Protein–RNA interactions for Protein: P31041

Cd28, T-cell-specific surface glycoprotein CD28, mousemouse

Predictions only

Length 218 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cd28P31041 4930550C17Rik-201ENSMUST00000181629 1411 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Cd28P31041 Gm7537-201ENSMUST00000221660 1414 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
Cd28P31041 Lclat1-201ENSMUST00000067545 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Cd28P31041 Tbl2-204ENSMUST00000153183 7488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Cd28P31041 Rnaseh2a-210ENSMUST00000147812 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Cd28P31041 Pde4c-207ENSMUST00000224874 3099 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Cd28P31041 Col9a1-202ENSMUST00000088349 3059 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Cd28P31041 Rgr-203ENSMUST00000225070 4704 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
Cd28P31041 Gm26615-201ENSMUST00000181522 3201 ntTSL 2 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Cd28P31041 BC030500-201ENSMUST00000062978 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Cd28P31041 E430018J23Rik-203ENSMUST00000165495 3324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Cd28P31041 Aldoc-202ENSMUST00000102478 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Cd28P31041 Lhfpl1-201ENSMUST00000040084 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Cd28P31041 Wdr82-201ENSMUST00000020490 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Cd28P31041 Madd-208ENSMUST00000111370 5879 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Cd28P31041 Madd-214ENSMUST00000111381 5873 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Cd28P31041 Phka2-203ENSMUST00000112377 3947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Cd28P31041 Slc29a1-213ENSMUST00000167692 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Cd28P31041 Gm43720-201ENSMUST00000159067 6411 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Cd28P31041 Mrps17-206ENSMUST00000121339 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Cd28P31041 Myzap-201ENSMUST00000093823 2283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Cd28P31041 Mlc1-201ENSMUST00000042594 2783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Cd28P31041 H3f3a-205ENSMUST00000161308 2841 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Cd28P31041 Cbl-211ENSMUST00000206720 11372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Cd28P31041 Grhl1-202ENSMUST00000085553 3469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Cd28P31041 Epb41l3-202ENSMUST00000112680 4073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Cd28P31041 L1cam-202ENSMUST00000102871 5113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Cd28P31041 Klk6-203ENSMUST00000107968 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Cd28P31041 Gm13612-201ENSMUST00000119276 390 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
Cd28P31041 Gm2231-201ENSMUST00000125661 612 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
Cd28P31041 Gm13293-201ENSMUST00000131188 1615 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Cd28P31041 Pam16-201ENSMUST00000014445 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Cd28P31041 Pmepa1os-201ENSMUST00000150185 680 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Cd28P31041 Mob4-205ENSMUST00000162364 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Cd28P31041 Pde4b-210ENSMUST00000172616 823 ntTSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Cd28P31041 Cpsf4l-205ENSMUST00000173655 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Cd28P31041 Gm17344-202ENSMUST00000173980 621 ntTSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Cd28P31041 Pou5f2-201ENSMUST00000175955 1394 ntAPPRIS P1 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Cd28P31041 Tmem205-202ENSMUST00000178988 862 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Cd28P31041 Fhl2-202ENSMUST00000185893 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Cd28P31041 Pcdhga6-201ENSMUST00000195823 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Cd28P31041 Gm43763-201ENSMUST00000201761 683 ntTSL 3 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Cd28P31041 Gm45233-201ENSMUST00000203633 898 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Cd28P31041 Gm8463-201ENSMUST00000208573 613 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
Cd28P31041 Ippk-201ENSMUST00000021817 2856 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Cd28P31041 Gm4129-201ENSMUST00000220083 625 ntTSL 3 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Cd28P31041 Dusp6-204ENSMUST00000220291 2359 ntTSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Cd28P31041 Mlana-201ENSMUST00000025719 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Cd28P31041 Timm10-201ENSMUST00000028470 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Cd28P31041 Mdk-201ENSMUST00000028672 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Cd28P31041 Ngf-201ENSMUST00000035952 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Cd28P31041 Gm5884-201ENSMUST00000036712 1479 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
Cd28P31041 Lin37-201ENSMUST00000043975 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Cd28P31041 Cyb5d1-201ENSMUST00000051620 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Cd28P31041 Gm24526-201ENSMUST00000082921 158 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
Cd28P31041 Rbms2-201ENSMUST00000092033 1481 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Cd28P31041 Tldc2-201ENSMUST00000099140 608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Cd28P31041 Ccdc58-201ENSMUST00000099937 747 ntTSL 3 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Cd28P31041 Nfia-202ENSMUST00000075448 9526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
Cd28P31041 Srrm2-201ENSMUST00000088621 8564 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
Cd28P31041 Slc9a3-203ENSMUST00000221703 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.7
Cd28P31041 Emp1-202ENSMUST00000111907 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
Cd28P31041 Sash3-201ENSMUST00000033427 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
Cd28P31041 Mark3-208ENSMUST00000221753 2394 ntTSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Cd28P31041 Klhl6-201ENSMUST00000058839 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Cd28P31041 Fcer2a-201ENSMUST00000005678 2242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Cd28P31041 Tef-202ENSMUST00000109553 4401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Cd28P31041 Fen1-202ENSMUST00000116542 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Cd28P31041 Serpinh1-203ENSMUST00000207849 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Cd28P31041 Gm26685-201ENSMUST00000181831 2023 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Cd28P31041 Acsl6-202ENSMUST00000064690 1988 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Cd28P31041 Fam172a-201ENSMUST00000091459 3892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Cd28P31041 Ctsd-201ENSMUST00000066401 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Cd28P31041 Herpud1-201ENSMUST00000034220 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Cd28P31041 Npr2-201ENSMUST00000030191 3660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Cd28P31041 Trim34b-201ENSMUST00000106847 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Cd28P31041 Maml3-202ENSMUST00000121440 8288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Cd28P31041 Gm15897-201ENSMUST00000117770 1486 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Cd28P31041 Gripap1-202ENSMUST00000101694 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Cd28P31041 Slurp1-202ENSMUST00000190433 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Cd28P31041 Tmem80-204ENSMUST00000128906 1387 ntTSL 2 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Cd28P31041 Klhl14-201ENSMUST00000049105 4018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Cd28P31041 Slc5a8-201ENSMUST00000020255 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Cd28P31041 Pmaip1-201ENSMUST00000025399 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Cd28P31041 Arpc3-203ENSMUST00000111713 708 ntTSL 3 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Cd28P31041 Ppil3-202ENSMUST00000114345 1175 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Cd28P31041 Gm8213-201ENSMUST00000118191 441 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Cd28P31041 Hagh-202ENSMUST00000118788 1191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Cd28P31041 Gm13376-201ENSMUST00000128743 448 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Cd28P31041 Cabp2-202ENSMUST00000159556 781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Cd28P31041 Prss55-203ENSMUST00000171503 1074 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Cd28P31041 1700092C10Rik-201ENSMUST00000172547 585 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Cd28P31041 1190007I07Rik-205ENSMUST00000185168 469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Cd28P31041 Lrcol1-202ENSMUST00000185691 764 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Cd28P31041 4930449I04Rik-201ENSMUST00000198191 1123 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Cd28P31041 1700127F24Rik-201ENSMUST00000221685 604 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Cd28P31041 Otud6a-201ENSMUST00000060241 873 ntAPPRIS P1 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Cd28P31041 Ints6l-207ENSMUST00000186445 3608 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Cd28P31041 Ipo13-201ENSMUST00000036156 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Cd28P31041 Tirap-203ENSMUST00000176531 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
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