Protein–RNA interactions for Protein: P28309

Defa2, Alpha-defensin 2, mousemouse

Predictions only

Length 93 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Defa2P28309 Rph3a-201ENSMUST00000079204 4150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
Defa2P28309 Pkig-203ENSMUST00000109400 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
Defa2P28309 Timm10-202ENSMUST00000111631 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC8.85□□□□□ -0.99
Defa2P28309 Gm12363-201ENSMUST00000122250 668 ntBASIC8.85□□□□□ -0.99
Defa2P28309 4930579D09Rik-201ENSMUST00000132321 469 ntTSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
Defa2P28309 Pigyl-202ENSMUST00000148088 676 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.85□□□□□ -0.99
Defa2P28309 Gm12167-201ENSMUST00000148132 578 ntTSL 2 BASIC8.85□□□□□ -0.99
Defa2P28309 Gm27206-201ENSMUST00000154038 979 ntTSL 5 BASIC8.85□□□□□ -0.99
Defa2P28309 Mrps24-205ENSMUST00000154330 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
Defa2P28309 1700037C18Rik-205ENSMUST00000177323 915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.85□□□□□ -0.99
Defa2P28309 1700015O11Rik-201ENSMUST00000180964 678 ntTSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
Defa2P28309 Gm26927-201ENSMUST00000182385 965 ntBASIC8.85□□□□□ -0.99
Defa2P28309 Gm31651-201ENSMUST00000198864 560 ntTSL 3 BASIC8.85□□□□□ -0.99
Defa2P28309 Svip-203ENSMUST00000209193 487 ntTSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
Defa2P28309 AC154595.3-201ENSMUST00000224579 384 ntBASIC8.85□□□□□ -0.99
Defa2P28309 4930447A16Rik-201ENSMUST00000022897 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
Defa2P28309 Majin-201ENSMUST00000025699 1239 ntTSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
Defa2P28309 Olfr983-201ENSMUST00000050996 1050 ntTSL 2 BASIC8.85□□□□□ -0.99
Defa2P28309 Gemin7-201ENSMUST00000051364 763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
Defa2P28309 Snora73a-201ENSMUST00000082453 205 ntBASIC8.85□□□□□ -0.99
Defa2P28309 Zfp251-201ENSMUST00000080406 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
Defa2P28309 Unkl-204ENSMUST00000160896 4787 ntTSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
Defa2P28309 Hnrnpf-210ENSMUST00000180341 1922 ntAPPRIS P1 BASIC8.85□□□□□ -0.99
Defa2P28309 Bin2-205ENSMUST00000182814 1901 ntTSL 5 BASIC8.85□□□□□ -0.99
Defa2P28309 Dnajb6-201ENSMUST00000008733 2918 ntTSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
Defa2P28309 Umod-206ENSMUST00000209095 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
Defa2P28309 Lmntd2-201ENSMUST00000026573 2095 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
Defa2P28309 Pcdhga7-201ENSMUST00000192511 4730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
Defa2P28309 Lef1-204ENSMUST00000106341 3357 ntTSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
Defa2P28309 Lef1-202ENSMUST00000066849 3398 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC8.85□□□□□ -0.99
Defa2P28309 Gm5936-201ENSMUST00000114116 2857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC8.85□□□□□ -0.99
Defa2P28309 Gm5640-201ENSMUST00000114119 2861 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC8.85□□□□□ -0.99
Defa2P28309 DXBay18-201ENSMUST00000080324 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
Defa2P28309 Gm14685-201ENSMUST00000088459 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
Defa2P28309 Ccdc126-202ENSMUST00000114491 2372 ntTSL 5 BASIC8.85□□□□□ -0.99
Defa2P28309 Smc4-201ENSMUST00000042901 4316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
Defa2P28309 Trim26-205ENSMUST00000130367 3187 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC8.85□□□□□ -0.99
Defa2P28309 Mamld1-201ENSMUST00000082088 4796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC8.85□□□□□ -0.99
Defa2P28309 Son-204ENSMUST00000119368 7529 ntTSL 5 BASIC8.85□□□□□ -0.99
Defa2P28309 Fads1-201ENSMUST00000010807 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
Defa2P28309 Cd163l1-201ENSMUST00000084460 3454 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC8.85□□□□□ -0.99
Defa2P28309 Gcdh-201ENSMUST00000003907 2167 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
Defa2P28309 Adgrl3-214ENSMUST00000120445 5230 ntTSL 5 BASIC8.85□□□□□ -0.99
Defa2P28309 Neurog3-201ENSMUST00000050103 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
Defa2P28309 Matr3-206ENSMUST00000187389 3107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.85□□□□□ -0.99
Defa2P28309 5830462O15Rik-201ENSMUST00000214603 1655 ntBASIC8.85□□□□□ -0.99
Defa2P28309 Nhsl1-202ENSMUST00000100054 6795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.85□□□□□ -0.99
Defa2P28309 Glrx3-203ENSMUST00000211496 3440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
Defa2P28309 Zfp112-204ENSMUST00000215113 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.84□□□□□ -0.99
