Protein–RNA interactions for Protein: P31313

Hoxc11, Homeobox protein Hox-C11, mousemouse

Predictions only

Length 304 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxc11P31313 Mrpl45-201ENSMUST00000019026 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Hoxc11P31313 Itga3-203ENSMUST00000120375 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Hoxc11P31313 Mcph1-201ENSMUST00000039412 4662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Hoxc11P31313 Sept10-201ENSMUST00000165971 2532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Hoxc11P31313 Slc38a11-201ENSMUST00000112420 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Hoxc11P31313 Rai1-202ENSMUST00000090806 7217 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Hoxc11P31313 Eif5-212ENSMUST00000222375 3547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Hoxc11P31313 Eif5-213ENSMUST00000222388 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Hoxc11P31313 Irak2-201ENSMUST00000059286 3196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Hoxc11P31313 Mdh1b-201ENSMUST00000114094 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Hoxc11P31313 Fthl17d-201ENSMUST00000105004 856 ntAPPRIS P1 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Hoxc11P31313 Gm6890-201ENSMUST00000114117 776 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Hoxc11P31313 Gm14208-201ENSMUST00000119645 678 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Hoxc11P31313 Gm6963-201ENSMUST00000147879 379 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Hoxc11P31313 Gm16099-202ENSMUST00000151873 660 ntTSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Hoxc11P31313 Spata3-211ENSMUST00000159876 760 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Hoxc11P31313 Nat8f1-201ENSMUST00000161198 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Hoxc11P31313 Gm28192-201ENSMUST00000189381 778 ntTSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Hoxc11P31313 Gm28172-201ENSMUST00000189880 506 ntTSL 3 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Hoxc11P31313 Gm32999-201ENSMUST00000192693 562 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Hoxc11P31313 Polr2i-201ENSMUST00000019882 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Hoxc11P31313 Gm36503-201ENSMUST00000204284 875 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Hoxc11P31313 Phgdh-ps1-201ENSMUST00000207540 754 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Hoxc11P31313 Gm35082-202ENSMUST00000208164 525 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Hoxc11P31313 Aprt-ps-201ENSMUST00000212311 505 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Hoxc11P31313 Pex11b-201ENSMUST00000048766 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Hoxc11P31313 2410015M20Rik-201ENSMUST00000052832 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Hoxc11P31313 Gm8385-201ENSMUST00000058999 643 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Hoxc11P31313 Adm2-201ENSMUST00000066991 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Hoxc11P31313 Taar7e-201ENSMUST00000092656 1077 ntAPPRIS P1 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Hoxc11P31313 Trp53-202ENSMUST00000108657 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Hoxc11P31313 Tcf4-234ENSMUST00000201410 1915 ntTSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Hoxc11P31313 Tcf4-243ENSMUST00000202057 1941 ntTSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Hoxc11P31313 Tnfrsf13b-201ENSMUST00000010286 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Hoxc11P31313 Pou2f1-209ENSMUST00000160908 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Hoxc11P31313 Alg14-201ENSMUST00000039442 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Hoxc11P31313 Eno3-206ENSMUST00000170716 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Hoxc11P31313 Gm2694-202ENSMUST00000180806 1452 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Hoxc11P31313 Pxn-202ENSMUST00000086523 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Hoxc11P31313 Cluh-201ENSMUST00000092915 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Hoxc11P31313 Pafah2-201ENSMUST00000105869 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Hoxc11P31313 Gm3693-201ENSMUST00000182077 2865 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Hoxc11P31313 Dcaf11-203ENSMUST00000117701 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Hoxc11P31313 Gm11696-203ENSMUST00000188296 1793 ntTSL 3 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Hoxc11P31313 Ccrl2-203ENSMUST00000199839 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Hoxc11P31313 Mon1b-202ENSMUST00000179926 3470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Hoxc11P31313 Ppp1r18-202ENSMUST00000122899 2743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Hoxc11P31313 Esrp1-204ENSMUST00000108313 3696 ntTSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Hoxc11P31313 Mmab-201ENSMUST00000031560 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Hoxc11P31313 