Protein–RNA interactions for Protein: P26339

Chga, Chromogranin-A, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 463 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ChgaP26339 AU019823-205ENSMUST00000171462 3339 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
ChgaP26339 Klhl6-201ENSMUST00000058839 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ChgaP26339 Dlx1as-202ENSMUST00000137251 647 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ChgaP26339 Gm11574-201ENSMUST00000139752 946 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
ChgaP26339 Klk12-201ENSMUST00000014063 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ChgaP26339 Hoxd8-203ENSMUST00000151380 557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
ChgaP26339 Gm22993-201ENSMUST00000175423 254 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
ChgaP26339 Vmn1r206-201ENSMUST00000187140 1135 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
ChgaP26339 Gm38319-201ENSMUST00000194537 1266 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
ChgaP26339 Gm37973-201ENSMUST00000195767 1289 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
ChgaP26339 Gm42912-201ENSMUST00000197195 716 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ChgaP26339 Gm6562-201ENSMUST00000221903 464 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
ChgaP26339 AC238811.3-201ENSMUST00000225422 709 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
ChgaP26339 AC154848.1-201ENSMUST00000225451 846 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
ChgaP26339 Ndufa4l2-201ENSMUST00000035735 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ChgaP26339 Rnps1-202ENSMUST00000115371 1617 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ChgaP26339 Tuba1a-201ENSMUST00000097014 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ChgaP26339 Trub2-201ENSMUST00000048044 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ChgaP26339 Phyhipl-201ENSMUST00000046513 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ChgaP26339 Gm10686-201ENSMUST00000215389 3247 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
ChgaP26339 Hdac7-205ENSMUST00000118294 4069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ChgaP26339 Vps18-201ENSMUST00000037280 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ChgaP26339 Olfr56-202ENSMUST00000102785 1930 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ChgaP26339 Qsox1-201ENSMUST00000035325 3348 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ChgaP26339 Lsp1-205ENSMUST00000105968 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ChgaP26339 Thy1-201ENSMUST00000114840 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
ChgaP26339 Txndc12-201ENSMUST00000030296 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ChgaP26339 Per1-206ENSMUST00000166748 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ChgaP26339 Ddx55-202ENSMUST00000111438 2737 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
ChgaP26339 Arhgap29-201ENSMUST00000037958 5787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ChgaP26339 Alg14-201ENSMUST00000039442 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ChgaP26339 Rnf152-202ENSMUST00000172299 8406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
ChgaP26339 Rit2-203ENSMUST00000153060 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ChgaP26339 Cyp2ab1-205ENSMUST00000182741 1497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
ChgaP26339 Asl-203ENSMUST00000160129 2413 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
ChgaP26339 Cars-201ENSMUST00000010899 3222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ChgaP26339 Gck-201ENSMUST00000102920 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ChgaP26339 Anp32e-204ENSMUST00000168106 2890 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
ChgaP26339 Atp8a1-202ENSMUST00000072971 7154 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ChgaP26339 Gtf2h5-202ENSMUST00000100955 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ChgaP26339 Spcs2-ps-201ENSMUST00000122326 682 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
ChgaP26339 Gm13185-201ENSMUST00000131044 944 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
ChgaP26339 Tnnt1-208ENSMUST00000166161 750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
ChgaP26339 Gm43714-201ENSMUST00000198351 1204 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ChgaP26339 Gm42599-201ENSMUST00000201308 469 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
ChgaP26339 AC158987.1-201ENSMUST00000214586 961 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
ChgaP26339 Gm5035-201ENSMUST00000215581 927 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
ChgaP26339 CT030657.3-201ENSMUST00000222707 1200 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
ChgaP26339 AC154595.1-201ENSMUST00000225533 1059 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
ChgaP26339 Crybb2-201ENSMUST00000031295 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ChgaP26339 mt-Nd3-201ENSMUST00000082411 348 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
ChgaP26339 Vmn1r217-201ENSMUST00000091721 897 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
ChgaP26339 Wdr43-201ENSMUST00000047086 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ChgaP26339 Robo3-201ENSMUST00000034643 4712 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
ChgaP26339 Gm37580-201ENSMUST00000192408 2800 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
ChgaP26339 Siglec1-202ENSMUST00000110226 1861 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ChgaP26339 Gpr139-201ENSMUST00000084650 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ChgaP26339 Ipo13-201ENSMUST00000036156 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ChgaP26339 P2ry1-201ENSMUST00000029331 3886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ChgaP26339 Gtf2i-210ENSMUST00000173341 4302 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ChgaP26339 Srr-201ENSMUST00000065211 3699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ChgaP26339 Tmcc1-210ENSMUST00000204353 2851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ChgaP26339 Inpp4a-203ENSMUST00000114933 3004 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ChgaP26339 Rcor3-202ENSMUST00000110849 3791 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ChgaP26339 C3-201ENSMUST00000024988 5136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ChgaP26339 Mb21d1-202ENSMUST00000070742 4049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
ChgaP26339 Brwd1-202ENSMUST00000099502 8547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
ChgaP26339 Zfp866-202ENSMUST00000137573 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
ChgaP26339 Crispld2-202ENSMUST00000108972 2928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
ChgaP26339 Psd2-205ENSMUST00000176873 4375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
ChgaP26339 Tmem168-206ENSMUST00000149123 3337 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
ChgaP26339 Mog-201ENSMUST00000102665 1704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
ChgaP26339 Coro6-205ENSMUST00000108391 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
ChgaP26339 Abi1-203ENSMUST00000093171 2411 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
ChgaP26339 Vps54-202ENSMUST00000109578 4273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
ChgaP26339 Wisp3-201ENSMUST00000076713 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
ChgaP26339 Rab18-201ENSMUST00000097680 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
ChgaP26339 Gm14399-202ENSMUST00000108929 813 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
ChgaP26339 Unc50-202ENSMUST00000114925 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
ChgaP26339 Mrps10-202ENSMUST00000119841 1113 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
ChgaP26339 Gm28911-201ENSMUST00000188837 117 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
ChgaP26339 Gm37867-201ENSMUST00000192066 1059 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
ChgaP26339 Ccl2-201ENSMUST00000000193 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
ChgaP26339 Pip-202ENSMUST00000203244 736 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
ChgaP26339 AC153506.3-201ENSMUST00000219287 1029 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
ChgaP26339 AC140209.1-201ENSMUST00000227875 284 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
ChgaP26339 Cyct-201ENSMUST00000028430 655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
ChgaP26339 4921522P10Rik-201ENSMUST00000048606 2101 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
ChgaP26339 Lyzl4-201ENSMUST00000077706 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
ChgaP26339 Slc25a48-201ENSMUST00000021971 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
ChgaP26339 Dnmt3l-205ENSMUST00000138785 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
ChgaP26339 Caln1-201ENSMUST00000086029 1801 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
ChgaP26339 Kctd18-202ENSMUST00000114410 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
ChgaP26339 Krt33a-201ENSMUST00000018399 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
ChgaP26339 Gm32036-201ENSMUST00000221484 2638 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
ChgaP26339 Nrde2-201ENSMUST00000021596 3718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
ChgaP26339 Rgs6-204ENSMUST00000185674 1362 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
ChgaP26339 Gm42498-201ENSMUST00000199981 1372 ntBASIC15.21■□□□□ 0.02
ChgaP26339 Hnrnpm-206ENSMUST00000148178 3934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
ChgaP26339 Mcm2-201ENSMUST00000058011 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 92.3 ms