Defa2P28309 Sirt2-202ENSMUST00000122915 1828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
Defa2P28309 Pla2g4b-201ENSMUST00000126150 2790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.84□□□□□ -0.99
Defa2P28309 Syt2-204ENSMUST00000188842 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
Defa2P28309 Tmx2-203ENSMUST00000111665 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
Defa2P28309 Kat6b-204ENSMUST00000182405 6977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
Defa2P28309 Usp45-201ENSMUST00000040429 5861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
Defa2P28309 Vps29-208ENSMUST00000155671 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
Defa2P28309 Acot7-202ENSMUST00000075363 1457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
Defa2P28309 Eif5a2-201ENSMUST00000060500 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
Defa2P28309 Wwox-203ENSMUST00000109108 1771 ntTSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
Defa2P28309 Hlf-201ENSMUST00000004051 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
Defa2P28309 Ormdl1-201ENSMUST00000027266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
Defa2P28309 Kcna10-201ENSMUST00000055064 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
Defa2P28309 Ptgr2-207ENSMUST00000146377 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
Defa2P28309 Calcr-203ENSMUST00000168592 2064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.84□□□□□ -0.99
Defa2P28309 Pde4d-220ENSMUST00000177907 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
Defa2P28309 Mfsd4b5-203ENSMUST00000164566 2372 ntTSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
Defa2P28309 Rbm39-203ENSMUST00000109587 2810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
Defa2P28309 Pcdhb2-201ENSMUST00000056522 2813 ntAPPRIS P1 BASIC8.84□□□□□ -0.99
Defa2P28309 Cdh15-201ENSMUST00000034443 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
Defa2P28309 Nup88-203ENSMUST00000108531 2453 ntTSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
Defa2P28309 Uqcc1-203ENSMUST00000109632 2313 ntTSL 5 BASIC8.84□□□□□ -0.99
Defa2P28309 Rpgrip1-201ENSMUST00000111600 4565 ntTSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
Defa2P28309 Scrn3-202ENSMUST00000112050 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
Defa2P28309 Cdkn1a-202ENSMUST00000119901 748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.84□□□□□ -0.99
Defa2P28309 Gm11978-201ENSMUST00000122315 466 ntBASIC8.84□□□□□ -0.99
Defa2P28309 Myadml2os-201ENSMUST00000126642 1044 ntTSL 5 BASIC8.84□□□□□ -0.99
Defa2P28309 Cerk-203ENSMUST00000156546 2162 ntTSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
Defa2P28309 Lta4h-201ENSMUST00000016033 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
Defa2P28309 Agtpbp1-213ENSMUST00000167096 508 ntTSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
Defa2P28309 Fbxo44-208ENSMUST00000167160 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.84□□□□□ -0.99
Defa2P28309 Gtf2i-219ENSMUST00000174155 4141 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC8.84□□□□□ -0.99
Defa2P28309 Rbm4-206ENSMUST00000180248 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
Defa2P28309 Hmgcll1-207ENSMUST00000183979 1136 ntTSL 5 BASIC8.84□□□□□ -0.99
Defa2P28309 Mir7221-201ENSMUST00000184009 72 ntBASIC8.84□□□□□ -0.99
Defa2P28309 Gm38297-201ENSMUST00000195122 1057 ntBASIC8.84□□□□□ -0.99
Defa2P28309 Gm20083-202ENSMUST00000206663 1008 ntTSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
Defa2P28309 Gm18054-201ENSMUST00000207539 555 ntBASIC8.84□□□□□ -0.99
Defa2P28309 B230209E15Rik-201ENSMUST00000209115 1597 ntTSL 5 BASIC8.84□□□□□ -0.99
Defa2P28309 Gm17823-201ENSMUST00000217830 1006 ntBASIC8.84□□□□□ -0.99
Defa2P28309 Gm19309-201ENSMUST00000218295 205 ntBASIC8.84□□□□□ -0.99
Defa2P28309 Gm18636-201ENSMUST00000218846 1066 ntBASIC8.84□□□□□ -0.99
Defa2P28309 Ormdl2-204ENSMUST00000219524 724 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.84□□□□□ -0.99
Defa2P28309 Scgb3a2-201ENSMUST00000043803 842 ntTSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
Defa2P28309 Lim2-201ENSMUST00000004732 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
Defa2P28309 Gm8399-201ENSMUST00000082300 1117 ntBASIC8.84□□□□□ -0.99
Defa2P28309 Olfr707-201ENSMUST00000088687 924 ntAPPRIS P1 BASIC8.84□□□□□ -0.99
Defa2P28309 Mdk-203ENSMUST00000090602 714 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.84□□□□□ -0.99
Defa2P28309 Olfr1532-ps1-201ENSMUST00000098140 924 ntAPPRIS P1 BASIC8.84□□□□□ -0.99
Defa2P28309 Pdp1-203ENSMUST00000108297 4201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
Defa2P28309 Ttc7-202ENSMUST00000125875 3917 ntTSL 2 BASIC8.84□□□□□ -0.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 66.9 ms