Rnf6-201ENSMUST00000067837 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Hoxc11P31313 Mapk8-204ENSMUST00000111944 1528 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Hoxc11P31313 Lexm-204ENSMUST00000189032 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Hoxc11P31313 Rcor3-201ENSMUST00000073279 3748 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Hoxc11P31313 AC122197.2-201ENSMUST00000219196 1635 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Hoxc11P31313 Ippk-201ENSMUST00000021817 2856 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Hoxc11P31313 Mrgprg-201ENSMUST00000058092 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Hoxc11P31313 Vldlr-207ENSMUST00000167487 7971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Hoxc11P31313 Fen1-202ENSMUST00000116542 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Hoxc11P31313 March7-203ENSMUST00000102748 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Hoxc11P31313 Sf1-208ENSMUST00000131252 4353 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Hoxc11P31313 Ahdc1-201ENSMUST00000044521 6105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Hoxc11P31313 Zscan22-201ENSMUST00000055528 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Hoxc11P31313 9430021M05Rik-201ENSMUST00000145985 1201 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Hoxc11P31313 Gm16339-201ENSMUST00000160954 929 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Hoxc11P31313 Acsm5-207ENSMUST00000207813 1084 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Hoxc11P31313 Gm8913-201ENSMUST00000209491 641 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Hoxc11P31313 Gm45598-202ENSMUST00000210719 986 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Hoxc11P31313 4930562F07Rik-201ENSMUST00000028061 830 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Hoxc11P31313 Prorsd1-201ENSMUST00000039900 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Hoxc11P31313 Dnmt3l-201ENSMUST00000000746 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Hoxc11P31313 Gimap5-201ENSMUST00000055558 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Hoxc11P31313 Tcf4-230ENSMUST00000201205 2270 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Hoxc11P31313 Ralgps2-207ENSMUST00000188656 2481 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Hoxc11P31313 Copb2-201ENSMUST00000035033 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Hoxc11P31313 Bdp1-201ENSMUST00000038104 9921 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Hoxc11P31313 Zfp526-201ENSMUST00000055604 3380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Hoxc11P31313 Axl-202ENSMUST00000085948 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Hoxc11P31313 Tnn-202ENSMUST00000131919 3987 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Hoxc11P31313 Vps4b-202ENSMUST00000112736 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Hoxc11P31313 Qrich1-201ENSMUST00000006851 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Hoxc11P31313 Smtn-204ENSMUST00000110011 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Hoxc11P31313 Tmem129-201ENSMUST00000019439 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Hoxc11P31313 Gng5-202ENSMUST00000118280 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Hoxc11P31313 Rps6ka6-210ENSMUST00000137712 2410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Hoxc11P31313 Gm43365-201ENSMUST00000196522 2106 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Hoxc11P31313 Gm33543-203ENSMUST00000211096 1722 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Hoxc11P31313 Serpinb12-202ENSMUST00000112724 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Hoxc11P31313 Gfod2-201ENSMUST00000013294 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Hoxc11P31313 Vsx2-201ENSMUST00000021665 3270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Hoxc11P31313 Gipr-201ENSMUST00000094790 2856 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Hoxc11P31313 Ptpn2-203ENSMUST00000122412 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Hoxc11P31313 Nr3c1-203ENSMUST00000115567 6436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Hoxc11P31313 Ripk3-201ENSMUST00000022830 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Hoxc11P31313 Cluap1-201ENSMUST00000040881 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Hoxc11P31313 Vapb-201ENSMUST00000067530 7029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Hoxc11P31313 Cdk10-212ENSMUST00000213005 1580 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Hoxc11P31313 Cyp4f39-201ENSMUST00000003413 1599 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Hoxc11P31313 Entpd4-206ENSMUST00000184973 3589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Hoxc11P31313 Entpd4b-204ENSMUST00000185072 3589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Hoxc11P31313 Kdelr1-205ENSMUST00000211716 1350 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 65.9 ms