048391 5027 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
TtlP38585 Kcnip4-207ENSMUST00000176191 2116 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
TtlP38585 Slurp1-202ENSMUST00000190433 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
TtlP38585 Wdr53-201ENSMUST00000023474 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
TtlP38585 Chpf2-202ENSMUST00000121863 3715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
TtlP38585 Nrg1-201ENSMUST00000073884 2452 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
TtlP38585 Fli1-201ENSMUST00000016231 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
TtlP38585 Eno3-206ENSMUST00000170716 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
TtlP38585 Tfe3-204ENSMUST00000115677 2943 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
TtlP38585 Zfp862-ps-201ENSMUST00000203457 3282 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
TtlP38585 Fam110a-203ENSMUST00000109864 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
TtlP38585 Vamp1-203ENSMUST00000100942 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
TtlP38585 Gm14243-201ENSMUST00000131401 2172 ntTSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
TtlP38585 5930430L01Rik-201ENSMUST00000145042 3994 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
TtlP38585 Spred2-201ENSMUST00000093298 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
TtlP38585 Cend1-203ENSMUST00000137488 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
TtlP38585 Cr1l-201ENSMUST00000075451 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
TtlP38585 Pianp-206ENSMUST00000162000 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
TtlP38585 Lrrc18-204ENSMUST00000120951 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
TtlP38585 Slc29a1-204ENSMUST00000163492 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
TtlP38585 Atp6v0a1-210ENSMUST00000168757 3967 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
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TtlP38585 Trim56-201ENSMUST00000054384 9279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
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TtlP38585 Fthl17d-201ENSMUST00000105004 856 ntAPPRIS P1 BASIC11.62□□□□□ -0.55
TtlP38585 Park7-202ENSMUST00000105673 919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
TtlP38585 Pla2g10-202ENSMUST00000115807 964 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
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TtlP38585 Gm12298-201ENSMUST00000126999 731 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
TtlP38585 Fez1-208ENSMUST00000163816 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
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TtlP38585 1700040D17Rik-201ENSMUST00000181305 998 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
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TtlP38585 1700113H08Rik-202ENSMUST00000189456 974 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
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TtlP38585 AC144543.1-201ENSMUST00000221840 1064 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
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TtlP38585 Tsc22d4-201ENSMUST00000031738 1043 ntTSL 3 BASIC11.62□□□□□ -0.55
TtlP38585 Itln1-201ENSMUST00000043094 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
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TtlP38585 Rnu1b6-201ENSMUST00000083839 166 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
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TtlP38585 Srr-203ENSMUST00000108448 3239 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
TtlP38585 Lynx1-201ENSMUST00000023259 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
TtlP38585 Acvr1c-201ENSMUST00000028178 9162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
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TtlP38585 Bmp3-201ENSMUST00000031278 6548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
TtlP38585 Bahcc1-202ENSMUST00000118987 10712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
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TtlP38585 Synpo-211ENSMUST00000155195 4442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
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TtlP38585 Picalm-213ENSMUST00000208742 3361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
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TtlP38585 Rmi1-201ENSMUST00000042450 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
TtlP38585 Steap3-204ENSMUST00000112643 2873 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
TtlP38585 Wfdc8-201ENSMUST00000094351 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
TtlP38585 Mtr-201ENSMUST00000099856 8294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
TtlP38585 Fgd3-203ENSMUST00000110087 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
TtlP38585 H3f3a-205ENSMUST00000161308 2841 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
TtlP38585 Calcoco1-201ENSMUST00000023818 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
TtlP38585 Pcsk7-209ENSMUST00000216672 3599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
TtlP38585 Bmp7-201ENSMUST00000009143 3670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
TtlP38585 Tmeff2-201ENSMUST00000081851 3343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
TtlP38585 Ddx55-201ENSMUST00000071057 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
TtlP38585 Ctif-201ENSMUST00000165559 6173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
TtlP38585 Myo9b-202ENSMUST00000168839 7102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
TtlP38585 Rpl3-ps1-201ENSMUST00000120557 1210 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
TtlP38585 Gm14832-201ENSMUST00000121289 322 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
TtlP38585 Gm15547-201ENSMUST00000122152 333 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
TtlP38585 Rab11fip4os2-201ENSMUST00000123067 689 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
TtlP38585 Mogat1-201ENSMUST00000012331 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
TtlP38585 Gm11961-202ENSMUST00000141157 760 ntTSL 3 BASIC11.61□□□□□ -0.55
TtlP38585 Egfl7-209ENSMUST00000150404 892 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
TtlP38585 Crb3-205ENSMUST00000169543 778 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.61□□□□□ -0.55
TtlP38585 Stard10-207ENSMUST00000173270 670 ntTSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
TtlP38585 Anapc16-205ENSMUST00000182912 566 ntTSL 2 BASIC11.61□□□□□ -0.55
TtlP38585 Gm27390-201ENSMUST00000184516 176 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.7 ms